More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0942 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007512  Plut_0942  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
1009 aa  2077    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.808539  normal  0.370393 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
1273 aa  545  1e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.98 
 
 
1148 aa  300  8e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.5 
 
 
1501 aa  248  3e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.15 
 
 
1714 aa  226  2e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.32 
 
 
1418 aa  223  1.9999999999999999e-56  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.15 
 
 
1432 aa  220  1e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
2693 aa  211  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.48 
 
 
3706 aa  210  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0198  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.31 
 
 
1344 aa  191  5e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.592297 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.19 
 
 
1965 aa  191  5.999999999999999e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.23 
 
 
1051 aa  185  3e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.74 
 
 
1086 aa  185  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  26.38 
 
 
1561 aa  182  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.97 
 
 
1342 aa  179  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
1001 aa  178  5e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  25.17 
 
 
1086 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  28.16 
 
 
1041 aa  172  2e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
1002 aa  173  2e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.17 
 
 
1669 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.03 
 
 
1092 aa  173  2e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  29.03 
 
 
1654 aa  172  3e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1887  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.08 
 
 
1092 aa  172  3e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 
1297 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  27.91 
 
 
1016 aa  170  1e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 
1808 aa  168  5e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  29 
 
 
1182 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3519  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 
987 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3777  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 
1068 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0640729  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
897 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4812  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.08 
 
 
1423 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.330918  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
1178 aa  166  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1983  sensory box protein  26.5 
 
 
1136 aa  164  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3543  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 
1603 aa  164  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00143205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6278  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.74 
 
 
1064 aa  162  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.719663  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.57 
 
 
902 aa  162  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3776  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  26.08 
 
 
1098 aa  161  6e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1024  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.87 
 
 
682 aa  160  1e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000464711  normal  0.0237782 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
1562 aa  160  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1514  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.74 
 
 
1098 aa  159  2e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  23.4 
 
 
1741 aa  159  4e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0136  diguanylate cyclase  30.97 
 
 
1428 aa  157  7e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
1060 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2246  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.36 
 
 
1084 aa  157  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.692403 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  27.89 
 
 
1210 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0378  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
686 aa  155  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1913  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.54 
 
 
1118 aa  155  4e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1546  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.57 
 
 
1098 aa  155  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.223692 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1901  two-component sensor histidine kinase  24.48 
 
 
931 aa  155  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0313083  normal  0.0871787 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.17 
 
 
1471 aa  154  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 
1015 aa  153  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  26.69 
 
 
1969 aa  152  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 
759 aa  151  5e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  26.29 
 
 
1303 aa  149  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.13 
 
 
833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2815  sensory box histidine kinase  26.9 
 
 
749 aa  148  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2852  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.19 
 
 
1057 aa  145  3e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  33.44 
 
 
582 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.3 
 
 
1211 aa  145  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 
1676 aa  144  6e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0294  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.6 
 
 
799 aa  143  9.999999999999999e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.190357  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
745 aa  143  1.9999999999999998e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2607  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.25 
 
 
1144 aa  143  1.9999999999999998e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2839  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1478 aa  143  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.95588 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  26.58 
 
 
872 aa  142  3e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
1259 aa  142  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.96 
 
 
865 aa  141  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  23.97 
 
 
1037 aa  140  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  24.36 
 
 
613 aa  138  4e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.48 
 
 
891 aa  137  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
1076 aa  136  3e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0386  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.28 
 
 
674 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.963585  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  24.05 
 
 
945 aa  135  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2003  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.05 
 
 
1109 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.83 
 
 
767 aa  135  5e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
1013 aa  134  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3217  two-component sensor histidine kinase  23.13 
 
 
725 aa  134  6.999999999999999e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.672415 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.9 
 
 
1391 aa  134  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0687  putative PAS/PAC sensor protein  25.44 
 
 
914 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000503319  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5239  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.43 
 
 
869 aa  133  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0570546 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3072  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
689 aa  133  2.0000000000000002e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0145505 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1170  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.56 
 
 
817 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1041  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.19 
 
 
1406 aa  133  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.845277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3902  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.45 
 
 
990 aa  132  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.87 
 
 
1211 aa  132  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.79 
 
 
1977 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1714  putative PAS/PAC sensor protein  27.06 
 
 
920 aa  132  4.0000000000000003e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.183434  normal  0.382108 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1098  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 
633 aa  131  7.000000000000001e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0013981  normal  0.70416 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2200  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.43 
 
 
678 aa  130  1.0000000000000001e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.541226  hitchhiker  0.00764394 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.39 
 
 
1111 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.04 
 
 
944 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.93 
 
 
969 aa  130  2.0000000000000002e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.98 
 
 
883 aa  129  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.19 
 
 
1202 aa  129  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.95 
 
 
1267 aa  129  4.0000000000000003e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 
1121 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  30.21 
 
 
586 aa  128  6e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.01 
 
 
955 aa  128  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2292  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
793 aa  127  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0423  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.44 
 
 
510 aa  127  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>