More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1527 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 246 aa  493  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  56.5 
 
 		 244 aa  296  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  56.8 
 
 		 245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  53.88 
 
 		 242 aa  274  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  50.41 
 
 		 243 aa  228  9e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  38.98 
 
 		 249 aa  197  2.0000000000000003e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  38.87 
 
 		 246 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  41.3 
 
 		 242 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  36.58 
 
 		 252 aa  163  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3544  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.71 
 
 		 251 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0394969  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  36.86 
 
 		 229 aa  155  4e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.26 
 
 		 260 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.34 
 
 		 251 aa  155  6e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  35.41 
 
 		 268 aa  155  6e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.12 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  31.5 
 
 		 272 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.25 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3159  response regulator receiver  34.48 
 
 		 242 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1542  LytTr DNA-binding region  35.47 
 
 		 245 aa  149  5e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.300206 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  33.46 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  33.46 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0469  response regulator receiver protein  36.54 
 
 		 254 aa  148  9e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  34.12 
 
 		 266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  37.6 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0161  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 262 aa  146  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3291  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 258 aa  145  4.0000000000000006e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.393667  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.7 
 
 		 268 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4189  LytTr DNA-binding region  38.84 
 
 		 231 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.537023 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  36.15 
 
 		 276 aa  144  1e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01160  response regulator of the LytR/AlgR family  35.86 
 
 		 238 aa  144  1e-33  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.2 
 
 		 266 aa  144  2e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  30.37 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  33.6 
 
 		 265 aa  142  5e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.47 
 
 		 246 aa  141  9e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  35.24 
 
 		 261 aa  139  3e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  36.88 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0137  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.06 
 
 		 237 aa  139  3.9999999999999997e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  32.97 
 
 		 275 aa  139  4.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 240 aa  139  6e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3416  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.04 
 
 		 237 aa  139  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.329348  normal  0.0577965 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  31.89 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  35.83 
 
 		 268 aa  138  1e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3838  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 254 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.479778 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.3 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2397  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.33 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00984  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.75 
 
 		 242 aa  136  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.95 
 
 		 254 aa  136  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004414  response regulator of the LytR/AlgR family  32.14 
 
 		 242 aa  136  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  37.34 
 
 		 255 aa  136  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2397  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.65 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.423362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2348  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.65 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2393  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.65 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2304  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.65 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2505  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.65 
 
 		 239 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0224  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.6 
 
 		 237 aa  135  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  32.57 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2093  putative two-component response-regulatory protein YehT  35.97 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2502  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.57 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00178929  normal  0.0452702 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2883  putative two-component response-regulatory protein YehT  31.71 
 
 		 236 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000903631  unclonable  0.0000000000401288 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2278  LytTr DNA-binding response regulator  29.96 
 
 		 280 aa  133  3e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.421967  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 247 aa  133  3e-30  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2432  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.16 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000158974  hitchhiker  0.00361478 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4010  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.27 
 
 		 231 aa  133  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0569074  decreased coverage  0.00157623 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2594  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.16 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0103906  hitchhiker  0.00157605 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1548  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.16 
 
 		 236 aa  133  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.496368  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1695  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.98 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000884824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2685  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.98 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0538398  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1658  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.98 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000153786  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1673  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.98 
 
 		 236 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000537167  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00400  response regulator of the LytR/AlgR family  33.73 
 
 		 237 aa  132  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.132657  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02054  predicted response regulator in two-component system withYehU  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1533  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.726215  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3112  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.148941 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2259  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1522  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02012  hypothetical protein  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2413  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.4 
 
 		 239 aa  132  5e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04138  two-component system regulatory protein  36 
 
 		 245 aa  132  5e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.739319  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1318  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.47 
 
 		 238 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2723  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.25 
 
 		 239 aa  132  6e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1281  putative two-component response-regulatory protein YehT  37.3 
 
 		 236 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.155887  normal  0.0159688 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0387  response regulator  34.32 
 
 		 261 aa  131  9e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2329  putative two-component response-regulatory protein YehT  34.6 
 
 		 236 aa  131  9e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0108361  normal  0.9097 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0957  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.02 
 
 		 241 aa  130  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.147856  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2452  putative two-component response-regulatory protein YehT  32.24 
 
 		 238 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0310324  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0919  putative two-component response-regulatory protein YehT  34 
 
 		 239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  42.61 
 
 		 249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0865  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.86 
 
 		 239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  33.07 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  30.95 
 
 		 244 aa  130  3e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1323  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.67 
 
 		 237 aa  129  3e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0540721  normal  0.0273831 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1224  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.73 
 
 		 260 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0890711 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.56 
 
 		 260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1765  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.47 
 
 		 232 aa  129  6e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.199181  hitchhiker  0.00544661 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.74 
 
 		 271 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1479  putative two-component response-regulatory protein YehT  33.33 
 
 		 236 aa  128  9.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0100477  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>