More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1807 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
258 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  47.75 
 
 
255 aa  162  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  54.76 
 
 
182 aa  152  7e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.22 
 
 
499 aa  148  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.98 
 
 
498 aa  143  2e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.62 
 
 
429 aa  141  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  47.45 
 
 
352 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.26 
 
 
426 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.7 
 
 
386 aa  139  3.9999999999999997e-32  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.72 
 
 
989 aa  138  8.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.65 
 
 
953 aa  138  8.999999999999999e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  39.89 
 
 
603 aa  136  4e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.34 
 
 
472 aa  135  5e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.92 
 
 
704 aa  135  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  38.05 
 
 
461 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  35.5 
 
 
257 aa  133  3e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.05 
 
 
316 aa  132  5e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
989 aa  129  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.94 
 
 
455 aa  129  3e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  32.93 
 
 
261 aa  129  5.0000000000000004e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  46.83 
 
 
355 aa  129  5.0000000000000004e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.35 
 
 
455 aa  129  6e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.43 
 
 
701 aa  128  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  35.26 
 
 
429 aa  127  1.0000000000000001e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  47.58 
 
 
143 aa  125  6e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  40.48 
 
 
336 aa  124  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.42 
 
 
355 aa  122  7e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.45 
 
 
571 aa  119  3.9999999999999996e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.55 
 
 
474 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  38.73 
 
 
404 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 
238 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.09 
 
 
817 aa  116  3.9999999999999997e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  35.75 
 
 
458 aa  116  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.53 
 
 
521 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.09 
 
 
384 aa  115  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  43.09 
 
 
135 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  41.13 
 
 
130 aa  113  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  43.09 
 
 
131 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 
591 aa  111  9e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.16 
 
 
636 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 
469 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.19 
 
 
373 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  35.8 
 
 
340 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.92 
 
 
701 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
380 aa  110  3e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
450 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.24 
 
 
376 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
359 aa  106  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  40.32 
 
 
667 aa  105  5e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  35.4 
 
 
263 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  31.34 
 
 
273 aa  105  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.18 
 
 
245 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  44.88 
 
 
311 aa  103  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  43.8 
 
 
127 aa  103  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.3 
 
 
194 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  36.23 
 
 
450 aa  102  4e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  38.4 
 
 
337 aa  102  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 
265 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  41.46 
 
 
134 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.35 
 
 
196 aa  99.8  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 
343 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
126 aa  99  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.74 
 
 
196 aa  99  7e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.32 
 
 
377 aa  98.6  8e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.19 
 
 
561 aa  99  8e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  35.16 
 
 
249 aa  97.8  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  40 
 
 
122 aa  96.7  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  38.81 
 
 
352 aa  96.3  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  38.66 
 
 
240 aa  96.3  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.21 
 
 
471 aa  95.9  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.56 
 
 
432 aa  94.7  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.32 
 
 
197 aa  94.4  2e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.13 
 
 
256 aa  92  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.88 
 
 
650 aa  91.7  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  36.22 
 
 
798 aa  90.9  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  38.6 
 
 
134 aa  90.5  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  33.86 
 
 
157 aa  90.5  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.1 
 
 
191 aa  90.5  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  35.83 
 
 
204 aa  89.4  5e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.06 
 
 
229 aa  89.4  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  28.49 
 
 
408 aa  89  7e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.89 
 
 
194 aa  89  7e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.89 
 
 
194 aa  88.2  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  33.61 
 
 
207 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.17 
 
 
220 aa  88.2  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  26.79 
 
 
414 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  33.81 
 
 
199 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.29 
 
 
200 aa  85.5  7e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
214 aa  85.5  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  35.54 
 
 
197 aa  85.1  9e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  35.83 
 
 
657 aa  85.1  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 
635 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.78 
 
 
210 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.67 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  34.65 
 
 
387 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.36 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35 
 
 
201 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>