More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_0410 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_0410  response regulator receiver and SARP domain protein  100 
 
 		 376 aa  779    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000633698  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4304  response regulator receiver and SARP domain protein  34.15 
 
 		 349 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1614  response regulator receiver and SARP domain protein  30.3 
 
 		 376 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.401218  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0497  response regulator receiver and SARP domain protein  31.93 
 
 		 363 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000475999  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  27.3 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1568  response regulator receiver and SARP domain protein  32.62 
 
 		 288 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0553389  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  45.38 
 
 		 237 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  46.55 
 
 		 246 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  45.69 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  45.69 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  100  4e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  44.83 
 
 		 246 aa  100  6e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  45.69 
 
 		 246 aa  99.8  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.91 
 
 		 237 aa  99.4  9e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  44.92 
 
 		 242 aa  99  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  44.92 
 
 		 242 aa  99.4  1e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  46.6 
 
 		 250 aa  98.2  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.65 
 
 		 236 aa  97.8  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.98 
 
 		 237 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 240 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  43.94 
 
 		 238 aa  96.3  8e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  43.94 
 
 		 238 aa  96.3  8e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  43.94 
 
 		 238 aa  96.3  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.73 
 
 		 260 aa  95.9  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.23 
 
 		 268 aa  95.1  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.38 
 
 		 237 aa  94.7  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  41.67 
 
 		 239 aa  95.1  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 246 aa  94.4  3e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  42.24 
 
 		 238 aa  94.7  3e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.68 
 
 		 244 aa  93.6  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.01 
 
 		 252 aa  93.2  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  42.19 
 
 		 249 aa  93.2  7e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.24 
 
 		 245 aa  92.8  9e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0190  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 244 aa  92.4  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.625509  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  41.03 
 
 		 238 aa  92  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0031  response regulator receiver protein  41.74 
 
 		 243 aa  92  2e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.83 
 
 		 241 aa  91.3  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.97 
 
 		 251 aa  90.5  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  40.52 
 
 		 255 aa  90.5  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  41.38 
 
 		 239 aa  90.1  5e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.06 
 
 		 244 aa  90.1  6e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.88 
 
 		 251 aa  90.1  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3170  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.99 
 
 		 239 aa  88.6  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3062  putative two-component response-regulatory protein YehT  43.93 
 
 		 239 aa  89.4  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.52 
 
 		 242 aa  89.4  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  43.1 
 
 		 249 aa  89.4  1e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.46 
 
 		 253 aa  88.6  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  32.43 
 
 		 252 aa  88.6  2e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  45 
 
 		 266 aa  88.6  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4134  LytTR family two component transcriptional regulator  36.44 
 
 		 243 aa  88.2  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.291369  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  39.13 
 
 		 237 aa  87.8  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 247 aa  87.8  3e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.59 
 
 		 265 aa  87.8  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.66 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.66 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.66 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.66 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.66 
 
 		 239 aa  87.4  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.17 
 
 		 241 aa  87.4  4e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 254 aa  87  5e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2093  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.17 
 
 		 237 aa  86.7  6e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.79 
 
 		 239 aa  86.3  7e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.23 
 
 		 317 aa  86.3  8e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  42.06 
 
 		 238 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  44.44 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  40.8 
 
 		 236 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.67 
 
 		 258 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 246 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  38.64 
 
 		 261 aa  84.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 253 aa  85.1  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  35.43 
 
 		 268 aa  85.5  0.000000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.09 
 
 		 251 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1373  DNA-binding response regulator  39.52 
 
 		 300 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.648551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4587  putative two-component response-regulatory protein YehT  43.93 
 
 		 241 aa  85.1  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  37.5 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  25.68 
 
 		 1190 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1220  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.41 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.132093  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 245 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2199  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  29.44 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.425276 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2242  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.5 
 
 		 244 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  41.6 
 
 		 259 aa  84  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  37.88 
 
 		 245 aa  84.3  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.93 
 
 		 239 aa  84  0.000000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2165  LytTR family two component transcriptional regulator  40 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0607611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  37.98 
 
 		 268 aa  84  0.000000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04910  two-component system response regulator  42.61 
 
 		 236 aa  83.6  0.000000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.981835  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.39 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.93 
 
 		 239 aa  83.6  0.000000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03033  transcriptional regulator protein  40.52 
 
 		 165 aa  83.2  0.000000000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  34.07 
 
 		 246 aa  82.8  0.000000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>