More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1706 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
605 aa  1241    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  32.93 
 
 
690 aa  276  8e-73  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  29.29 
 
 
479 aa  195  2e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 
535 aa  160  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  29.87 
 
 
707 aa  130  7.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3193  putative PAS/PAC sensor protein  25.27 
 
 
969 aa  130  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  26.52 
 
 
969 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  27.65 
 
 
490 aa  121  3e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  28.01 
 
 
1113 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  22.78 
 
 
821 aa  115  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  25.19 
 
 
715 aa  105  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.95 
 
 
1439 aa  105  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  26.56 
 
 
445 aa  103  9e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  28.1 
 
 
439 aa  99.4  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.96 
 
 
688 aa  97.1  9e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.27 
 
 
651 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  23.71 
 
 
558 aa  94.7  4e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  24.1 
 
 
449 aa  93.6  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 
432 aa  93.2  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  29.17 
 
 
626 aa  92  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  22.7 
 
 
883 aa  91.7  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.38 
 
 
559 aa  91.7  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07820  putative histidine kinase  26.04 
 
 
797 aa  90.9  5e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0365473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0744  sensory box histidine kinase  26.04 
 
 
799 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13864  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 
1080 aa  89.4  2e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
1325 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.73 
 
 
765 aa  88.2  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  28.57 
 
 
853 aa  87.4  6e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_566  sensor histidine kinase  29.76 
 
 
852 aa  87.4  6e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0598  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
852 aa  86.7  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  23.9 
 
 
1239 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
524 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 
565 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2876  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
930 aa  84.3  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.7 
 
 
841 aa  84  0.000000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2435  PAS/PAC domain-containing protein  34.21 
 
 
322 aa  83.2  0.00000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000625428  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  25.94 
 
 
603 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.26 
 
 
785 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
844 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
844 aa  82  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
761 aa  82  0.00000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.7 
 
 
927 aa  82  0.00000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2714  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.13 
 
 
1168 aa  81.3  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.52 
 
 
784 aa  81.6  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0981  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.27 
 
 
1791 aa  81.3  0.00000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 
781 aa  80.1  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 
477 aa  80.1  0.0000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  19.44 
 
 
925 aa  78.6  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  32.67 
 
 
744 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2152  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.79 
 
 
670 aa  77.4  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.381885  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.7 
 
 
799 aa  77  0.0000000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.05 
 
 
1428 aa  77  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3036  sensory transduction histidine kinase  27.35 
 
 
1047 aa  76.6  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00386665  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0741  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.64 
 
 
1193 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000131287 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0693  sensory box histidine kinase  24.72 
 
 
602 aa  74.7  0.000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.958566  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 
1093 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  22.48 
 
 
1093 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0596  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.23 
 
 
1471 aa  75.1  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0266  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
736 aa  74.7  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_93  sensor histidine kinase  30.26 
 
 
759 aa  73.9  0.000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0555  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
416 aa  73.9  0.000000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.564143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.92 
 
 
1039 aa  73.9  0.000000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  28.24 
 
 
1629 aa  73.9  0.000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.3 
 
 
965 aa  73.9  0.000000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.928447  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
1741 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
1042 aa  72.8  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  22.37 
 
 
1207 aa  72.8  0.00000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  29.11 
 
 
1561 aa  72  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
759 aa  71.6  0.00000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 
468 aa  71.6  0.00000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1910  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
994 aa  71.2  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.89 
 
 
655 aa  71.2  0.00000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  31.61 
 
 
878 aa  70.9  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
711 aa  70.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2724  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.78 
 
 
827 aa  70.9  0.00000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.37 
 
 
1043 aa  70.5  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1480  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.49 
 
 
1012 aa  70.1  0.0000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 
1927 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1809  putative PAS/PAC sensor protein  30.04 
 
 
868 aa  70.1  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.109167 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
810 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000530681 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.44 
 
 
1418 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.84 
 
 
1259 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.65 
 
 
801 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.21 
 
 
1094 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4360  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.56 
 
 
338 aa  68.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0290  putative PAS/PAC sensor protein  27.07 
 
 
614 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1414  sensory box histidine kinase/response regulator  25.1 
 
 
844 aa  68.2  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00865388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2281  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.45 
 
 
450 aa  68.2  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3750  PAS:GGDEF  31.37 
 
 
721 aa  67.8  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2588  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.07 
 
 
746 aa  67.8  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.877964  normal  0.574702 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1767  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
1157 aa  67.8  0.0000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.46 
 
 
962 aa  67.8  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
3706 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0912  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
903 aa  67.4  0.0000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.644945  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.06 
 
 
1509 aa  67.4  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.29 
 
 
1121 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
1079 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1289  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
1168 aa  66.6  0.000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.41 
 
 
1143 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4431  signal transduction histidine kinase  27.8 
 
 
767 aa  66.6  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.222195  normal  0.392293 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>