More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1585 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  100 
 
 		 259 aa  520  1e-147  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.45 
 
 		 258 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.82 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  40.08 
 
 		 251 aa  166  4e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.45 
 
 		 251 aa  165  8e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.96 
 
 		 251 aa  158  7e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.03 
 
 		 248 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  35.63 
 
 		 243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.08 
 
 		 248 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.22 
 
 		 254 aa  150  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0582  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.36 
 
 		 253 aa  150  3e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000831919  hitchhiker  0.00409076 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.59 
 
 		 250 aa  146  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  35.2 
 
 		 240 aa  146  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  33.87 
 
 		 247 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.82 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.71 
 
 		 244 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  35.89 
 
 		 237 aa  131  1.0000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  34.94 
 
 		 242 aa  128  8.000000000000001e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  35.43 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 246 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  34.35 
 
 		 272 aa  127  2.0000000000000002e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  35.43 
 
 		 246 aa  125  5e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  35.04 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  36.11 
 
 		 246 aa  125  6e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  34.35 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  34.35 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  34.35 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  34.35 
 
 		 246 aa  125  7e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  34.65 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 246 aa  124  1e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  34.12 
 
 		 249 aa  123  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 317 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.47 
 
 		 237 aa  123  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.87 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.59 
 
 		 237 aa  120  1.9999999999999998e-26  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.99 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  32 
 
 		 238 aa  119  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 252 aa  119  6e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  33.59 
 
 		 275 aa  119  6e-26  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.86 
 
 		 260 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.56 
 
 		 243 aa  118  7.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  32.7 
 
 		 246 aa  118  9e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.33 
 
 		 260 aa  118  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  34.88 
 
 		 249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.27 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 262 aa  116  3.9999999999999997e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  36.13 
 
 		 229 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 253 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  33.49 
 
 		 249 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  32.34 
 
 		 280 aa  112  6e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 270 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  30.24 
 
 		 255 aa  109  4.0000000000000004e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.18 
 
 		 266 aa  109  5e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.94 
 
 		 237 aa  108  9.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  30.99 
 
 		 243 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.12 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.61 
 
 		 236 aa  107  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.14 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.54 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 254 aa  106  4e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1645  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.72 
 
 		 232 aa  106  5e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2256  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.18 
 
 		 262 aa  105  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.596319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  30.6 
 
 		 276 aa  105  6e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  28.69 
 
 		 255 aa  105  6e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.43 
 
 		 245 aa  105  8e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  32.51 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0330  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.02 
 
 		 254 aa  105  9e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  33.2 
 
 		 245 aa  104  1e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  32.82 
 
 		 273 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0183  response regulator  30.4 
 
 		 246 aa  103  2e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  30.24 
 
 		 265 aa  104  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0097  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 245 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2575  two-component response regulator  33.18 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2671  response regulator receiver protein  31.28 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000586434 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5161  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.58 
 
 		 248 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.185153  hitchhiker  0.000735465 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.23 
 
 		 236 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  27.89 
 
 		 257 aa  104  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  31.78 
 
 		 268 aa  103  2e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.69 
 
 		 242 aa  103  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.2 
 
 		 239 aa  103  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.51 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4524  two component transcriptional regulator, LytTR family  32 
 
 		 240 aa  103  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000306542  normal  0.871136 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.51 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.51 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.51 
 
 		 236 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 246 aa  102  5e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2823  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.99 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.82 
 
 		 236 aa  102  6e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  30.89 
 
 		 241 aa  102  7e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 247 aa  102  8e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.82 
 
 		 236 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  29.07 
 
 		 268 aa  102  9e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  34.87 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.56 
 
 		 240 aa  101  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.1 
 
 		 238 aa  100  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.09 
 
 		 257 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5028  LytTR family two component transcriptional regulator  29.32 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.967214  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>