More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2285 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  100 
 
 
130 aa  260  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  63.49 
 
 
135 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  61.54 
 
 
131 aa  170  5e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  62.9 
 
 
143 aa  167  3e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  62.31 
 
 
257 aa  160  5.0000000000000005e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  56.35 
 
 
591 aa  147  4e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 
352 aa  143  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  56.3 
 
 
636 aa  143  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  57.81 
 
 
157 aa  141  3e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  53.97 
 
 
953 aa  140  5e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.08 
 
 
373 aa  139  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.31 
 
 
377 aa  138  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.08 
 
 
499 aa  138  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  50.78 
 
 
380 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  52.85 
 
 
340 aa  136  1e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.85 
 
 
376 aa  135  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50.77 
 
 
498 aa  135  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  52.94 
 
 
238 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  53.17 
 
 
455 aa  134  6.0000000000000005e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  53.17 
 
 
455 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  50 
 
 
603 aa  133  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  47.69 
 
 
316 aa  133  9e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  52.07 
 
 
343 aa  133  9e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.8 
 
 
386 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  50.43 
 
 
450 aa  131  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  50 
 
 
352 aa  130  5e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  46.09 
 
 
337 aa  130  6.999999999999999e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  52.1 
 
 
404 aa  130  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.17 
 
 
355 aa  129  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  51.64 
 
 
426 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  52.85 
 
 
429 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  50.39 
 
 
255 aa  128  3e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  46.51 
 
 
667 aa  126  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  48.41 
 
 
461 aa  126  9.000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.96 
 
 
384 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.08 
 
 
817 aa  125  1.0000000000000001e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  47.58 
 
 
474 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  48.82 
 
 
469 aa  124  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  46.34 
 
 
450 aa  124  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  53.28 
 
 
359 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.46 
 
 
472 aa  124  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
989 aa  124  6e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45.38 
 
 
704 aa  122  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  50 
 
 
701 aa  123  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
989 aa  122  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  49.61 
 
 
311 aa  121  3e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  48.33 
 
 
182 aa  119  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  47.76 
 
 
273 aa  119  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  44.96 
 
 
336 aa  118  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  46.4 
 
 
701 aa  118  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.31 
 
 
571 aa  117  4.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  42.52 
 
 
429 aa  116  9e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  47.54 
 
 
126 aa  115  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  44.8 
 
 
245 aa  115  9.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  47.2 
 
 
261 aa  115  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  43.2 
 
 
458 aa  114  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  46.83 
 
 
263 aa  114  3.9999999999999997e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  50 
 
 
122 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  41.13 
 
 
258 aa  113  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  45.08 
 
 
122 aa  110  6e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.13 
 
 
561 aa  107  5e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  46.61 
 
 
265 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  39.68 
 
 
249 aa  106  1e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  45.08 
 
 
134 aa  106  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.13 
 
 
256 aa  105  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  44.72 
 
 
127 aa  105  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  45.3 
 
 
240 aa  104  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.86 
 
 
481 aa  103  5e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.77 
 
 
194 aa  103  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40 
 
 
521 aa  103  1e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  38.02 
 
 
248 aa  100  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.23 
 
 
196 aa  99.8  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.94 
 
 
432 aa  99.8  1e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  43.09 
 
 
134 aa  99  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  42.15 
 
 
387 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.6 
 
 
197 aa  99.4  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.4 
 
 
457 aa  99  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  41.67 
 
 
153 aa  99  2e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  43.55 
 
 
798 aa  97.4  5e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  41.67 
 
 
657 aa  96.7  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
154 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.68 
 
 
200 aa  95.9  1e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 
196 aa  95.9  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.4 
 
 
191 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.84 
 
 
199 aa  94  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05930  DNA-binding response regulator, LuxR family protein  40.98 
 
 
207 aa  94  6e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.52 
 
 
194 aa  93.6  8e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.83 
 
 
471 aa  92.8  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  38.4 
 
 
457 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.61 
 
 
461 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.52 
 
 
194 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.84 
 
 
199 aa  92  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1630  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.2 
 
 
243 aa  91.7  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  37.9 
 
 
197 aa  91.7  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  43.86 
 
 
463 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.1 
 
 
200 aa  90.9  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.68 
 
 
201 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.68 
 
 
201 aa  90.9  5e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  38.28 
 
 
204 aa  90.9  6e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  36.51 
 
 
205 aa  90.9  6e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>