More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_2475 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
626 aa  1278    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1069  putative PAS/PAC sensor protein  36.97 
 
 
348 aa  203  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.149504  normal  0.1643 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  40.13 
 
 
160 aa  139  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  34.23 
 
 
445 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  36 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 
432 aa  128  3e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  33.63 
 
 
477 aa  118  3e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  35.67 
 
 
535 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  31.84 
 
 
449 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
559 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  35.67 
 
 
439 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3263  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.05 
 
 
639 aa  110  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.98 
 
 
836 aa  107  6e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0172365  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  31.7 
 
 
707 aa  105  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  29.17 
 
 
715 aa  100  7e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  32.02 
 
 
821 aa  93.2  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4210  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
1110 aa  92.4  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000219546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
605 aa  91.7  3e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 
925 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
962 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
589 aa  89.7  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  22.9 
 
 
588 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  29.74 
 
 
490 aa  89.4  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  29.35 
 
 
468 aa  87.4  8e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 
1329 aa  85.5  0.000000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.29 
 
 
886 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  26.96 
 
 
969 aa  83.6  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  25.19 
 
 
449 aa  82.4  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
886 aa  82  0.00000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0253  sensory box histidine kinase  32.78 
 
 
830 aa  81.3  0.00000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  27.27 
 
 
593 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  29.01 
 
 
423 aa  77.4  0.0000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2700  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.79 
 
 
1102 aa  77.4  0.0000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0362  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.7 
 
 
890 aa  76.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.190279  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  27.38 
 
 
479 aa  75.9  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 
451 aa  74.3  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1139  putative PAS/PAC sensor protein  26.22 
 
 
378 aa  72  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4225  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.76 
 
 
1322 aa  71.6  0.00000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  26.06 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25 
 
 
1741 aa  70.9  0.00000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3014  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.51 
 
 
1132 aa  70.5  0.00000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.829917  hitchhiker  0.00701741 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2638  signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
1246 aa  68.2  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.406251  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.62 
 
 
911 aa  68.2  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
813 aa  67.4  0.0000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3268  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.94 
 
 
1079 aa  67  0.0000000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  30.84 
 
 
617 aa  66.6  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  27.46 
 
 
524 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2373  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 
769 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  29.63 
 
 
1047 aa  65.9  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.152528  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2088  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  29.63 
 
 
1047 aa  65.5  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.603793  normal  0.591711 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0066  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 
748 aa  64.3  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0371  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.08 
 
 
890 aa  64.7  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.91 
 
 
1079 aa  64.3  0.000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1528  hypothetical protein  33.94 
 
 
200 aa  63.5  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000210266  normal  0.0656807 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.89 
 
 
1252 aa  62.4  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.37 
 
 
801 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3085  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.56 
 
 
905 aa  62.4  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.55 
 
 
1039 aa  62.4  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  31.3 
 
 
690 aa  62.4  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  24.29 
 
 
883 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.42 
 
 
1027 aa  61.6  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 
933 aa  61.2  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1273  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 
1090 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1302  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 
1090 aa  61.2  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0842919  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0926  sensory box protein  22.43 
 
 
1063 aa  58.9  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2132  bacteriophytochrome-like protein  26.34 
 
 
727 aa  58.5  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205555  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1825  putative PAS/PAC sensor protein  22.96 
 
 
642 aa  58.2  0.0000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000986123 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  31.43 
 
 
1535 aa  58.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  32.85 
 
 
832 aa  57.8  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2846  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  30.08 
 
 
1043 aa  57.8  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.698632  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1343  EAL and GGDEF domain-containing protein  21.27 
 
 
1274 aa  57.4  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2048  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.11 
 
 
827 aa  57.4  0.0000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589876  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  25.27 
 
 
637 aa  56.6  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0120  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.04 
 
 
1568 aa  57  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0822  sensory box histidine kinase  28.98 
 
 
729 aa  55.8  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  20.16 
 
 
654 aa  56.2  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.33 
 
 
1301 aa  56.2  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.43 
 
 
890 aa  55.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0271774 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.44 
 
 
1138 aa  56.2  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  27.88 
 
 
1079 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  24.18 
 
 
1346 aa  55.8  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.32 
 
 
1075 aa  55.5  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0339  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
771 aa  55.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.84298 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.72 
 
 
673 aa  55.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2394  putative PAS/PAC sensor protein  21.82 
 
 
642 aa  55.5  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0339768  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  25 
 
 
909 aa  54.7  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1091  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.86 
 
 
424 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  30.37 
 
 
1561 aa  54.7  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.67 
 
 
1000 aa  54.7  0.000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  28.37 
 
 
1289 aa  54.3  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0066  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.47 
 
 
773 aa  54.3  0.000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.712477  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.84 
 
 
991 aa  54.3  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5081  PAS  28.57 
 
 
659 aa  53.9  0.000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.803763  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 
1060 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  27.86 
 
 
888 aa  53.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 
1124 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2487  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.23 
 
 
735 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2637  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.55 
 
 
678 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.5465  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8066  hypothetical protein  35.42 
 
 
314 aa  53.1  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0556463  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2406  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.19 
 
 
773 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>