77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2409 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2409  transcriptional regulator, SARP family  100 
 
 		 244 aa  464  9.999999999999999e-131  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2486  transcriptional regulator, SARP family  55.79 
 
 		 270 aa  229  2e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4971  transcriptional regulator, SARP family  48.96 
 
 		 261 aa  182  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.602293  normal  0.15867 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2507  transcriptional activator domain-containing protein  46.55 
 
 		 275 aa  145  6e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0440426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2691  SARP family transcriptional regulator  46.9 
 
 		 271 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144834 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1963  transcriptional regulator, SARP family  39.91 
 
 		 248 aa  139  4.999999999999999e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0662749  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1158  transcriptional regulator, SARP family  39.22 
 
 		 277 aa  132  5e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000016652 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2088  transcriptional regulator, SARP family  44.68 
 
 		 244 aa  125  6e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.37571  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4928  transcriptional activator domain-containing protein  34.87 
 
 		 1075 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.66885  normal  0.971064 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2428  transcriptional regulator, SARP family  31.42 
 
 		 494 aa  66.2  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1406  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 		 1067 aa  66.2  0.0000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0699  transcriptional activator domain-containing protein  30 
 
 		 1094 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00060152 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0063  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 1190 aa  60.1  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.82825  normal  0.766346 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_6036  transcriptional regulator, SARP family  29.95 
 
 		 650 aa  58.9  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0951775  normal  0.443759 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0338  transcriptional regulator  29.85 
 
 		 1193 aa  58.9  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.497277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2548  transcriptional regulator, SARP family  31.74 
 
 		 992 aa  58.2  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.709979  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4345  transcriptional activator domain-containing protein  29.41 
 
 		 1095 aa  58.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00663384 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3701  SARP family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 1064 aa  57.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000037794 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3421  response regulator receiver and SARP domain protein  32.76 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.402524  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0366  transcriptional activator domain protein  26.8 
 
 		 1097 aa  57.4  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.37715 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1630  SARP family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 1089 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4571  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 985 aa  56.6  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.723489 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1953  transcriptional activator domain protein  27.8 
 
 		 1083 aa  57  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00247822 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3683  transcriptional activator domain-containing protein  25 
 
 		 1034 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00198659  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0326  transcriptional regulator, SARP family  38.2 
 
 		 647 aa  56.6  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0243  transcriptional activator domain protein  39.42 
 
 		 1083 aa  55.8  0.0000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2154  transcriptional activator domain protein  28.74 
 
 		 1139 aa  55.5  0.0000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0522112 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0337  transcriptional regulator, SARP family  37.77 
 
 		 647 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7193  transcriptional regulator, SARP family  28.46 
 
 		 641 aa  53.1  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0854307  normal  0.06484 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3287  transcriptional activator domain protein  30.59 
 
 		 1044 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0920226  hitchhiker  0.00000903469 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5300  transcriptional regulator, SARP family  26.96 
 
 		 1017 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.706654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2600  transcriptional activator domain protein  32.26 
 
 		 1108 aa  52  0.000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1636  TPR repeat transcriptional activator domain-containing protein  26.61 
 
 		 1126 aa  51.2  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4892  transcriptional activator domain-containing protein  29.75 
 
 		 597 aa  51.6  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.123982 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4724  transcriptional activator domain-containing protein  25.5 
 
 		 713 aa  50.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0215  transcriptional activator domain protein  27.4 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.6802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1222  transcriptional activator domain protein  28.57 
 
 		 1018 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.983461  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0590  transcriptional activator domain protein  34.51 
 
 		 1163 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.422877 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2832  transcriptional regulator, SARP family  25.1 
 
 		 1145 aa  50.1  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3322  transcriptional activator domain-containing protein  28.57 
 
 		 1204 aa  49.7  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.11039  normal  0.190141 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4017  transcriptional regulator, SARP family  29.79 
 
 		 535 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00126088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5531  transcriptional regulator, SARP family  31.92 
 
 		 963 aa  49.3  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.394906 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6221  transcriptional regulator, SARP family  31.06 
 
 		 931 aa  49.3  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0749  transcriptional activator domain protein  34.83 
 
 		 1090 aa  48.9  0.00008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4424  transcriptional activator domain-containing protein  28.17 
 
 		 1055 aa  48.5  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.518741  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0315  SARP family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 648 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.658605  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1735  SARP family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 636 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.271583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7082  transcriptional regulator, SARP family  29.58 
 
 		 990 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.379783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0060  transcriptional activator domain-containing protein  27.49 
 
 		 1145 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6515  transcriptional regulator, SARP family  31.67 
 
 		 1004 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.409149  normal  0.360927 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0502  transcriptional regulator, SARP family  31.67 
 
 		 611 aa  46.6  0.0004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000614607  hitchhiker  0.0000229515 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2956  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  28.87 
 
 		 1339 aa  46.2  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00898983  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7885  ATPase-like protein  31.25 
 
 		 1121 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.811946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4327  transcriptional activator domain-containing protein  30.58 
 
 		 1029 aa  45.8  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.425746 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2896  response regulator receiver and SARP domain-containing protein  25.44 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.264133 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2604  response regulator receiver protein  30.05 
 
 		 489 aa  45.8  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0367154  normal  0.116577 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  29.13 
 
 		 1018 aa  45.4  0.0009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2898  transcriptional regulator, winged helix family  33.17 
 
 		 1094 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.343101 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5677  transcriptional regulator, SARP family  32.42 
 
 		 965 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2768  SARP family transcriptional regulator  22.17 
 
 		 1050 aa  45.1  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1512  response regulator receiver/SARP domain-containing protein  31.37 
 
 		 561 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0226395 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3863  transcriptional regulator, SARP family  38.04 
 
 		 981 aa  45.1  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.291313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4191  SARP family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 621 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000808201 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  28.17 
 
 		 943 aa  44.3  0.002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3806  SARP family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 423 aa  43.5  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0119583  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29840  DNA-binding transcriptional activator of the SARP family  30.26 
 
 		 496 aa  43.5  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3671  SARP family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 1048 aa  43.5  0.003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0046189 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0495  response regulator receiver and SARP domain protein  21.7 
 
 		 365 aa  43.9  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108458  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4285  ATPase-like protein  33.7 
 
 		 1114 aa  43.1  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.660299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3190  transcriptional regulator, putative ATPase, winged helix family  38.3 
 
 		 919 aa  43.1  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.134383  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3099  SARP family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 654 aa  42.7  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0399621 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5818  SARP family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 202 aa  42.7  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3484  transcriptional regulator, SARP family  27.94 
 
 		 981 aa  42.4  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2140  transcriptional regulator, SARP family  38.71 
 
 		 1153 aa  42.4  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.032223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  31.91 
 
 		 1100 aa  42.4  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0173  ATP-dependent transcriptional regulator-like protein  22.27 
 
 		 1111 aa  42  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3384  transcriptional regulator, SARP family  32.45 
 
 		 1020 aa  42  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.799293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>