More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3658 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 		 194 aa  386  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  97.94 
 
 		 194 aa  379  1e-104  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  87.83 
 
 		 191 aa  335  1.9999999999999998e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  76.96 
 
 		 195 aa  307  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.78 
 
 		 197 aa  252  3e-66  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  56.15 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.45 
 
 		 212 aa  212  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  55 
 
 		 247 aa  210  9e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.95 
 
 		 229 aa  209  2e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  54.3 
 
 		 204 aa  209  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.76 
 
 		 199 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.69 
 
 		 199 aa  207  7e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  55.38 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.95 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.38 
 
 		 200 aa  206  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  53.4 
 
 		 197 aa  205  3e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  53.55 
 
 		 198 aa  205  3e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  53.85 
 
 		 226 aa  205  4e-52  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.41 
 
 		 194 aa  204  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.4 
 
 		 227 aa  204  5e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  52.15 
 
 		 206 aa  204  6e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.85 
 
 		 210 aa  203  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 		 220 aa  202  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.75 
 
 		 201 aa  203  2e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.17 
 
 		 229 aa  203  2e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.75 
 
 		 201 aa  202  2e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.26 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  50.26 
 
 		 210 aa  201  6e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.65 
 
 		 200 aa  201  6e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.09 
 
 		 210 aa  201  7e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.51 
 
 		 214 aa  200  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.09 
 
 		 213 aa  200  8e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.15 
 
 		 206 aa  200  9.999999999999999e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.34 
 
 		 194 aa  200  9.999999999999999e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  52.78 
 
 		 215 aa  198  3e-50  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.2 
 
 		 229 aa  194  9e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.91 
 
 		 188 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  52.46 
 
 		 191 aa  192  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  47.62 
 
 		 206 aa  190  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.65 
 
 		 205 aa  189  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  49.46 
 
 		 205 aa  187  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  50 
 
 		 207 aa  187  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  54.4 
 
 		 207 aa  184  6e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  48.63 
 
 		 189 aa  184  9e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  49.18 
 
 		 202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.8 
 
 		 196 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.25 
 
 		 196 aa  180  9.000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.62 
 
 		 220 aa  178  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.21 
 
 		 194 aa  173  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.99 
 
 		 194 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.81 
 
 		 242 aa  169  3e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  41.09 
 
 		 261 aa  165  2.9999999999999998e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  43.56 
 
 		 249 aa  165  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.78 
 
 		 205 aa  165  4e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.19 
 
 		 208 aa  162  3e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  41.53 
 
 		 187 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  42.62 
 
 		 191 aa  161  5.0000000000000005e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.67 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.49 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.54 
 
 		 195 aa  155  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.8 
 
 		 198 aa  153  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.5 
 
 		 192 aa  147  7e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.86 
 
 		 203 aa  147  7e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.08 
 
 		 221 aa  146  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 		 190 aa  144  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.59 
 
 		 198 aa  137  7e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  49.29 
 
 		 159 aa  137  1e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 191 aa  129  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.78 
 
 		 191 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.74 
 
 		 198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  45.67 
 
 		 667 aa  115  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.16 
 
 		 218 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.91 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  32.61 
 
 		 191 aa  109  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  45.97 
 
 		 450 aa  108  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.07 
 
 		 191 aa  108  6e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 		 207 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  43.85 
 
 		 636 aa  106  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.8 
 
 		 195 aa  105  4e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.58 
 
 		 196 aa  105  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  38.12 
 
 		 380 aa  104  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.37 
 
 		 196 aa  102  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  42.97 
 
 		 352 aa  101  5e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  41.18 
 
 		 450 aa  99  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  41.41 
 
 		 316 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.11 
 
 		 224 aa  97.8  9e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.34 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  30.54 
 
 		 195 aa  97.1  1e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 122 aa  96.3  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  39.1 
 
 		 603 aa  95.9  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  32.8 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.11 
 
 		 191 aa  95.5  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.54 
 
 		 195 aa  95.5  4e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.044252 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  41.13 
 
 		 461 aa  95.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.64 
 
 		 195 aa  94.7  7e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2529  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  26.32 
 
 		 212 aa  94  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  30.6 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.57 
 
 		 221 aa  93.2  2e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  39.83 
 
 		 122 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2302  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.54 
 
 		 195 aa  92.8  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.874561 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>