More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3762 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5633  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  39.46 
 
 
1131 aa  711    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5519  serine/threonine protein kinase  42.23 
 
 
1188 aa  750    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3762  serine/threonine protein kinase  100 
 
 
1192 aa  2378    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  unclonable  0.00167797  normal  0.557916 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2768  serine/threonine protein kinase  35.34 
 
 
1446 aa  397  1e-109  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4074  serine/threonine protein kinase  36.71 
 
 
1297 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0173368 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1593  serine/threonine protein kinase  35.78 
 
 
1377 aa  378  1e-103  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0224  serine/threonine protein kinase  35.92 
 
 
1295 aa  344  7e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2767  serine/threonine protein kinase  39.1 
 
 
1514 aa  278  3e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.98115 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4588  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  30.73 
 
 
1096 aa  243  2e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.537027  normal  0.92591 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0515  ATPase-like  33.99 
 
 
1079 aa  185  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.413543  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000467  predicted ATPase  24.31 
 
 
1057 aa  176  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.101132  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6308  serine/threonine protein kinase  29.26 
 
 
1235 aa  172  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0912  serine/threonine protein kinase  32.31 
 
 
612 aa  135  3.9999999999999996e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0411502  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3295  multi-sensor signal transduction multi-kinase  21.47 
 
 
1774 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3863  serine/threonine protein kinase  24.25 
 
 
1932 aa  131  7.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.16281 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2857  adenylate/guanylate cyclase  24.25 
 
 
1805 aa  131  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3707  protein kinase  32.95 
 
 
348 aa  129  5e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3726  serine/threonine protein kinase  30.4 
 
 
351 aa  128  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2749  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
1320 aa  126  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.750661  normal  0.0664583 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3652  serine/threonine protein kinase  30.14 
 
 
363 aa  125  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.519367  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6020  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.08 
 
 
1666 aa  125  4e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4054  serine/threonine protein kinase  29.67 
 
 
1400 aa  122  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.736762 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3410  PAS sensor protein  27.58 
 
 
1788 aa  120  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1683  PAS sensor protein  25.57 
 
 
1833 aa  117  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.725143 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3995  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  24.48 
 
 
1794 aa  117  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0791  ATP-binding region ATPase domain protein  23.37 
 
 
2051 aa  116  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.417988  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2098  protein kinase  30.15 
 
 
620 aa  116  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4616  PAS sensor protein  27.94 
 
 
1836 aa  115  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1563  multi-sensor signal transduction multi-kinase  24.51 
 
 
1822 aa  114  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0557891 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3586  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 
363 aa  114  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0645  serine/threonine protein kinase  25 
 
 
1644 aa  114  1.0000000000000001e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0171562  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7756  PAS sensor protein  27.39 
 
 
1809 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2960  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  28.61 
 
 
602 aa  112  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.602152  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5621  serine/threonine protein kinase  41.56 
 
 
845 aa  111  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.205775  normal  0.427226 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7753  serine/threonine protein kinase  45.45 
 
 
489 aa  111  9.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.181718  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6208  ATP-binding region ATPase domain protein  25.45 
 
 
1885 aa  111  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4504  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.28 
 
 
1795 aa  111  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.575028 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2181  ATP-binding region ATPase domain protein  24.76 
 
 
1922 aa  109  3e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.116239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4503  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.83 
 
 
1797 aa  109  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.194827  normal  0.137244 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.47 
 
 
1780 aa  108  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2803  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.81 
 
 
1805 aa  108  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.70885 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3772  serine/threonine protein kinase with TPR repeats  37.17 
 
 
863 aa  107  2e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0999  hypothetical protein  23.36 
 
 
2272 aa  107  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.715869 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3632  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 
1340 aa  106  3e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00419397 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4087  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  36 
 
 
1110 aa  105  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4622  multi-sensor signal transduction multi-kinase  25.97 
 
 
1780 aa  105  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.701325  normal  0.952257 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2182  serine/threonine protein kinase  38.79 
 
 
619 aa  104  9e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2738  putative PAS/PAC sensor protein  22.06 
 
 
2077 aa  104  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2438  Serine/threonine protein kinase-like protein  39.63 
 
 
620 aa  103  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00115665 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  22.48 
 
 
1850 aa  103  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7079  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
1643 aa  103  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3088  TPR repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.51 
 
 
943 aa  103  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.258254  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5741  serine/threonine protein kinase  23.56 
 
 
1914 aa  103  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  22.48 
 
 
2361 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2845  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF and PAS/PAC sensor  25.81 
 
 
1934 aa  102  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.218586  normal  0.818872 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  21.29 
 
 
1808 aa  103  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0128  serine/threonine protein kinase  36.81 
 
 
611 aa  102  3e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178932  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5979  serine/threonine protein kinase  31.38 
 
 
1214 aa  102  3e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3968  serine/threonine protein kinase  22 
 
 
1908 aa  102  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.221286 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5744  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.05 
 
 
1845 aa  102  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03300  serine/threonine protein kinase  40 
 
 
651 aa  102  4e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0754  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  36.63 
 
 
757 aa  102  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2107  serine/threonine protein kinase  21.5 
 
 
670 aa  101  7e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.568575 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1401  serine/threonine protein kinase  27.82 
 
 
1333 aa  101  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1938  serine/threonine protein kinase  28.66 
 
 
1346 aa  101  8e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.24353  normal  0.0612241 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  26.11 
 
 
1710 aa  101  9e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2215  serine/threonine protein kinase  33.47 
 
 
1152 aa  100  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.62111 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4709  serine/threonine protein kinase  38.01 
 
 
557 aa  100  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4550  serine/threonine protein kinase  26.94 
 
 
1649 aa  100  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.773527  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3596  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  22.62 
 
 
2017 aa  99.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.107255 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3535  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  23.18 
 
 
1804 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.655347 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2716  serine/threonine protein kinase  36.26 
 
 
919 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1629  hypothetical protein  23.99 
 
 
2279 aa  98.2  8e-19  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00385433 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3043  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  36.81 
 
 
667 aa  97.8  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.756601  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4992  serine/threonine protein kinase  37.34 
 
 
641 aa  97.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000171785  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1945  multi-sensor signal transduction multi-kinase  26.85 
 
 
1832 aa  97.4  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0187004 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3855  serine/threonine protein kinase  34.04 
 
 
1726 aa  97.8  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.993945  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1342  tyrosine protein kinase:Serine/threonine protein kinase  28.74 
 
 
528 aa  96.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.572002  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4605  serine/threonine protein kinase  35.54 
 
 
618 aa  97.1  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000214735  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1346  serine/threonine protein kinase  36.36 
 
 
517 aa  97.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1160  hypothetical protein  23.06 
 
 
2303 aa  96.7  2e-18  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0434  protein kinase  27.69 
 
 
325 aa  96.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.631753  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6332  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 
895 aa  97.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.174056  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5743  ATPase domain-containing protein  26.32 
 
 
1685 aa  96.3  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5384  serine/threonine protein kinase  29.78 
 
 
1109 aa  96.3  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00425552  normal  0.786393 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3011  serine/threonine protein kinase  30.08 
 
 
1637 aa  96.3  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.15444  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  24.17 
 
 
1160 aa  95.9  4e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2428  PAS sensor protein  28.1 
 
 
1837 aa  95.9  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787008  normal  0.842881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1158  serine/threonine protein kinase  34.46 
 
 
647 aa  95.9  5e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.429913  normal  0.143954 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0666  protein kinase  39.1 
 
 
889 aa  95.5  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.415154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2662  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25.36 
 
 
1422 aa  95.5  6e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1450  diguanylate cyclase  23.91 
 
 
1774 aa  95.1  6e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2577  serine/threonine protein kinase  38.69 
 
 
573 aa  95.1  7e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0027  serine/threonine protein kinase  35.12 
 
 
473 aa  95.1  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1658  Sel1-like repeat-containing serine/threonine protein kinase  36.08 
 
 
599 aa  94.7  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0078  serine/threonine protein kinase  35.19 
 
 
382 aa  94.7  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2631  protein kinase  35.05 
 
 
593 aa  94.7  9e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5242  sensor histidine kinase/GAF domain-containing protein  24.02 
 
 
1682 aa  94  1e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.59114  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3222  serine/threonine protein kinase with PASTA sensor(s)  40.56 
 
 
598 aa  94.4  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000113845  normal  0.0300218 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5518  serine/threonine protein kinase  26.85 
 
 
331 aa  94.4  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.889876  normal  0.780623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>