More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2212 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  100 
 
 
122 aa  244  3e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  63.11 
 
 
126 aa  164  4e-40  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  49.59 
 
 
122 aa  123  8.000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  48.7 
 
 
429 aa  123  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  51.67 
 
 
135 aa  123  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45 
 
 
384 aa  121  3e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  49.15 
 
 
352 aa  121  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.76 
 
 
373 aa  120  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  48.33 
 
 
257 aa  118  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  48.33 
 
 
499 aa  114  6e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  50 
 
 
130 aa  113  6.9999999999999995e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 
143 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
989 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  47.5 
 
 
131 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.83 
 
 
455 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.96 
 
 
455 aa  110  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  45.45 
 
 
352 aa  110  6e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  46.96 
 
 
701 aa  110  6e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  46.67 
 
 
255 aa  110  6e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.74 
 
 
989 aa  110  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.09 
 
 
498 aa  109  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45 
 
 
704 aa  109  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.35 
 
 
636 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  48.31 
 
 
953 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
124 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  47.83 
 
 
245 aa  108  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.69 
 
 
426 aa  107  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  44.35 
 
 
461 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.35 
 
 
359 aa  105  3e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
591 aa  105  3e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  50.43 
 
 
701 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.49 
 
 
521 aa  104  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  41.88 
 
 
240 aa  104  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  42.24 
 
 
343 aa  104  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  44.64 
 
 
134 aa  103  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  46.15 
 
 
261 aa  103  7e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.11 
 
 
355 aa  103  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 
380 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  47.83 
 
 
265 aa  103  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  40 
 
 
450 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
450 aa  101  3e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.61 
 
 
377 aa  101  4e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  42.86 
 
 
404 aa  100  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  45.22 
 
 
474 aa  99.8  1e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  42.5 
 
 
238 aa  99.4  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  40.5 
 
 
340 aa  100  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.5 
 
 
386 aa  99.4  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.83 
 
 
472 aa  99  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  43.48 
 
 
458 aa  99.4  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
263 aa  99.4  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  40.83 
 
 
603 aa  97.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
316 aa  97.8  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.22 
 
 
571 aa  97.4  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
469 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
258 aa  96.7  9e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.17 
 
 
376 aa  96.7  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.33 
 
 
457 aa  96.7  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4330  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
127 aa  95.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  40 
 
 
182 aa  94.7  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.88 
 
 
256 aa  94  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  41.32 
 
 
127 aa  94  6e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  42.5 
 
 
657 aa  94  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.18 
 
 
457 aa  93.6  8e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 
337 aa  92.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  44.44 
 
 
311 aa  91.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  42.24 
 
 
463 aa  91.3  4e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  41.67 
 
 
336 aa  91.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  41.67 
 
 
667 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
387 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  40.17 
 
 
153 aa  89.4  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  41.23 
 
 
481 aa  89.7  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  39.47 
 
 
651 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  39.66 
 
 
154 aa  88.6  2e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  36.67 
 
 
134 aa  89  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.35 
 
 
635 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  34.17 
 
 
249 aa  88.6  3e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  36.67 
 
 
471 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  39.67 
 
 
248 aa  88.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  35.96 
 
 
429 aa  87.8  5e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.39 
 
 
196 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.35 
 
 
650 aa  85.1  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.02 
 
 
432 aa  84.3  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 
817 aa  84.7  4e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  42.61 
 
 
157 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  34.17 
 
 
248 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.39 
 
 
561 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.52 
 
 
194 aa  81.3  0.000000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.33 
 
 
197 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.72 
 
 
582 aa  80.9  0.000000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.61 
 
 
200 aa  80.5  0.000000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.13 
 
 
229 aa  80.1  0.000000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.5 
 
 
191 aa  80.1  0.000000000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  38.46 
 
 
205 aa  79.3  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4820  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.48 
 
 
244 aa  78.6  0.00000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.334432  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 
194 aa  78.2  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.13 
 
 
195 aa  77.8  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 
194 aa  77.8  0.00000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  33.62 
 
 
355 aa  78.2  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 
461 aa  77.4  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>