161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_3065 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 770 aa  1553    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  69.23 
 
 		 677 aa  456  1e-127  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  38.05 
 
 		 532 aa  204  6e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 1071 aa  187  9e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  36.3 
 
 		 737 aa  182  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 		 807 aa  174  5.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.34 
 
 		 598 aa  174  7.999999999999999e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  35.37 
 
 		 1969 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 		 952 aa  169  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 		 750 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 		 834 aa  166  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  28.6 
 
 		 781 aa  163  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  27.5 
 
 		 919 aa  155  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 537 aa  154  8e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  32.46 
 
 		 994 aa  153  1e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.51 
 
 		 728 aa  152  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  34.53 
 
 		 524 aa  152  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  34.06 
 
 		 680 aa  150  6e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  32.86 
 
 		 843 aa  143  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 		 991 aa  142  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  32.94 
 
 		 1260 aa  138  3.0000000000000003e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  31.16 
 
 		 553 aa  138  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  31.19 
 
 		 1589 aa  135  3.9999999999999996e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.39 
 
 		 700 aa  134  7.999999999999999e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  30.34 
 
 		 896 aa  131  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.73 
 
 		 564 aa  130  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  31.29 
 
 		 1059 aa  130  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.11 
 
 		 637 aa  126  2e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 		 1081 aa  125  4e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.23 
 
 		 712 aa  124  6e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  26.96 
 
 		 644 aa  124  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 		 1216 aa  120  9.999999999999999e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 		 1073 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 		 982 aa  108  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  29.07 
 
 		 1154 aa  94.7  6e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  28.17 
 
 		 666 aa  91.7  5e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  29.95 
 
 		 449 aa  86.7  0.000000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.68 
 
 		 233 aa  85.5  0.000000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.32 
 
 		 251 aa  80.9  0.00000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2581  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.29 
 
 		 1066 aa  72.8  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0010376 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  26.67 
 
 		 242 aa  73.2  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.47 
 
 		 238 aa  72  0.00000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1404  diguanylate cyclase  34.85 
 
 		 305 aa  72  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 1276 aa  71.6  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  39.81 
 
 		 379 aa  69.3  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1075  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.36 
 
 		 758 aa  68.2  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.469487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1797  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.71 
 
 		 324 aa  67.8  0.0000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.504833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0759  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.82 
 
 		 718 aa  64.3  0.000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1354  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.71 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 3706 aa  63.5  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1864  putative diguanylate cyclase  32.19 
 
 		 882 aa  63.2  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.327534  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3542  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 464 aa  62  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743078  normal  1 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  30.28 
 
 		 2361 aa  61.6  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 		 829 aa  61.2  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  33.33 
 
 		 1101 aa  60.8  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  28.74 
 
 		 526 aa  61.2  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28 
 
 		 1027 aa  60.8  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 		 1040 aa  59.3  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  23.67 
 
 		 539 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0796  GGDEF family protein  24.81 
 
 		 303 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2545  diguanylate cyclase  26.95 
 
 		 301 aa  56.2  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004464  sensory box/GGDEF family protein  29.66 
 
 		 582 aa  56.6  0.000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.845527  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1847  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 509 aa  56.6  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.645356  normal  0.352228 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 595 aa  55.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.27 
 
 		 1166 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  26.23 
 
 		 433 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  29.03 
 
 		 595 aa  55.1  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002693  putative GGDEF family protein  23.17 
 
 		 306 aa  54.7  0.000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1119  diguanylate cyclase  30 
 
 		 325 aa  54.7  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.282481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.96 
 
 		 1166 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  33.07 
 
 		 1317 aa  53.9  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 		 612 aa  53.9  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  28.23 
 
 		 590 aa  53.9  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.54 
 
 		 228 aa  53.9  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2616  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.17 
 
 		 204 aa  52.8  0.00002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.417576  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  30.95 
 
 		 562 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00930  hypothetical protein  28.81 
 
 		 581 aa  53.1  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  28.23 
 
 		 595 aa  52.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 509 aa  52.8  0.00003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 595 aa  52.8  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 595 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 499 aa  52.4  0.00003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.09 
 
 		 871 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 		 633 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 595 aa  52.8  0.00003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1680  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.91 
 
 		 208 aa  52.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.744981 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.78 
 
 		 474 aa  52  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3020  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 483 aa  51.2  0.00007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.670561  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1931  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  29.66 
 
 		 1289 aa  50.8  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0959119  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3320  diguanylate cyclase  24.06 
 
 		 302 aa  51.2  0.00008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1126  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.74 
 
 		 218 aa  51.2  0.00008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0633  diguanylate cyclase  24.06 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.4362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3488  diguanylate cyclase  24.06 
 
 		 302 aa  50.4  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.464189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00176  diguanylate cyclase  25.55 
 
 		 354 aa  50.4  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  28.23 
 
 		 595 aa  50.8  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  30.38 
 
 		 212 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1898  diguanylate cyclase  27.07 
 
 		 300 aa  49.3  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.693267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0821  putative PAS/PAC sensor protein  27.66 
 
 		 715 aa  50.1  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.99772  normal  0.688187 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.23 
 
 		 755 aa  49.7  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4262  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.93 
 
 		 269 aa  49.7  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>