More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0979 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.93 
 
 		 242 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  40.08 
 
 		 246 aa  165  5e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.42 
 
 		 244 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  32.65 
 
 		 249 aa  148  7e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.5 
 
 		 245 aa  146  3e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 249 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  39.43 
 
 		 268 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.17 
 
 		 243 aa  136  3.0000000000000003e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  35.29 
 
 		 257 aa  132  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  34.94 
 
 		 259 aa  128  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  32.11 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  32.11 
 
 		 246 aa  128  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  31.47 
 
 		 251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  36.16 
 
 		 245 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  29.46 
 
 		 246 aa  126  3e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  32.95 
 
 		 272 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.55 
 
 		 260 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.58 
 
 		 246 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  29.84 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  30.38 
 
 		 246 aa  123  3e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  29.84 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  29.84 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  29.84 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  29.84 
 
 		 246 aa  122  4e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  37.3 
 
 		 255 aa  122  4e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 247 aa  122  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  29.62 
 
 		 246 aa  122  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  29.46 
 
 		 246 aa  122  6e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  29.92 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  29.34 
 
 		 246 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  37.05 
 
 		 254 aa  121  9e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.74 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  34.71 
 
 		 245 aa  120  1.9999999999999998e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.35 
 
 		 258 aa  119  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.8 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.56 
 
 		 237 aa  119  3e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2149  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.39 
 
 		 234 aa  120  3e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00472108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.62 
 
 		 260 aa  120  3e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.63 
 
 		 252 aa  119  4.9999999999999996e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  40.58 
 
 		 237 aa  119  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.71 
 
 		 254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  32.21 
 
 		 229 aa  118  9e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 317 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  33.46 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 258 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.47 
 
 		 251 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  34.47 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  32.53 
 
 		 276 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 261 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  35.39 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  34.23 
 
 		 244 aa  115  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  30.98 
 
 		 252 aa  115  6e-25  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  31.5 
 
 		 275 aa  115  6e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.28 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0068  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.58 
 
 		 244 aa  115  6.9999999999999995e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00288448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  33.05 
 
 		 243 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  34.01 
 
 		 279 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.03 
 
 		 251 aa  114  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  34.07 
 
 		 261 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.12 
 
 		 266 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5278  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.91 
 
 		 281 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.415246  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.14 
 
 		 251 aa  113  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.64 
 
 		 243 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  36.13 
 
 		 249 aa  113  3e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1400  response regulator  34.58 
 
 		 243 aa  112  4.0000000000000004e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 254 aa  112  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  32.35 
 
 		 280 aa  112  5e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2762  response regulator receiver protein  35.63 
 
 		 254 aa  112  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.330347  normal  0.784413 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 243 aa  112  7.000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  34.13 
 
 		 242 aa  111  8.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.56 
 
 		 242 aa  111  9e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.06 
 
 		 238 aa  111  9e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0388  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.08 
 
 		 233 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.47 
 
 		 237 aa  111  1.0000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0421  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.82 
 
 		 256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4280  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 269 aa  110  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11553  two-component system response regulator  31.73 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  31.95 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  32.64 
 
 		 243 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.76 
 
 		 237 aa  109  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3341  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.13 
 
 		 244 aa  110  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.798853 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.04 
 
 		 260 aa  109  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  31.47 
 
 		 242 aa  109  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.96 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.34 
 
 		 260 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4051  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 269 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.243327  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.51 
 
 		 256 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4126  response regulator receiver protein  38.25 
 
 		 269 aa  108  5e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.217512  normal  0.408771 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3483  LytTR family two component transcriptional regulator  30.43 
 
 		 231 aa  109  5e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.630225  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.65 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3726  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.2 
 
 		 252 aa  108  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  34.17 
 
 		 237 aa  107  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  34.59 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  28.21 
 
 		 232 aa  107  2e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>