241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_3859 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_3859  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 261 aa  487  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0112179  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  40.62 
 
 		 1186 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0492  transcriptional regulator  36.8 
 
 		 963 aa  93.2  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  36.28 
 
 		 1158 aa  94  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  37.78 
 
 		 965 aa  93.6  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5323  transcriptional regulator, SARP family  40.89 
 
 		 1025 aa  93.2  4e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  33.79 
 
 		 621 aa  92.4  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.73 
 
 		 1042 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0857  transcriptional regulator, SARP family  34.92 
 
 		 1000 aa  90.1  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.198633  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0853  transcriptional regulator, SARP family  34.3 
 
 		 1010 aa  88.6  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  36.29 
 
 		 957 aa  88.2  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0735  ATPase-like protein  35.65 
 
 		 1118 aa  87.4  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0669  SARP family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 622 aa  86.7  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  37.95 
 
 		 1092 aa  86.3  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 654 aa  86.7  4e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  33.33 
 
 		 535 aa  86.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  35.87 
 
 		 1339 aa  86.3  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6503  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 252 aa  85.9  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.287037  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  32.72 
 
 		 621 aa  85.5  7e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  34.32 
 
 		 943 aa  85.5  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.43 
 
 		 1125 aa  85.5  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0207  putative transcriptional regulator  31.82 
 
 		 453 aa  85.1  0.000000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.957987  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  33.48 
 
 		 496 aa  84.7  0.000000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 1058 aa  84.7  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7631  ATPase-like protein  33.19 
 
 		 1123 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.289533  normal  0.197233 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2413  SARP family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 760 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0215803  normal  0.881826 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2412  transcriptional regulator, SARP family  35.09 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0744334 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2801  transcriptional regulator, SARP family  32.03 
 
 		 267 aa  83.6  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000654776  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7741  transcriptional regulator, SARP family  34.22 
 
 		 1013 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0132103  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  35.4 
 
 		 1043 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  34.82 
 
 		 1093 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0385  transcriptional regulator, SARP family  36.44 
 
 		 940 aa  83.2  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 1082 aa  82.8  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  34.21 
 
 		 1102 aa  82.4  0.000000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2636  transcriptional regulator, SARP family  35.71 
 
 		 928 aa  82  0.000000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  35.4 
 
 		 969 aa  81.6  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  35.59 
 
 		 931 aa  82  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1003 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4606  transcriptional regulator  36.55 
 
 		 941 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0568023  normal  0.290469 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0709  transcriptional regulator, SARP family  31.86 
 
 		 379 aa  80.5  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.122417  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  33.95 
 
 		 1017 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  34.8 
 
 		 1055 aa  80.1  0.00000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 282 aa  79.3  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  34.08 
 
 		 1103 aa  79.3  0.00000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  34.08 
 
 		 954 aa  79.3  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0796  transcriptional regulator, SARP family  35.57 
 
 		 1033 aa  79  0.00000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.64254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5827  transcriptional regulator, SARP family  33.95 
 
 		 264 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1461  transcriptional regulator, SARP family  34.78 
 
 		 950 aa  78.2  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.250739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6283  transcriptional regulator, SARP family  32.88 
 
 		 1022 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0065  transcriptional regulator, SARP family  30.74 
 
 		 934 aa  78.2  0.0000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  32.05 
 
 		 388 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3528  transcriptional regulator, winged helix family  33.2 
 
 		 1005 aa  77.4  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.105108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 1048 aa  77.8  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  34.94 
 
 		 1064 aa  77.4  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  33.47 
 
 		 990 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5039  transcriptional regulator, SARP family  34.91 
 
 		 993 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2178  transcriptional activator domain-containing protein  29.57 
 
 		 278 aa  76.6  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  36.7 
 
 		 378 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  34.12 
 
 		 1100 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  35.06 
 
 		 611 aa  76.3  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  34.07 
 
 		 1733 aa  75.9  0.0000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5104  transcriptional regulator, SARP family  33.06 
 
 		 994 aa  75.9  0.0000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4842  SARP family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 979 aa  75.5  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0556456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  35.38 
 
 		 1072 aa  75.9  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3563  transcriptional regulator, SARP family  32.33 
 
 		 261 aa  75.1  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3657  transcriptional regulator, SARP family  33.04 
 
 		 1030 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  34.65 
 
 		 919 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  34.58 
 
 		 1018 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2669  winged helix family transcriptional regulator ATPase  35.22 
 
 		 1123 aa  74.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.940937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 297 aa  74.3  0.000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4854  SARP family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 786 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0558013 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  32.77 
 
 		 1090 aa  74.3  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4249  transcriptional regulator, SARP family  30.67 
 
 		 1108 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.319347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2592  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 602 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0592694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4843  SARP family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 1151 aa  73.9  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0675424  hitchhiker  0.00881271 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2122  SARP family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 1071 aa  73.2  0.000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.510059  normal  0.895505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3059  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 1014 aa  72.8  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.163733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4694  transcriptional regulator, SARP family  32.44 
 
 		 833 aa  72.8  0.000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3394  transcriptional regulator, SARP family  38.4 
 
 		 978 aa  72.8  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000625659 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  29.91 
 
 		 1017 aa  72.4  0.000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  36.32 
 
 		 1227 aa  72  0.000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  39.38 
 
 		 1056 aa  71.6  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  38.28 
 
 		 980 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3159  SARP family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 968 aa  72  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000459834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  30.99 
 
 		 990 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3481  SARP family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 277 aa  71.6  0.00000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.518975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3684  transcriptional regulator, SARP family  32.53 
 
 		 930 aa  70.5  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.270983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  34.93 
 
 		 1058 aa  71.2  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4955  SARP family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 292 aa  71.2  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.220858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4800  transcriptional regulator, winged helix family  34.25 
 
 		 922 aa  70.9  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3336  SARP family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 268 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.365584 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6166  transcriptional regulator, SARP family  31.43 
 
 		 1036 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000170258  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1815  transcriptional regulator  32.64 
 
 		 1141 aa  69.7  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0114746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33780  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  28.45 
 
 		 631 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3977  transcriptional regulator, SARP family  30.52 
 
 		 962 aa  69.7  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0994  transcriptional regulator, SARP family  32.76 
 
 		 995 aa  69.7  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.05 
 
 		 1036 aa  69.7  0.00000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  35.89 
 
 		 1097 aa  69.3  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  37.62 
 
 		 1048 aa  68.9  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3791  transcriptional regulator, SARP family  27.23 
 
 		 1022 aa  68.9  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.17753  normal  0.608105 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>