241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2887 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010725  Mpop_2887  signal transduction histidine kinase  100 
 
 
233 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.495896  normal  0.813511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2764  HWE histidine kinase  84.62 
 
 
234 aa  388  1e-107  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2991  signal transduction histidine kinase  84.62 
 
 
234 aa  386  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.888175 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0197  putative signal transduction histidine kinase  51.54 
 
 
239 aa  223  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.517969  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2366  signal transduction histidine kinase  54.26 
 
 
225 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.152305  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1440  putative signal transduction histidine kinase  49.79 
 
 
239 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113067 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6262  signal transduction histidine kinase  50.22 
 
 
238 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3755  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  54.87 
 
 
1063 aa  203  2e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6211  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  51.55 
 
 
1061 aa  194  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.820077  normal  0.703655 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4271  histidine kinase  45.36 
 
 
692 aa  160  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305016  normal  0.0625064 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  38.5 
 
 
1111 aa  142  6e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
1096 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  37.56 
 
 
1096 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7977  signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 
1039 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
792 aa  124  9e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6450  signal transduction histidine kinase  36.32 
 
 
635 aa  124  1e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  37.25 
 
 
1202 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  38.34 
 
 
907 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6531  signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
344 aa  118  7e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.14349  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4799  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
620 aa  118  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0108  PAS sensor protein  37.11 
 
 
620 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  35.71 
 
 
500 aa  116  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6264  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.84 
 
 
1163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.66 
 
 
759 aa  115  6e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3000  signal transduction histidine kinase  37.75 
 
 
495 aa  115  6e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.262442 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2364  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
633 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.932865  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
500 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0876  signal transduction histidine kinase  35.1 
 
 
1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.61927  normal  0.464028 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1333  signal transduction histidine kinase  35.08 
 
 
346 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0112868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0915  PAS sensor protein  35.1 
 
 
1132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.476466  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4368  signal transduction histidine kinase  33.01 
 
 
934 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.523014 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 
489 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5922  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 
346 aa  113  3e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.151215  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  33.84 
 
 
1190 aa  113  3e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  34.76 
 
 
1124 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  39.09 
 
 
713 aa  112  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5756  signal transduction histidine kinase  32.18 
 
 
347 aa  112  4.0000000000000004e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.170851  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2103  PAS sensor protein  35.27 
 
 
655 aa  112  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  32.39 
 
 
842 aa  112  5e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
586 aa  111  9e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
372 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4235  signal transduction histidine kinase  36.22 
 
 
496 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.942064  normal  0.0449527 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2379  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
655 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3897  PAS sensor protein  32.06 
 
 
930 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.240133 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  33.18 
 
 
499 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  32.06 
 
 
930 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3090  signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 
575 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0895303  normal  0.0359946 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  36.55 
 
 
507 aa  108  9.000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 
571 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6181  signal transduction histidine kinase  34.36 
 
 
1191 aa  107  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.299797 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 
488 aa  108  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3364  signal transduction histidine kinase  34.9 
 
 
550 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308249  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  34.69 
 
 
662 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3444  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
572 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.753856 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 
601 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 
728 aa  106  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2182  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
528 aa  106  3e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  35.35 
 
 
728 aa  106  4e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3666  signal transduction histidine kinase  34.74 
 
 
550 aa  106  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0123232  normal  0.85719 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  38.78 
 
 
713 aa  105  5e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 
725 aa  105  5e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  38.58 
 
 
717 aa  105  5e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
583 aa  105  8e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  33.67 
 
 
583 aa  105  8e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  34.18 
 
 
583 aa  105  8e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
850 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 
577 aa  104  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1390  signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
484 aa  103  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.38029 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1337  signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
356 aa  103  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.552854 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 
489 aa  103  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5237  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.32 
 
 
1324 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.395635 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1753  sensor histidine kinase  35.21 
 
 
364 aa  103  3e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.405521 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0798  PAS sensor protein  33.85 
 
 
624 aa  103  3e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  33.68 
 
 
505 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2055  signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
655 aa  102  6e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.429948  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  30.26 
 
 
844 aa  102  7e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
387 aa  101  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.75 
 
 
844 aa  101  9e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
571 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1301  signal transduction histidine kinase  33.64 
 
 
588 aa  100  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  32.83 
 
 
872 aa  100  3e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3338  hypothetical protein  34.36 
 
 
333 aa  99.8  3e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.815822  normal  0.18159 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  34.38 
 
 
1167 aa  99.4  4e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  31.41 
 
 
478 aa  99.8  4e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  31.58 
 
 
561 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  31.63 
 
 
503 aa  99.4  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 
352 aa  99.4  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
1160 aa  99  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
555 aa  99  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  32.63 
 
 
480 aa  99  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1297  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
1168 aa  98.6  7e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1888  PAS sensor protein  30.84 
 
 
326 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5794  signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 
717 aa  98.2  9e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.63151  normal  0.343732 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.78 
 
 
846 aa  97.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  32.84 
 
 
852 aa  98.2  1e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 
738 aa  97.4  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  32.47 
 
 
929 aa  97.1  2e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.25 
 
 
847 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
840 aa  96.3  4e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 
602 aa  96.3  4e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>