More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1722 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 479 aa  991    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  30.2 
 
 		 690 aa  233  7.000000000000001e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  29.24 
 
 		 605 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 535 aa  174  3.9999999999999995e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  24.6 
 
 		 969 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  24.48 
 
 		 490 aa  123  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  23.55 
 
 		 707 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  25.23 
 
 		 821 aa  99.8  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  22.79 
 
 		 477 aa  95.1  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  23.59 
 
 		 883 aa  95.1  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  26.29 
 
 		 715 aa  92.8  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 1113 aa  92.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 		 565 aa  91.7  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.99 
 
 		 1325 aa  91.3  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  23.94 
 
 		 423 aa  87.8  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.27 
 
 		 559 aa  86.7  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  22.25 
 
 		 445 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 1439 aa  85.1  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 784 aa  84.3  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  26.32 
 
 		 449 aa  82.8  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  24.8 
 
 		 432 aa  83.2  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  23.36 
 
 		 439 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  25.76 
 
 		 468 aa  80.9  0.00000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 		 785 aa  80.5  0.00000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 844 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2598  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.6 
 
 		 661 aa  79  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.6 
 
 		 844 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3193  putative PAS/PAC sensor protein  23.79 
 
 		 969 aa  77.8  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0936  signal transduction histidine kinase  25.68 
 
 		 1177 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.194621  normal  0.0190935 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 		 626 aa  75.9  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0050  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.11 
 
 		 871 aa  75.5  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0971682  decreased coverage  0.000571287 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 		 1039 aa  75.1  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.35 
 
 		 651 aa  75.1  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  32.79 
 
 		 602 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  24.57 
 
 		 1561 aa  74.3  0.000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  32.2 
 
 		 882 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.63 
 
 		 1516 aa  73.9  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  27.42 
 
 		 1207 aa  73.6  0.000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 781 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  20.78 
 
 		 588 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.15 
 
 		 852 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  19.31 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 1040 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  22.6 
 
 		 1560 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 		 856 aa  71.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  22.57 
 
 		 925 aa  71.6  0.00000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  28.67 
 
 		 1289 aa  71.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.81 
 
 		 883 aa  70.9  0.00000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  25.11 
 
 		 593 aa  70.1  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.81 
 
 		 1471 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  29.69 
 
 		 852 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  25.78 
 
 		 853 aa  67.4  0.0000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  23.76 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 		 930 aa  66.6  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 1060 aa  65.9  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 1121 aa  66.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0817518  normal  0.492636 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  31.19 
 
 		 844 aa  65.5  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.19 
 
 		 1012 aa  65.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 472 aa  65.5  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.836728  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2435  PAS/PAC domain-containing protein  25.62 
 
 		 322 aa  65.1  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000625428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  24.84 
 
 		 603 aa  65.1  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  28.39 
 
 		 1209 aa  64.7  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2911  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 642 aa  64.3  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2939  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.48 
 
 		 1279 aa  64.7  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3017  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.82 
 
 		 1669 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 1301 aa  63.9  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.95 
 
 		 416 aa  63.9  0.000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  27.15 
 
 		 451 aa  63.5  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1991  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 1255 aa  63.2  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3872  PAS  27.55 
 
 		 853 aa  62.8  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28 
 
 		 886 aa  63.2  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.257142  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2447  signal transduction protein  22.56 
 
 		 965 aa  62.8  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.936876  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.7 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 		 994 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 		 858 aa  62  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2962  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.55 
 
 		 869 aa  61.6  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0029  hypothetical protein  28.35 
 
 		 976 aa  61.6  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  24.7 
 
 		 886 aa  61.6  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  29.52 
 
 		 907 aa  61.2  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2546  Signal transduction histidine kinase-like protein  21.77 
 
 		 804 aa  61.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.88 
 
 		 869 aa  60.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 		 904 aa  60.5  0.00000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6241  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 748 aa  60.1  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0637  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 921 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  24.8 
 
 		 759 aa  60.1  0.00000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0030  hypothetical protein  27.56 
 
 		 976 aa  59.7  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4360  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.35 
 
 		 338 aa  59.7  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 		 1168 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  29.36 
 
 		 1239 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.53 
 
 		 759 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 		 810 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4990  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 955 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  27.44 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  23.9 
 
 		 1629 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 		 784 aa  58.9  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3111  sensory box histidine kinase  24.39 
 
 		 423 aa  58.2  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.019274  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1138  AraC family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 276 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.283837  normal  0.0213707 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1750  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  22 
 
 		 896 aa  58.2  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.42554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  34.21 
 
 		 160 aa  57.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>