More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A5621 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  100 
 
 
246 aa  498  1e-140  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  99.59 
 
 
246 aa  496  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  97.56 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  97.56 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  97.56 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  97.56 
 
 
246 aa  465  9.999999999999999e-131  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  97.56 
 
 
246 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  95.53 
 
 
246 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  95.53 
 
 
246 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  93.09 
 
 
246 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  86.99 
 
 
246 aa  441  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  42.4 
 
 
247 aa  207  1e-52  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  43.57 
 
 
246 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  43.57 
 
 
246 aa  202  4e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  41.13 
 
 
246 aa  198  6e-50  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  42.51 
 
 
240 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  41.43 
 
 
252 aa  197  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.6 
 
 
265 aa  194  9e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  43.55 
 
 
250 aa  192  5e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.36 
 
 
247 aa  190  2e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  42.11 
 
 
243 aa  187  1e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  41.63 
 
 
244 aa  186  2e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  41.43 
 
 
236 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40 
 
 
255 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2025  two-component response regulator  42.17 
 
 
252 aa  181  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.02 
 
 
260 aa  178  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.9 
 
 
251 aa  171  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02291  predicted response regulator in two-component system withYpdA  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1276  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.435037  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1288  LytTR family two component transcriptional regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.524379  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2750  response regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0055  LytTR family two component transcriptional regulator  38.96 
 
 
243 aa  170  2e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.868518  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3613  response regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.560415 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2518  response regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2671  response regulator  37.8 
 
 
244 aa  170  2e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0059  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.96 
 
 
243 aa  169  3e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.182784  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0060  LytTR family two component transcriptional regulator  38.43 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0478076  hitchhiker  0.000497336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  38.43 
 
 
243 aa  169  4e-41  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2533  response regulator  37.4 
 
 
244 aa  168  8e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0057  response regulator receiver protein  38.55 
 
 
243 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000048418  decreased coverage  0.0000000648872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0055  response regulator receiver protein  38.55 
 
 
243 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000989316  hitchhiker  0.000468323 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2920  LytTR family two component transcriptional regulator  37.65 
 
 
245 aa  167  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.106094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2357  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.74 
 
 
244 aa  165  5.9999999999999996e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.88 
 
 
262 aa  164  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  35.6 
 
 
255 aa  160  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  36 
 
 
238 aa  160  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.51 
 
 
251 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2443  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.8 
 
 
245 aa  160  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.191147  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1879  two component transcriptional regulator, LytTR family  36 
 
 
249 aa  159  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.247337  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  33.95 
 
 
275 aa  156  3e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.8 
 
 
246 aa  156  3e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.07 
 
 
261 aa  156  3e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
270 aa  155  4e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.01 
 
 
237 aa  155  5.0000000000000005e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  35.2 
 
 
254 aa  155  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3405  LytTR family two component transcriptional regulator  36.03 
 
 
244 aa  155  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.732179  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2171  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.43 
 
 
249 aa  154  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0294549  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  33.47 
 
 
237 aa  153  2e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  36.59 
 
 
249 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  39.11 
 
 
237 aa  153  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.92 
 
 
237 aa  152  5.9999999999999996e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.61 
 
 
268 aa  151  8e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.89 
 
 
239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.89 
 
 
239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.89 
 
 
239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.89 
 
 
239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.89 
 
 
239 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  38.21 
 
 
242 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  149  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.86 
 
 
253 aa  149  5e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.43 
 
 
238 aa  148  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.43 
 
 
238 aa  148  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  35.48 
 
 
239 aa  148  9e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.08 
 
 
239 aa  147  1.0000000000000001e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.48 
 
 
239 aa  147  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  37.65 
 
 
242 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
317 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.05 
 
 
238 aa  145  4.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  32.95 
 
 
268 aa  145  7.0000000000000006e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  32.26 
 
 
255 aa  145  8.000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.98 
 
 
257 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.82 
 
 
241 aa  144  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.44 
 
 
257 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.37 
 
 
241 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.73 
 
 
244 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  31.64 
 
 
257 aa  143  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  30.48 
 
 
276 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.71 
 
 
243 aa  142  7e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  30.95 
 
 
249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  31.71 
 
 
245 aa  140  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.61 
 
 
236 aa  139  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  36.59 
 
 
236 aa  138  6e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
253 aa  138  7.999999999999999e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>