More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2875 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
707 aa  1462    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  38.02 
 
 
535 aa  223  8e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
490 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  27.52 
 
 
1113 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  32.19 
 
 
445 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  27.74 
 
 
821 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
432 aa  155  2e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  32.57 
 
 
558 aa  154  5.9999999999999996e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  30.47 
 
 
477 aa  142  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  22.31 
 
 
690 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  28.99 
 
 
605 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
651 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.5 
 
 
968 aa  124  8e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  29.11 
 
 
715 aa  123  9e-27  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  40.91 
 
 
449 aa  123  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  25.96 
 
 
883 aa  122  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 
439 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  21.64 
 
 
925 aa  117  6e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2435  PAS/PAC domain-containing protein  38.12 
 
 
322 aa  117  8.999999999999998e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000625428  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  23.55 
 
 
479 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2388  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.219764  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
805 aa  115  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3517  putative PAS/PAC sensor protein  40.13 
 
 
463 aa  114  7.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.1 
 
 
1439 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
559 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.31 
 
 
1338 aa  112  2.0000000000000002e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
1509 aa  113  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.66 
 
 
971 aa  112  3e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.37 
 
 
759 aa  111  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
844 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
844 aa  108  3e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  28.88 
 
 
468 aa  108  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 
761 aa  108  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.56 
 
 
472 aa  107  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.02 
 
 
1692 aa  107  8e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.81 
 
 
853 aa  107  9e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  26.59 
 
 
423 aa  106  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.1 
 
 
1040 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
1168 aa  106  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  33.18 
 
 
565 aa  106  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
626 aa  105  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
3706 aa  105  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 
1329 aa  105  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.29 
 
 
827 aa  104  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  39.53 
 
 
878 aa  101  4e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
1325 aa  100  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 
781 aa  100  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1309 aa  99  3e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.14 
 
 
1158 aa  98.2  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.36 
 
 
1471 aa  98.2  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2366  two component sensor histidine kinase  26.04 
 
 
1154 aa  97.4  8e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0469089  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3668  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 
650 aa  96.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.3 
 
 
869 aa  96.3  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.84 
 
 
890 aa  96.3  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
906 aa  95.1  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0767  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  35.42 
 
 
1278 aa  94.7  5e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.74653 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 
524 aa  94.4  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  25.64 
 
 
969 aa  94.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.17 
 
 
930 aa  94.4  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2963  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  34.48 
 
 
1251 aa  94  9e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.246733 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  22.92 
 
 
1379 aa  93.6  1e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0181  two component signal transduction histidine kinase/response regulator hybrid  25.17 
 
 
749 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.27 
 
 
1253 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 
603 aa  93.2  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
416 aa  92.8  2e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  40.74 
 
 
160 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1199  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 
968 aa  92.8  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0569956 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.76 
 
 
693 aa  92  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.166514  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0802  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.06 
 
 
1413 aa  91.7  5e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.564112  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.71 
 
 
869 aa  90.9  7e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3834  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.43 
 
 
908 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.21 
 
 
1078 aa  90.5  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.71 
 
 
1426 aa  89.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
784 aa  89.7  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 
904 aa  89  3e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.44 
 
 
1121 aa  88.6  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.71 
 
 
965 aa  88.2  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
933 aa  87.8  6e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  29.73 
 
 
589 aa  87.4  9e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  27.49 
 
 
617 aa  86.7  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1062  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.46 
 
 
1027 aa  86.3  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.782086  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2026  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
511 aa  85.9  0.000000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0685118  normal  0.11395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
746 aa  85.5  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
984 aa  85.1  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0839  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 
881 aa  84.7  0.000000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1919  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 
862 aa  84.7  0.000000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.592004  normal  0.385421 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1433  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
974 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.717996  normal  0.840517 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3043  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.55 
 
 
1122 aa  84.3  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000641159  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0974  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.18 
 
 
916 aa  84  0.000000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  24.14 
 
 
2361 aa  83.6  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
921 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.83 
 
 
1301 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.54 
 
 
860 aa  82.4  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.77 
 
 
880 aa  81.6  0.00000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  23.41 
 
 
1248 aa  80.5  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  24.27 
 
 
593 aa  80.5  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2152  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
834 aa  80.5  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116633 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1938  PAS/PAC domain-containing protein  33.56 
 
 
632 aa  80.5  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4860  sensory box histidine kinase  33.33 
 
 
923 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186334  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.1 
 
 
935 aa  79.3  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>