81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1936 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1936  SARP family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  434  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000001485  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1771  hypothetical protein  64.95 
 
 		 215 aa  275  4e-73  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1852  SARP family transcriptional regulator  59.57 
 
 		 212 aa  249  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.31253e-17  normal  0.969216 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  28.04 
 
 		 1097 aa  87.8  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  33.54 
 
 		 1163 aa  84  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  24.31 
 
 		 561 aa  77.4  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2653  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  25.27 
 
 		 572 aa  74.7  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  23.24 
 
 		 597 aa  70.5  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.75 
 
 		 1204 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5465  SARP family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 775 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  30.28 
 
 		 1145 aa  61.6  0.000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3571  transcriptional regulator, SARP family  27.66 
 
 		 954 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  28.86 
 
 		 300 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  27.86 
 
 		 1108 aa  58.9  0.00000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 1193 aa  58.9  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  24.73 
 
 		 1111 aa  57.4  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11293  transcriptional regulatory protein embR  26.71 
 
 		 388 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00670672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  24.54 
 
 		 1093 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1911  transcriptional regulator domain protein  24.86 
 
 		 990 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.345318  decreased coverage  0.000588756 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  26.51 
 
 		 999 aa  57.8  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  27.32 
 
 		 268 aa  57  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  24.53 
 
 		 1083 aa  56.6  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0404  TPR repeat-containing protein  26.96 
 
 		 1055 aa  55.5  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  26.95 
 
 		 376 aa  55.5  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  26.9 
 
 		 1145 aa  55.5  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1211  transcriptional regulator, SARP family  25.9 
 
 		 378 aa  55.1  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.705954  normal  0.54501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1835  SARP family transcriptional regulator  23.3 
 
 		 343 aa  54.3  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1624  SARP family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5118  SARP family transcriptional regulator  23.81 
 
 		 1346 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0180644  normal  0.388014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1697  SARP family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000546308  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2272  transcriptional regulator domain protein  25 
 
 		 925 aa  53.9  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0573653  hitchhiker  0.00120633 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13144  transcriptional regulator  25.62 
 
 		 297 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.149221 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  22.95 
 
 		 365 aa  52.4  0.000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5783  transcriptional regulator, SARP family  25 
 
 		 1021 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0303431  normal  0.017876 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1385  transcriptional regulator, winged helix family  29.5 
 
 		 1186 aa  52  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  23.94 
 
 		 1094 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 654 aa  51.6  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  23.3 
 
 		 1095 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  32.32 
 
 		 344 aa  50.1  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0284  transcriptional regulator, SARP family  29.51 
 
 		 689 aa  50.1  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  26.28 
 
 		 1058 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  28.23 
 
 		 965 aa  49.3  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0386  SARP family transcriptional regulator  22.22 
 
 		 268 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.472284  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  26.45 
 
 		 1158 aa  48.5  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  23.88 
 
 		 1004 aa  48.9  0.00006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  23.53 
 
 		 376 aa  48.5  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  30.56 
 
 		 1100 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4174  transcriptional regulator, SARP family  24.44 
 
 		 621 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  24 
 
 		 1190 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 423 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3884  transcriptional regulator, SARP family  27.74 
 
 		 990 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.039717  normal  0.641225 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  23.49 
 
 		 1339 aa  47.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2987  SARP family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 282 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.232638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  26.5 
 
 		 1097 aa  46.6  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 202 aa  46.6  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3460  transcriptional activator domain-containing protein  24.86 
 
 		 1061 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 1043 aa  46.2  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 1064 aa  46.2  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1398  SARP family transcriptional regulator  24.26 
 
 		 1319 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.229363  decreased coverage  0.000262464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3289  SARP family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 1116 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.16943  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2694  response regulator receiver and SARP domain protein  25.3 
 
 		 435 aa  45.1  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3989  transcriptional regulator, SARP family  27.61 
 
 		 1003 aa  45.4  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0138619  normal  0.888144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3827  transcriptional regulator domain-containing protein  29.17 
 
 		 1102 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0262799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  24.74 
 
 		 1044 aa  44.7  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  27.1 
 
 		 349 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0253  response regulator receiver and SARP domain protein  25.9 
 
 		 661 aa  43.5  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.52601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  23.29 
 
 		 957 aa  43.9  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6600  transcriptional activator domain-containing protein  21.95 
 
 		 1733 aa  43.9  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2003  transcriptional regulator, SARP family  27.05 
 
 		 867 aa  43.5  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.228987  hitchhiker  0.0000000440234 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  21.14 
 
 		 1119 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4643  ATPase-like protein  29.51 
 
 		 1048 aa  43.5  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.391035  normal  0.731274 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0466  transcriptional regulator, winged helix family  30.25 
 
 		 1028 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0132601  decreased coverage  0.000794556 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1812  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  26.22 
 
 		 252 aa  42.4  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0084  transcriptional activator domain  25.41 
 
 		 1071 aa  42.4  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0687  transcriptional regulator, SARP family  25.2 
 
 		 1003 aa  42  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.622837 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1607  hypothetical protein  25.13 
 
 		 428 aa  42.4  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  22.7 
 
 		 981 aa  42.4  0.006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3364  transcriptional activator domain  27.05 
 
 		 1118 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3408  transcriptional activator domain protein  27.05 
 
 		 1118 aa  42  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  25.16 
 
 		 1102 aa  41.6  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  25.52 
 
 		 1055 aa  41.2  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>