19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8281 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_8281  hypothetical protein  100 
 
 		 701 aa  1329    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0961782  normal  0.672711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0012  transcriptional regulator, LuxR family  34.57 
 
 		 928 aa  62.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.111668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9261  ATPase-like protein  28.33 
 
 		 884 aa  62.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1706  transcriptional regulator, LuxR family  32.68 
 
 		 913 aa  60.8  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.08592 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1890  transcriptional regulator, LuxR family  33.04 
 
 		 929 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.506714  normal  0.719008 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2311  regulatory protein LuxR  37.7 
 
 		 922 aa  59.7  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3871  regulatory protein, LuxR  28.89 
 
 		 913 aa  57.8  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.760244  normal  0.907756 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3419  transcriptional regulator, LuxR family  33.03 
 
 		 909 aa  55.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00522021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5800  ATPase-like protein  29.73 
 
 		 919 aa  53.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.168685 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1214  regulatory protein, LuxR  35.81 
 
 		 930 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.428987 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3624  transcriptional regulator, LuxR family  35.53 
 
 		 927 aa  50.1  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3625  transcriptional regulator, LuxR family  32.76 
 
 		 925 aa  49.7  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0968  transcriptional regulator, LuxR family  32.56 
 
 		 938 aa  48.9  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2697  transcriptional regulator, LuxR family  32.32 
 
 		 910 aa  48.1  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.280211 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2041  transcriptional regulator, LuxR family  32.81 
 
 		 927 aa  47.8  0.0007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111867  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0578  regulatory protein, LuxR  32.81 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353611  normal  0.0294129 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0556  regulatory protein, LuxR  32.81 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.108557 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0566  LuxR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 919 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4229  transcriptional regulator, LuxR family  33.57 
 
 		 923 aa  44.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.099423 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>