More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1808 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
603 aa  1245    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.1 
 
 
472 aa  221  3.9999999999999997e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.19 
 
 
989 aa  205  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.64 
 
 
989 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.17 
 
 
1325 aa  176  1.9999999999999998e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 
380 aa  174  5.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.46 
 
 
701 aa  170  5e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1622  putative PAS/PAC sensor protein  28.51 
 
 
565 aa  166  1.0000000000000001e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0238251 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  44.81 
 
 
257 aa  165  2.0000000000000002e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.69 
 
 
1439 aa  164  6e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  34.87 
 
 
704 aa  160  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  58.14 
 
 
316 aa  157  6e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  35.71 
 
 
458 aa  157  7e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  34.59 
 
 
429 aa  156  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 
336 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  33.45 
 
 
474 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.85 
 
 
426 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 
499 aa  154  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  44.19 
 
 
429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.26 
 
 
953 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
498 aa  148  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.38 
 
 
455 aa  148  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  32.62 
 
 
783 aa  148  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.82 
 
 
455 aa  147  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
737 aa  146  8.000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  42.38 
 
 
701 aa  145  2e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1755  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.53 
 
 
781 aa  144  3e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.08 
 
 
404 aa  144  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  47.85 
 
 
340 aa  144  5e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.43 
 
 
591 aa  141  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1676  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.45 
 
 
1021 aa  141  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267843  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 
337 aa  141  3e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.72 
 
 
761 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  30.75 
 
 
653 aa  140  4.999999999999999e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
813 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
1134 aa  139  2e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  36.5 
 
 
469 aa  138  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50 
 
 
359 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 
688 aa  137  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  49.64 
 
 
636 aa  136  9e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  29.51 
 
 
655 aa  136  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  39.89 
 
 
258 aa  136  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.23 
 
 
373 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  42.31 
 
 
255 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  35.16 
 
 
273 aa  135  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.84 
 
 
651 aa  135  3e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.58 
 
 
571 aa  134  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 
1741 aa  134  6e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.46 
 
 
461 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  50 
 
 
130 aa  133  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.97 
 
 
377 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.88 
 
 
521 aa  132  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
815 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.42 
 
 
929 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.58 
 
 
916 aa  130  6e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.45 
 
 
1399 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  51.49 
 
 
135 aa  130  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.89 
 
 
561 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  28.37 
 
 
477 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
578 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
1676 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  39.49 
 
 
1113 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  26.95 
 
 
906 aa  128  4.0000000000000003e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  51.61 
 
 
143 aa  127  5e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.25 
 
 
376 aa  127  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  46.76 
 
 
817 aa  127  6e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0537  sensory box/GGDEF family protein  38.04 
 
 
682 aa  127  7e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  50 
 
 
131 aa  127  7e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.24 
 
 
1559 aa  126  9e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1360  signal transduction histidine kinase  40.45 
 
 
524 aa  126  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0984724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1550  putative PAS/PAC sensor protein  43.07 
 
 
556 aa  125  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  29.62 
 
 
535 aa  124  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.22 
 
 
384 aa  124  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  32.54 
 
 
263 aa  124  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
619 aa  124  5e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3447  hypothetical protein  30.51 
 
 
1210 aa  123  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00320271  normal  0.0786508 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  24.37 
 
 
2693 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 
265 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0324  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.11 
 
 
464 aa  120  6e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.44 
 
 
1977 aa  120  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 
355 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6854  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.74 
 
 
886 aa  120  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  48.03 
 
 
352 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  50.78 
 
 
311 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.6 
 
 
1191 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.86 
 
 
386 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  33.01 
 
 
630 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0848  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
844 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
784 aa  119  1.9999999999999998e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0819  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.44 
 
 
844 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2251  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.56 
 
 
351 aa  118  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.258726 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  25.23 
 
 
3706 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  31.48 
 
 
408 aa  117  3.9999999999999997e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1976  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.92 
 
 
1383 aa  118  3.9999999999999997e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.624185 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.28 
 
 
1078 aa  117  6e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  29.52 
 
 
490 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  48.36 
 
 
352 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1260 aa  117  7.999999999999999e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  27.96 
 
 
414 aa  117  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  45.11 
 
 
450 aa  117  8.999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>