More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_01160 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  100 
 
 		 238 aa  482  1e-135  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  87.34 
 
 		 237 aa  433  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  77.22 
 
 		 237 aa  387  1e-107  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  56.54 
 
 		 237 aa  277  1e-73  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 252 aa  216  2.9999999999999998e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  42.69 
 
 		 260 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.44 
 
 		 251 aa  187  2e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  40.16 
 
 		 254 aa  182  4.0000000000000006e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  41.42 
 
 		 249 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.57 
 
 		 268 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.4 
 
 		 265 aa  165  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.94 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  36 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  36 
 
 		 246 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.14 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.78 
 
 		 243 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  35.6 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  35.6 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  36 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  35.6 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 255 aa  155  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  35.6 
 
 		 246 aa  155  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 243 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  35.6 
 
 		 246 aa  155  5.0000000000000005e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0699  response regulator receiver  37.5 
 
 		 275 aa  155  5.0000000000000005e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  35.6 
 
 		 246 aa  155  6e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1375  response regulator receiver protein  38.72 
 
 		 239 aa  155  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  36.02 
 
 		 236 aa  155  6e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  36.1 
 
 		 243 aa  155  8e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5008  LytTR family two component transcriptional regulator  39.33 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.135227  hitchhiker  0.0000288771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.01 
 
 		 244 aa  154  2e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  35.2 
 
 		 246 aa  153  2e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  38.37 
 
 		 257 aa  152  2.9999999999999998e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 240 aa  152  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  37.61 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1393  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.45 
 
 		 238 aa  151  8.999999999999999e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000160197 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  40.91 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.33 
 
 		 245 aa  150  1e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  38.08 
 
 		 250 aa  150  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 270 aa  149  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  34.4 
 
 		 246 aa  149  5e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  32.52 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  32.52 
 
 		 246 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  36.89 
 
 		 244 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0067  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.93 
 
 		 275 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.54 
 
 		 247 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  35.37 
 
 		 247 aa  146  2.0000000000000003e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.29 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4560  response regulator receiver protein  38.06 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.850639 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3167  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.91 
 
 		 285 aa  144  8.000000000000001e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616861  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  36.29 
 
 		 268 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.5 
 
 		 237 aa  143  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.7 
 
 		 239 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12140  response regulator of the LytR/AlgR family  39.17 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  37.92 
 
 		 261 aa  142  4e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.4 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  36.67 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 262 aa  142  5e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  34.54 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  33.61 
 
 		 243 aa  141  9.999999999999999e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1621  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 245 aa  140  9.999999999999999e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  37.15 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  37.15 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.02 
 
 		 242 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.36 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2482  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.23 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.162526 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.36 
 
 		 238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.2 
 
 		 244 aa  139  3e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2143  response regulator receiver protein  37.96 
 
 		 265 aa  140  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.390763  normal  0.164671 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.38 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.95 
 
 		 238 aa  139  3.9999999999999997e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.04 
 
 		 243 aa  139  4.999999999999999e-32  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.89 
 
 		 239 aa  138  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  32.81 
 
 		 249 aa  138  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  138  8.999999999999999e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.27 
 
 		 245 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  34.66 
 
 		 246 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  34.69 
 
 		 242 aa  137  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  37.55 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.22 
 
 		 281 aa  137  1e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.1 
 
 		 245 aa  137  2e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2133  LytTR family two component transcriptional regulator  35.98 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.565653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6324  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.48372 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.83 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.48 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.48 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.48 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.48 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.42 
 
 		 236 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.48 
 
 		 239 aa  135  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  30.2 
 
 		 245 aa  135  4e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.88 
 
 		 242 aa  135  7.000000000000001e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.07 
 
 		 239 aa  135  7.000000000000001e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>