More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3976 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3976  LytTR family two component transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  506  9.999999999999999e-143  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6582  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.65 
 
 		 250 aa  169  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.05 
 
 		 258 aa  165  5e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1279  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.73 
 
 		 248 aa  159  5e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.111911  normal  0.254446 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2656  two component transcriptional regulator, LytTR family  38.19 
 
 		 250 aa  155  8e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.81917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0148  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.85 
 
 		 251 aa  155  8e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.48043 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0582  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.6 
 
 		 253 aa  153  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000831919  hitchhiker  0.00409076 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3408  LytTr DNA-binding region  36.86 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.111489  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01905  response regulator  34.58 
 
 		 243 aa  149  5e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1502  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.37 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5645  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.08 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.954414  normal  0.925082 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1585  LytTr DNA-binding region  33.87 
 
 		 259 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.80455  normal  0.0356965 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0254  response regulator  34.84 
 
 		 251 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.437869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5950  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.67 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.792388  normal  0.0587504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.02 
 
 		 244 aa  131  7.999999999999999e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  30.38 
 
 		 254 aa  129  3e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.79 
 
 		 242 aa  125  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0671  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.43 
 
 		 251 aa  125  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2906  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.52 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 268 aa  114  2.0000000000000002e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3733  response regulator receiver domain-containing protein  31.48 
 
 		 249 aa  112  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.766169 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1004  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.62 
 
 		 257 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00878343  normal  0.279198 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2328  LytTR family two component transcriptional regulator  27.73 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.261765  decreased coverage  0.00199939 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0420  LytR/AlgR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 317 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0328897  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4846  LytTR family two component transcriptional regulator  29.83 
 
 		 246 aa  110  3e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.568582  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  28.41 
 
 		 268 aa  108  1e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1819  LytTr DNA-binding response regulator  28.51 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.148301  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0904  LytTR family two component transcriptional regulator  29.54 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0617  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.87 
 
 		 243 aa  104  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.23864 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2661  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.71 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1114  LytTR family two component transcriptional regulator  31.31 
 
 		 249 aa  102  7e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.677936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  28.64 
 
 		 242 aa  102  8e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5734  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.99 
 
 		 257 aa  101  9e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3487  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6586  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.83 
 
 		 246 aa  101  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.318104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1860  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.4 
 
 		 266 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1964  LytR/AlgR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 255 aa  100  3e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.777054 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1006  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.05 
 
 		 251 aa  100  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.641502  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0271  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.68 
 
 		 256 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0704  LytTR family two component transcriptional regulator  27.41 
 
 		 276 aa  99.4  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.674394 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1527  LytTR family two component transcriptional regulator  27.64 
 
 		 246 aa  99.8  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.109257  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0227  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 265 aa  99.4  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312706  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2172  LytR/AlgR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0721488  normal  0.0255714 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0804  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.09 
 
 		 251 aa  98.2  1e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2974  LytTR family two component transcriptional regulator  26.54 
 
 		 266 aa  98.2  1e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.318128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1317  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.49 
 
 		 261 aa  97.4  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0715  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.75 
 
 		 245 aa  97.1  3e-19  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00500528  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5234  LytTR family two component transcriptional regulator  26.77 
 
 		 246 aa  96.7  4e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1794  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.15 
 
 		 260 aa  96.3  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5573  response regulator LytR  28.4 
 
 		 246 aa  95.5  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1001  LytR/AlgR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 262 aa  95.5  7e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0103069 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2091  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.77 
 
 		 259 aa  95.5  7e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0504817  normal  0.478744 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5621  response regulator LytR  28.4 
 
 		 246 aa  95.1  8e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11553  two-component system response regulator  28.15 
 
 		 237 aa  95.5  8e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5384  response regulator LytR  27.06 
 
 		 246 aa  95.1  9e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.662493  normal  0.485514 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4382  LytTR family two component transcriptional regulator  28.79 
 
 		 273 aa  95.1  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5295  response regulator LytR  27.06 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5122  response regulator  27.06 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5691  response regulator LytR  27.06 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5536  response regulator LytR  27.06 
 
 		 246 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1016  response regulator  29.55 
 
 		 244 aa  94  2e-18  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5137  response regulator  27.06 
 
 		 246 aa  94  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4801  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.39 
 
 		 240 aa  94.4  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0480  response regulator receiver domain-containing protein  31.39 
 
 		 265 aa  93.6  3e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0119  response regulator receiver protein  27.05 
 
 		 249 aa  93.2  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01918  putative response regulator in two-component regulatory system  27.47 
 
 		 275 aa  92.8  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.159199  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0898  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.55 
 
 		 265 aa  92.8  5e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2385  response regulator receiver protein  26.01 
 
 		 272 aa  92.8  5e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5565  response regulator LytR  26.67 
 
 		 246 aa  92.4  6e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12408  two-component system response regulator  29.6 
 
 		 251 aa  92  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.401855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2957  response regulator receiver protein  27.34 
 
 		 236 aa  92  7e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00954821  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  28.51 
 
 		 261 aa  91.7  9e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3000  response regulator receiver domain-containing protein  31.34 
 
 		 229 aa  91.3  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248508 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2356  response regulator receiver protein  28.29 
 
 		 257 aa  91.3  1e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.325932  normal  0.149931 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3594  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.72 
 
 		 260 aa  90.9  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.833136  normal  0.0457058 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5312  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.57 
 
 		 255 aa  90.5  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0977362 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3718  response regulator  28.95 
 
 		 275 aa  90.9  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0758  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.38 
 
 		 256 aa  90.9  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.649382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2697  LytR/AlgR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 240 aa  90.9  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3773  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.44 
 
 		 260 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.10961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1151  response regulator receiver protein  27 
 
 		 276 aa  90.9  2e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7151  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.19 
 
 		 249 aa  90.9  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0959  putative two-component response-regulatory protein YehT  28.46 
 
 		 241 aa  90.5  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.606019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2443  LytTR family two component transcriptional regulator  28.21 
 
 		 279 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1836  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.69 
 
 		 258 aa  90.1  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.367672  normal  0.467017 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2329  LytTR family two component transcriptional regulator  25.79 
 
 		 255 aa  89.4  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0531557  decreased coverage  0.00207881 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1869  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.68 
 
 		 243 aa  89.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000208305  normal  0.145854 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  29.1 
 
 		 232 aa  89.4  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4129  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.38 
 
 		 271 aa  89.7  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1444  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.98 
 
 		 256 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.317386 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1761  two component transcriptional regulator, LytTR family  26.88 
 
 		 251 aa  88.6  8e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1844  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.7 
 
 		 236 aa  88.6  9e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3958  LytTR family two component transcriptional regulator  26.05 
 
 		 246 aa  88.6  9e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4001  LytTR family two component transcriptional regulator  27.57 
 
 		 255 aa  87.8  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0246  two-component response regulator  27.24 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4495  LytTR family two component transcriptional regulator  28.77 
 
 		 245 aa  88.2  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17015 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0252  two-component response regulator  27.24 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6102  two component transcriptional regulator, LytTR family  29.91 
 
 		 252 aa  88.6  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5405  two component transcriptional regulator, LytTR family  27.62 
 
 		 243 aa  87.8  2e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.379459 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4299  LytTR family two component transcriptional regulator  28.23 
 
 		 243 aa  87.4  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000001386  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>