More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1912 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  100 
 
 
263 aa  528  1e-149  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  47.27 
 
 
261 aa  248  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  43.46 
 
 
265 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.08 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  34.98 
 
 
257 aa  146  3e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.21 
 
 
498 aa  145  6e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
521 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.94 
 
 
455 aa  145  7.0000000000000006e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.02 
 
 
455 aa  141  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.44 
 
 
426 aa  139  6e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.71 
 
 
953 aa  138  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  44.79 
 
 
238 aa  137  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.11 
 
 
461 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
989 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  33.33 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  39.9 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.84 
 
 
499 aa  131  1.0000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 
989 aa  125  9e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  32.54 
 
 
603 aa  124  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
591 aa  124  2e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  51.61 
 
 
131 aa  123  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  47.58 
 
 
316 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  36.84 
 
 
704 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.54 
 
 
377 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  45.6 
 
 
429 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  37.63 
 
 
336 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  43.21 
 
 
380 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  50.42 
 
 
135 aa  119  4.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
359 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  38.8 
 
 
255 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.61 
 
 
701 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.7 
 
 
701 aa  116  3.9999999999999997e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  49.17 
 
 
143 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.16 
 
 
355 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 
384 aa  114  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  46.83 
 
 
130 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  50 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  48.31 
 
 
636 aa  114  2.0000000000000002e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  43.9 
 
 
387 aa  113  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.52 
 
 
376 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  48.33 
 
 
340 aa  113  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  45.45 
 
 
245 aa  112  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  34.76 
 
 
469 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
571 aa  112  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.72 
 
 
817 aa  112  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  42.74 
 
 
352 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  37.34 
 
 
474 aa  109  6e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  44.92 
 
 
343 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.5 
 
 
386 aa  107  2e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  42.54 
 
 
182 aa  106  3e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  35.4 
 
 
258 aa  105  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  42.4 
 
 
126 aa  104  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30 
 
 
432 aa  103  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  31.78 
 
 
248 aa  103  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  34.02 
 
 
458 aa  103  2e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.41 
 
 
373 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  44.35 
 
 
122 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
337 aa  103  4e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
472 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  42.4 
 
 
450 aa  102  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
122 aa  99.4  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  44.17 
 
 
667 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
127 aa  96.3  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  34.5 
 
 
249 aa  95.9  6e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  42.86 
 
 
134 aa  95.5  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  42.54 
 
 
311 aa  94.7  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 
352 aa  92.8  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.11 
 
 
561 aa  90.9  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  43.97 
 
 
157 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  38.14 
 
 
355 aa  90.1  4e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.12 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  40.68 
 
 
134 aa  88.2  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  42.02 
 
 
461 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.97 
 
 
635 aa  86.7  3e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  36.59 
 
 
657 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  30.72 
 
 
408 aa  86.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  40.17 
 
 
248 aa  86.3  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4327  transcriptional regulator, NifA subfamily, Fis Family  33.11 
 
 
875 aa  85.9  6e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.184763 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  37.1 
 
 
199 aa  85.1  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 
650 aa  84.7  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  38.98 
 
 
154 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  37.82 
 
 
197 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.4 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  36.97 
 
 
153 aa  82.4  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  33.88 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.08 
 
 
194 aa  82  0.000000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.7 
 
 
194 aa  82  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.21 
 
 
201 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  27.84 
 
 
414 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.9 
 
 
201 aa  81.6  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.13 
 
 
481 aa  80.9  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  38.17 
 
 
206 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.68 
 
 
457 aa  80.5  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.25 
 
 
471 aa  80.1  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  33.9 
 
 
240 aa  80.1  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  40.78 
 
 
463 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  36.13 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.83 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  35.65 
 
 
127 aa  77.8  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.43 
 
 
214 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>