More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3675 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3675  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
966 aa  1966    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  34.54 
 
 
1141 aa  458  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.5 
 
 
1120 aa  426  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2249  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.68 
 
 
1143 aa  427  1e-118  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.673162  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.43 
 
 
1044 aa  405  1e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2504  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.39 
 
 
1132 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
1128 aa  402  9.999999999999999e-111  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25170  hybrid histidine kinase  47.88 
 
 
642 aa  387  1e-106  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 
1121 aa  383  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1688  PAS sensor protein  38.9 
 
 
823 aa  357  5.999999999999999e-97  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.54 
 
 
874 aa  355  2e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0791  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1118 aa  350  9e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  40.23 
 
 
1111 aa  349  2e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3232  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.46 
 
 
1118 aa  349  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3335  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.91 
 
 
1122 aa  347  8e-94  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.47 
 
 
881 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  38.28 
 
 
1193 aa  334  4e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0664  ATP-binding region, ATPase-like protein  46.7 
 
 
853 aa  328  3e-88  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.08 
 
 
940 aa  322  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
767 aa  322  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.08 
 
 
738 aa  321  5e-86  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.31 
 
 
896 aa  320  7e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.39 
 
 
882 aa  317  6e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
866 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2114  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.87 
 
 
674 aa  316  9.999999999999999e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2140  fused multi-sensor protein  33.96 
 
 
882 aa  311  5e-83  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.236911  normal  0.359885 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
947 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0342  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
827 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.52 
 
 
995 aa  307  7e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2954  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.43 
 
 
1127 aa  307  8.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.25 
 
 
957 aa  306  9.000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.53 
 
 
898 aa  306  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.38 
 
 
1007 aa  305  2.0000000000000002e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.47 
 
 
902 aa  305  3.0000000000000004e-81  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.94 
 
 
1068 aa  305  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.48 
 
 
1055 aa  304  5.000000000000001e-81  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.76 
 
 
827 aa  304  5.000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.31 
 
 
785 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 
1116 aa  303  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1287 aa  301  4e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1707  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
1313 aa  301  6e-80  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.28 
 
 
1090 aa  300  7e-80  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
902 aa  300  8e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3026  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.27 
 
 
969 aa  300  1e-79  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.65 
 
 
1090 aa  300  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.65 
 
 
973 aa  298  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5573  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.26 
 
 
1203 aa  298  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.805596  normal  0.315829 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  38.35 
 
 
772 aa  297  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3346  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.09 
 
 
781 aa  297  7e-79  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.570391  normal  0.852351 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3450  Hpt sensor hybrid histidine kinase  39.38 
 
 
718 aa  296  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000325842 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  41.85 
 
 
882 aa  295  3e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.69 
 
 
647 aa  294  5e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0077  histidine kinase  43.81 
 
 
661 aa  294  6e-78  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.131853 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.92 
 
 
916 aa  293  9e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0564  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.59 
 
 
627 aa  293  9e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.211254  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3965  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.63 
 
 
1158 aa  292  2e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.342093 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1451  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
877 aa  292  3e-77  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
667 aa  291  3e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0811  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.57 
 
 
724 aa  291  4e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1302  sensor histidine kinase/response regulator  40.5 
 
 
835 aa  290  9e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.924984  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.5 
 
 
639 aa  290  1e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.01 
 
 
1199 aa  290  1e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1177 aa  289  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  42 
 
 
982 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3271  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.77 
 
 
1691 aa  288  2.9999999999999996e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1746  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
903 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3189  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.35 
 
 
1075 aa  288  4e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
743 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.84 
 
 
1548 aa  287  8e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0219  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.4 
 
 
1452 aa  286  1.0000000000000001e-75  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.23 
 
 
1070 aa  286  1.0000000000000001e-75  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.52 
 
 
801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0620  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.83 
 
 
645 aa  286  1.0000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2468  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1049 aa  286  2.0000000000000002e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.858637  normal  0.0946099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0361  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.26 
 
 
647 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00025473 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  35.19 
 
 
606 aa  285  3.0000000000000004e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.55 
 
 
772 aa  285  4.0000000000000003e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3329  hybrid sensor and regulator fused  35.01 
 
 
968 aa  284  4.0000000000000003e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  41.36 
 
 
666 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  43.81 
 
 
631 aa  284  6.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  34.13 
 
 
1560 aa  284  7.000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1989  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.38 
 
 
1195 aa  283  9e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.74 
 
 
969 aa  283  9e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3783  histidine kinase  41.38 
 
 
544 aa  283  1e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.401083  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1227  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.23 
 
 
1229 aa  283  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0484  multi-sensor histidine kinase  40.36 
 
 
1255 aa  283  1e-74  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.908962 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
957 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2222  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.93 
 
 
1120 aa  282  2e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.201183 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2508  putative PAS/PAC sensor protein  48.47 
 
 
433 aa  282  2e-74  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.0530113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2532  histidine kinase  40.46 
 
 
399 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0679268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.84 
 
 
939 aa  281  4e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.660448  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4585  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.42 
 
 
1350 aa  281  6e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.20208  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2847  PAS  35.77 
 
 
764 aa  280  9e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.445085  normal  0.0351705 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2684  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  44.64 
 
 
645 aa  280  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1217  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
803 aa  279  1e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.503931  normal  0.0882093 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
780 aa  279  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  40.83 
 
 
1331 aa  279  2e-73  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.57 
 
 
1267 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.04 
 
 
763 aa  278  3e-73  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3416  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.95 
 
 
878 aa  278  4e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>