More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0161 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  100 
 
 		 270 aa  558  1e-158  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  49.81 
 
 		 261 aa  261  1e-68  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  51.67 
 
 		 257 aa  256  2e-67  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  48.72 
 
 		 260 aa  239  4e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 255 aa  194  9e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.52 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 252 aa  183  2.0000000000000003e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.81 
 
 		 251 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 240 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10420  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.19 
 
 		 253 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000460621  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 262 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  36.7 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.2 
 
 		 251 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2791  LytTR family two component transcriptional regulator  37.08 
 
 		 250 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.073585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.85 
 
 		 260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.19 
 
 		 268 aa  159  5e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  36.06 
 
 		 249 aa  157  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.96 
 
 		 247 aa  155  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  32.33 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  32.71 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  35.45 
 
 		 275 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  32.83 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.36 
 
 		 260 aa  151  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  32.33 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  32.46 
 
 		 246 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  33.09 
 
 		 238 aa  149  6e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  33.09 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.21 
 
 		 244 aa  145  5e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  31.46 
 
 		 244 aa  144  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  32.54 
 
 		 268 aa  144  2e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 268 aa  143  3e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  35.09 
 
 		 266 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 265 aa  141  9e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  29 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.71 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  31.84 
 
 		 237 aa  139  3e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 317 aa  137  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.46 
 
 		 239 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  33.58 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 237 aa  137  2e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.85 
 
 		 257 aa  137  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  32.1 
 
 		 246 aa  136  5e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2186  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.22 
 
 		 275 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  31.52 
 
 		 255 aa  135  9e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.73 
 
 		 260 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0357  response regulator receiver  36.09 
 
 		 249 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.71 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.71 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.71 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.71 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.71 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  30.34 
 
 		 249 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  28.68 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  28.68 
 
 		 246 aa  129  4.0000000000000003e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0885  response regulator  29.93 
 
 		 247 aa  129  6e-29  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0355946  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  33.47 
 
 		 268 aa  128  9.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.22 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  29.74 
 
 		 243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.58 
 
 		 266 aa  126  3e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 257 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  32.09 
 
 		 276 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.84 
 
 		 239 aa  124  2e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.56 
 
 		 240 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.37 
 
 		 242 aa  124  2e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.34 
 
 		 245 aa  124  2e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2434  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.96 
 
 		 236 aa  123  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.318628  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.46 
 
 		 239 aa  123  4e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4494  LytTr DNA-binding region  35.07 
 
 		 250 aa  123  4e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0706486  normal  0.304613 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.83 
 
 		 237 aa  122  5e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.46 
 
 		 239 aa  122  6e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0444  response regulator receiver protein  28.04 
 
 		 262 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  32.3 
 
 		 265 aa  121  1.9999999999999998e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  29.15 
 
 		 280 aa  120  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.94 
 
 		 238 aa  120  3e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1381  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 273 aa  120  3e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.557466 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000974  response regulator of the LytR/AlgR family  29.63 
 
 		 263 aa  120  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.728867  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.95 
 
 		 232 aa  119  3.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07024  transcriptional regulator  29.63 
 
 		 263 aa  119  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.21 
 
 		 236 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.58 
 
 		 241 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3485  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.09 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.159726 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3358  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.09 
 
 		 238 aa  119  6e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1083  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.71 
 
 		 239 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.450563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3221  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.72 
 
 		 238 aa  118  9.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1440  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.71 
 
 		 236 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>