More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2645 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
336 aa  681    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
337 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.41 
 
 
455 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.78 
 
 
455 aa  166  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  33.46 
 
 
603 aa  155  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
498 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  35.09 
 
 
257 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  33.1 
 
 
429 aa  150  3e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
953 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
989 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  30.45 
 
 
340 aa  147  2.0000000000000003e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.3 
 
 
989 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.71 
 
 
704 aa  145  8.000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.94 
 
 
426 aa  145  9e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.25 
 
 
499 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.25 
 
 
521 aa  135  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  28.62 
 
 
474 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.22 
 
 
461 aa  132  9e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.43 
 
 
701 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  29.89 
 
 
273 aa  129  9.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
380 aa  128  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 
258 aa  124  2e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.18 
 
 
316 aa  123  4e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.7 
 
 
571 aa  122  9e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  37.63 
 
 
263 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.97 
 
 
472 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.88 
 
 
384 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  30.54 
 
 
458 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 
404 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  44.96 
 
 
130 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  36.41 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.41 
 
 
636 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  50.85 
 
 
182 aa  117  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  48.39 
 
 
352 aa  117  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
359 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  45.53 
 
 
143 aa  115  7.999999999999999e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.97 
 
 
591 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  45.24 
 
 
131 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  39.73 
 
 
701 aa  113  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  46.03 
 
 
135 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.92 
 
 
373 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
817 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  40.3 
 
 
450 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.14 
 
 
197 aa  108  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  37.41 
 
 
429 aa  107  4e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  40.14 
 
 
450 aa  106  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 
432 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.27 
 
 
377 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  33.33 
 
 
261 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  43.84 
 
 
650 aa  103  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
355 aa  102  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.72 
 
 
561 aa  102  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
386 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  39.84 
 
 
238 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.03 
 
 
196 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  34.13 
 
 
469 aa  101  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.46 
 
 
376 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  40.3 
 
 
667 aa  100  3e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.06 
 
 
194 aa  99.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.33 
 
 
201 aa  99.8  5e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.33 
 
 
201 aa  100  5e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 
352 aa  99  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.32 
 
 
196 aa  99  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.5 
 
 
471 aa  97.4  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35 
 
 
229 aa  95.1  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.77 
 
 
214 aa  94.7  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  41.32 
 
 
127 aa  94.7  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.46 
 
 
582 aa  94  3e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  38.26 
 
 
249 aa  93.6  4e-18  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
343 aa  93.2  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  36.13 
 
 
261 aa  93.2  6e-18  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
126 aa  92.8  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.31 
 
 
461 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
122 aa  91.3  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.5 
 
 
457 aa  91.3  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  30.57 
 
 
265 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.93 
 
 
220 aa  90.9  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.23 
 
 
220 aa  90.5  4e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 
906 aa  90.1  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.88 
 
 
200 aa  89.7  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  37.5 
 
 
197 aa  89.7  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  35.88 
 
 
798 aa  89  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  37.3 
 
 
157 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  33.61 
 
 
226 aa  88.6  1e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  28.4 
 
 
204 aa  88.2  2e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.25 
 
 
194 aa  87.8  2e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  33.06 
 
 
215 aa  88.2  2e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  35.83 
 
 
199 aa  87.8  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.8 
 
 
245 aa  87.8  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  42.02 
 
 
355 aa  87.8  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  31.78 
 
 
206 aa  87.4  3e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
229 aa  87.4  3e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  40.32 
 
 
134 aa  87.4  3e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  36.51 
 
 
249 aa  87  4e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  29.69 
 
 
412 aa  87  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  35.25 
 
 
207 aa  87  4e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  36.22 
 
 
340 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  28.72 
 
 
598 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  26.6 
 
 
385 aa  86.7  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  36.21 
 
 
256 aa  86.3  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>