More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2070 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2070  sensory transduction histidine kinase  100 
 
 
594 aa  1221    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.965046 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1045  hypothetical protein  61.2 
 
 
506 aa  559  1e-158  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1694  PAS sensor protein  47.22 
 
 
431 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.0000000092635  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0217  multi-sensor protein  43.31 
 
 
852 aa  247  4e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000331603  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2999  hypothetical protein  40.46 
 
 
329 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91602  decreased coverage  0.000583467 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2473  hypothetical protein  44.93 
 
 
291 aa  243  5e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.548725  normal  0.0131498 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2998  hypothetical protein  39.03 
 
 
326 aa  239  9e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.00400405 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  36.71 
 
 
1116 aa  207  6e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  41.36 
 
 
834 aa  141  3e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  41.78 
 
 
783 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0842  multisensor signal transduction histidine kinase  44.65 
 
 
727 aa  134  5e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2293  PAS sensor protein  29.12 
 
 
302 aa  134  6e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0726187  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 
631 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  41.46 
 
 
1274 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0312  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 
556 aa  128  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  39.87 
 
 
744 aa  123  9e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.38 
 
 
1239 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
763 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.172925  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2709  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.44 
 
 
812 aa  120  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.601691  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2089  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.62 
 
 
802 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0236176  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
1255 aa  118  3e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
1093 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  27.23 
 
 
1093 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.83 
 
 
1418 aa  114  6e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1077  sensory box/GGDEF family protein  36.81 
 
 
808 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.61 
 
 
969 aa  110  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
2693 aa  109  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.04 
 
 
1291 aa  108  3e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  25.14 
 
 
1187 aa  106  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2355  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.76 
 
 
902 aa  105  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.415333  normal  0.408426 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5190  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.42 
 
 
1211 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.8862  normal  0.202649 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  36.05 
 
 
1113 aa  104  5e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  23.4 
 
 
694 aa  103  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.66 
 
 
769 aa  102  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1939  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  32.69 
 
 
1328 aa  101  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.282055  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.72 
 
 
1741 aa  101  4e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
3706 aa  100  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0856  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.47 
 
 
893 aa  99.8  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.81 
 
 
841 aa  99  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
1211 aa  99.4  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.125854  normal  0.0422439 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  27.08 
 
 
711 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
765 aa  97.8  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.69 
 
 
721 aa  97.4  7e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.146546  normal  0.0234435 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2764  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1275 aa  96.7  1e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0647988  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.12 
 
 
1977 aa  96.7  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.59 
 
 
1791 aa  95.9  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  24.71 
 
 
1654 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
896 aa  95.5  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.5 
 
 
1273 aa  95.9  2e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.3 
 
 
1363 aa  95.5  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  31.38 
 
 
654 aa  95.1  3e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  25.41 
 
 
759 aa  94.7  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.65 
 
 
1676 aa  94  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
655 aa  94  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  25.99 
 
 
658 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2935  sensory transduction histidine kinase  23.82 
 
 
892 aa  91.7  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0108419  normal  0.0385268 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1321  HD-GYP domain-containing protein  30 
 
 
848 aa  91.7  4e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  24.44 
 
 
1079 aa  90.9  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0700  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.12 
 
 
1419 aa  89.7  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.81616  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1787  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.1 
 
 
931 aa  89.4  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  27.87 
 
 
1560 aa  89  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3193  putative PAS/PAC sensor protein  23.98 
 
 
969 aa  89  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3883  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.01 
 
 
882 aa  89  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.045721 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1808 aa  88.2  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.88 
 
 
1501 aa  89  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6856  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
1000 aa  88.2  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  23.66 
 
 
1182 aa  87.8  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.91 
 
 
1369 aa  87.8  5e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.49 
 
 
1432 aa  87.8  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.66 
 
 
1138 aa  87.4  7e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2002  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 
761 aa  87.4  7e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.897805  normal  0.398669 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  20.98 
 
 
886 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
582 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2307  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 
551 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.71 
 
 
904 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2359  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 
767 aa  84.7  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  26.49 
 
 
1210 aa  84  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1927 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1122 aa  83.2  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.66 
 
 
1471 aa  83.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3300  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.47 
 
 
745 aa  82.8  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.705901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.49 
 
 
1428 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.73 
 
 
1013 aa  82  0.00000000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
1121 aa  81.3  0.00000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0090  diguanylate cyclase  27.11 
 
 
420 aa  80.9  0.00000000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.260319  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.43 
 
 
1094 aa  80.9  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
830 aa  80.5  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.68 
 
 
1297 aa  80.5  0.00000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
1002 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  22.07 
 
 
1561 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.85 
 
 
1765 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0386  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.81 
 
 
1342 aa  79.7  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  27.24 
 
 
1589 aa  79  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.82 
 
 
1643 aa  79.7  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  34.07 
 
 
1141 aa  79.3  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2699  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.06 
 
 
1248 aa  78.6  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
1325 aa  79  0.0000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1715  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  19.95 
 
 
791 aa  78.2  0.0000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.680174 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2010  putative PAS/PAC sensor protein  21.89 
 
 
462 aa  78.2  0.0000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.86 
 
 
1051 aa  77.8  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>