164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_5264 on replicon NC_013747
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013747  Htur_5264  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 1073 aa  2060    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.255684  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3054  putative PAS/PAC sensor protein  36.72 
 
 		 1260 aa  578  1.0000000000000001e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2128  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 		 1059 aa  322  3e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0043  putative PAS/PAC sensor protein  28.83 
 
 		 1216 aa  272  2e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4080  putative PAS/PAC sensor protein  34.4 
 
 		 1081 aa  244  5e-63  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4113  putative PAS/PAC sensor protein  34.03 
 
 		 896 aa  241  4e-62  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0150  putative PAS/PAC sensor protein  34.12 
 
 		 1969 aa  239  3e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4116  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 982 aa  238  4e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.147835  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2813  putative PAS/PAC sensor protein  38.66 
 
 		 991 aa  234  6e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  32.83 
 
 		 1589 aa  226  2e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3382  putative PAS/PAC sensor protein  29.12 
 
 		 952 aa  217  9e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0683  putative PAS/PAC sensor protein  30.59 
 
 		 750 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987157  normal  0.214918 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0128  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  31.77 
 
 		 728 aa  211  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0709  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  33 
 
 		 564 aa  208  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2692  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  32.66 
 
 		 637 aa  192  2e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4272  putative PAS/PAC sensor protein  32.53 
 
 		 919 aa  190  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.312579  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1541  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 		 1071 aa  179  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0348  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  28.66 
 
 		 700 aa  171  5e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0977  putative PAS/PAC sensor protein  31.85 
 
 		 737 aa  169  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2147  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  29.2 
 
 		 712 aa  167  1.0000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1371  putative PAS/PAC sensor protein  31.59 
 
 		 834 aa  165  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3482  putative PAS/PAC sensor protein  32.41 
 
 		 994 aa  164  9e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3905  putative PAS/PAC sensor protein  31.06 
 
 		 537 aa  164  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1747  putative PAS/PAC sensor protein  32.78 
 
 		 524 aa  159  3e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3168  putative PAS/PAC sensor protein  29.63 
 
 		 807 aa  157  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2698  putative PAS/PAC sensor protein  31.47 
 
 		 553 aa  156  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1262  putative PAS/PAC sensor protein  30.19 
 
 		 532 aa  154  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4237  putative PAS/PAC sensor protein  25.43 
 
 		 843 aa  141  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.28007  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5215  putative PAS/PAC sensor protein  32.74 
 
 		 677 aa  139  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3065  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 		 770 aa  136  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0662  putative PAS/PAC sensor protein  28.5 
 
 		 644 aa  132  4.0000000000000003e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0317  bacterio-opsin activator  31.52 
 
 		 680 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.331726  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1305  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  32.16 
 
 		 598 aa  119  3e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0011  putative PAS/PAC sensor protein  29.92 
 
 		 781 aa  119  3.9999999999999997e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.206274  normal  0.555511 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3274  response regulator receiver protein  28.92 
 
 		 539 aa  113  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1012  putative PAS/PAC sensor protein  30.09 
 
 		 1154 aa  111  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0819572  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1035  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  29.03 
 
 		 242 aa  106  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0557588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3712  putative PAS/PAC sensor protein  33.19 
 
 		 379 aa  101  6e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2079  putative PAS/PAC sensor protein  27.55 
 
 		 666 aa  99.4  3e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0273003  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3379  putative PAS/PAC sensor protein  30.26 
 
 		 449 aa  95.1  7e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2671  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  27.62 
 
 		 251 aa  83.2  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1537  putative PAS/PAC sensor protein  26.63 
 
 		 636 aa  80.5  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1325  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  28.94 
 
 		 233 aa  80.5  0.0000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1336  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  31.28 
 
 		 238 aa  75.5  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.292593  normal  0.783067 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3657  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.9 
 
 		 478 aa  71.2  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 642 aa  70.1  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2051  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 		 748 aa  68.2  0.0000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.167205 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0496  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 896 aa  67.4  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1670  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 		 632 aa  66.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0209  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 		 546 aa  64.7  0.00000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3535  putative PAS/PAC sensor protein  23.53 
 
 		 684 aa  63.9  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2025  putative PAS/PAC sensor protein  31.43 
 
 		 930 aa  62.8  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.76545  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.46 
 
 		 1466 aa  62.4  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0906  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.69 
 
 		 1195 aa  61.6  0.00000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0665  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  30.43 
 
 		 1051 aa  61.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.63 
 
 		 921 aa  61.2  0.0000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.627886  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25 
 
 		 1054 aa  60.5  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4378  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.04 
 
 		 773 aa  60.5  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0320  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  34.68 
 
 		 211 aa  60.1  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.495226  normal  0.0608839 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0458  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.92 
 
 		 1037 aa  59.7  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.160814  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0622  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 440 aa  59.7  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.06 
 
 		 1094 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2110  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 		 789 aa  58.9  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.377648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1502  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.21 
 
 		 783 aa  58.5  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0445794 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0019  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  47.37 
 
 		 228 aa  58.9  0.0000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2409  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.82 
 
 		 759 aa  58.5  0.0000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.456195  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3908  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  46.43 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.40887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1415  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  42.86 
 
 		 216 aa  57  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  29.09 
 
 		 632 aa  56.2  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.4 
 
 		 1758 aa  55.8  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4262  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.2 
 
 		 861 aa  55.8  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0011  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  22.29 
 
 		 952 aa  55.5  0.000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1708  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.09 
 
 		 869 aa  55.5  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0338  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 653 aa  55.1  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.94 
 
 		 1325 aa  54.7  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1728  putative PAS/PAC sensor protein  27.33 
 
 		 1171 aa  54.3  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00367624  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2725  diguanylate cyclase  25 
 
 		 479 aa  53.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.443683  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4980  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.18 
 
 		 771 aa  53.1  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1396  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.67 
 
 		 741 aa  53.9  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.540787  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1643  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.04 
 
 		 633 aa  53.5  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.231435  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0947  putative PAS/PAC sensor protein  29.71 
 
 		 956 aa  53.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.360212  normal  0.074138 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1320  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  21.23 
 
 		 434 aa  53.9  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0691  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  43.64 
 
 		 222 aa  53.5  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.87 
 
 		 1352 aa  53.1  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2711  Bacterio-opsin activator HTH domain protein  40.98 
 
 		 212 aa  53.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.592354  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4276  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.82 
 
 		 779 aa  52.8  0.00004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1043  sensory box histidine kinase  29.63 
 
 		 767 aa  52.4  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.382651  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0428  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.65 
 
 		 989 aa  52.4  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0648  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 661 aa  52  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.173169  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0086  putative PAS/PAC sensor protein  30.77 
 
 		 685 aa  52  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.65346  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3503  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.04 
 
 		 1101 aa  52  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3550  putative PAS/PAC sensor protein  26.04 
 
 		 506 aa  52  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00640923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0805  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with GAF sensor  27.75 
 
 		 706 aa  51.6  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  26.21 
 
 		 1648 aa  51.6  0.00008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0098  putative PAS/PAC sensor protein  31.73 
 
 		 865 aa  51.6  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0698116  normal  0.0487213 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3030  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.89 
 
 		 801 aa  50.8  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4358  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.26 
 
 		 868 aa  50.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0223815  normal  0.0668738 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4329  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.78 
 
 		 683 aa  51.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.213628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.88 
 
 		 905 aa  51.2  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2280  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 821 aa  51.2  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>