More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0011 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
969 aa  2011    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  37.48 
 
 
1019 aa  331  5.0000000000000004e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  32.09 
 
 
554 aa  218  4e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  42.37 
 
 
1182 aa  209  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
1465 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2814  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 
1335 aa  180  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.988399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.53 
 
 
1741 aa  177  9.999999999999999e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.74 
 
 
1032 aa  175  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.33 
 
 
1015 aa  174  1e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  31.82 
 
 
1248 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  58.93 
 
 
1177 aa  164  5.0000000000000005e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.49 
 
 
647 aa  163  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.94 
 
 
1055 aa  162  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  52.71 
 
 
647 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.12 
 
 
1113 aa  160  8e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  36.88 
 
 
935 aa  159  2e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.12 
 
 
1108 aa  159  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 
1383 aa  159  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  25.68 
 
 
925 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.83 
 
 
1267 aa  156  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  57.14 
 
 
527 aa  152  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
705 aa  151  6e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  23.38 
 
 
821 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
705 aa  140  1e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.62 
 
 
1535 aa  140  1e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  40 
 
 
508 aa  138  5e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  48.59 
 
 
1714 aa  138  6.0000000000000005e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2727  multi-sensor signal transduction histidine kinase  50.43 
 
 
576 aa  136  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 
1329 aa  135  5e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  24.83 
 
 
1113 aa  134  7.999999999999999e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3347  sensor histidine kinase  23.53 
 
 
1020 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.47 
 
 
1578 aa  133  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.34 
 
 
1611 aa  132  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  24.6 
 
 
479 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2975  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.43 
 
 
1084 aa  129  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
968 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  26.05 
 
 
558 aa  128  5e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
1927 aa  127  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3640  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  28.62 
 
 
1303 aa  127  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.581797 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
882 aa  123  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  25.32 
 
 
690 aa  124  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
605 aa  122  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  23.59 
 
 
1390 aa  120  7.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.05 
 
 
1559 aa  120  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  27.85 
 
 
1346 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
1297 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1019  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 
869 aa  118  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1191  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.5 
 
 
836 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.668547  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
715 aa  117  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2654  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  44.07 
 
 
1251 aa  117  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.256644  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0364  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
1013 aa  115  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0207  protein phosphatase 2C-like, stage II sporulation E  24.67 
 
 
684 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.543577  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.52 
 
 
832 aa  115  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4259  PAS sensor protein  27.15 
 
 
1086 aa  115  5e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.127746 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4625  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.15 
 
 
1092 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4776  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.09 
 
 
1086 aa  114  8.000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.108623  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
1021 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.15 
 
 
1266 aa  114  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2092  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.7 
 
 
841 aa  111  6e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0705515  normal  0.145006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.83 
 
 
809 aa  111  7.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0825  signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 
455 aa  110  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.111815  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3102  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  27.08 
 
 
1418 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 
1291 aa  110  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0436  PAS sensor protein  41.96 
 
 
359 aa  109  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.631329 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0470  signal transduction histidine kinase  41.96 
 
 
359 aa  109  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.905992  normal  0.146486 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0507  signal transduction histidine kinase  40.16 
 
 
359 aa  109  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.918852  normal  0.0364855 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  22.55 
 
 
1061 aa  109  3e-22  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.51 
 
 
1080 aa  108  3e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  41.98 
 
 
576 aa  108  5e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.58 
 
 
1059 aa  108  6e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2523  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.9 
 
 
1194 aa  108  7e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1121  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.63 
 
 
1513 aa  107  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.34 
 
 
976 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 
1426 aa  107  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.47 
 
 
878 aa  106  2e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.25 
 
 
1820 aa  104  7e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  25.12 
 
 
445 aa  104  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3202  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
896 aa  104  8e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2112  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.39 
 
 
836 aa  104  1e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.25 
 
 
1078 aa  103  1e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 
1253 aa  103  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  23.72 
 
 
1289 aa  102  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.13 
 
 
1301 aa  102  3e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  26.37 
 
 
424 aa  102  3e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.22 
 
 
955 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
933 aa  101  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1811  diguanylate cyclase  34.3 
 
 
1037 aa  102  5e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.688838  normal  0.296213 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4958  signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 
363 aa  101  5e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000385226 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4215  signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
582 aa  101  6e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0433147 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.06 
 
 
1011 aa  101  7e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.22 
 
 
801 aa  101  7e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4177  signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
341 aa  101  8e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 
873 aa  101  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25270  sensory histidine protein kinase  27.5 
 
 
600 aa  101  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 
1439 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.39 
 
 
1406 aa  100  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.367834  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  24.17 
 
 
477 aa  99.8  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  23.53 
 
 
535 aa  100  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3427  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  24.23 
 
 
2031 aa  99.4  3e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0889636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 
891 aa  99.4  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>