More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0118 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
265 aa  539  9.999999999999999e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  45.35 
 
 
261 aa  234  9e-61  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  43.46 
 
 
263 aa  206  3e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  31.33 
 
 
257 aa  126  3e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.94 
 
 
498 aa  125  8.000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  36.17 
 
 
461 aa  122  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  38.92 
 
 
603 aa  121  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.33 
 
 
426 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
953 aa  119  7e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.13 
 
 
455 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  36.87 
 
 
404 aa  115  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.6 
 
 
455 aa  115  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  49.15 
 
 
135 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.52 
 
 
989 aa  113  3e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.34 
 
 
355 aa  113  3e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
429 aa  113  3e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  51.69 
 
 
131 aa  112  5e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  45.16 
 
 
238 aa  112  7.000000000000001e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.05 
 
 
704 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 
499 aa  110  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  47.01 
 
 
126 aa  109  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
255 aa  109  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 
143 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.08 
 
 
384 aa  108  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  28.92 
 
 
273 aa  108  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 
989 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  35.16 
 
 
429 aa  106  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  46.61 
 
 
130 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.09 
 
 
636 aa  106  5e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  38.36 
 
 
380 aa  105  7e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.18 
 
 
373 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  47.83 
 
 
122 aa  103  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  34.08 
 
 
474 aa  102  5e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
340 aa  102  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  33.69 
 
 
248 aa  102  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.55 
 
 
377 aa  102  8e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  31.18 
 
 
182 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  30.85 
 
 
258 aa  101  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  40.16 
 
 
352 aa  101  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.5 
 
 
316 aa  100  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.76 
 
 
386 aa  100  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.62 
 
 
591 aa  99.4  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  44.8 
 
 
701 aa  99  8e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  35.03 
 
 
458 aa  98.6  8e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.41 
 
 
376 aa  98.6  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
387 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 
472 aa  97.1  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.25 
 
 
817 aa  96.3  5e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  38.76 
 
 
450 aa  95.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 
571 aa  94.4  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  43.1 
 
 
343 aa  94.4  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  35.04 
 
 
355 aa  94  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 
359 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.61 
 
 
521 aa  93.6  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
337 aa  92.8  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  44.88 
 
 
667 aa  92.4  7e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  34.91 
 
 
469 aa  91.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  30.57 
 
 
336 aa  91.3  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35 
 
 
701 aa  90.9  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  43.59 
 
 
352 aa  90.1  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  36.75 
 
 
240 aa  88.6  9e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  36.64 
 
 
408 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
450 aa  87  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.83 
 
 
245 aa  86.7  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  40 
 
 
154 aa  86.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  39.66 
 
 
134 aa  85.9  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  36.67 
 
 
134 aa  85.9  6e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  41.03 
 
 
122 aa  85.5  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  39.84 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6068  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
248 aa  84.3  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.9 
 
 
432 aa  84  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  42.74 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  38.21 
 
 
153 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
127 aa  80.1  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  32.47 
 
 
249 aa  79  0.00000000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1630  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.25 
 
 
243 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.192215 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  37.61 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.06 
 
 
561 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  37.96 
 
 
463 aa  75.9  0.0000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  30.11 
 
 
798 aa  75.5  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2711  two component signal transduction response regulator  38.02 
 
 
131 aa  74.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  37.1 
 
 
657 aa  74.3  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.59 
 
 
1559 aa  73.6  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5460  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.31 
 
 
650 aa  73.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.665291  normal  0.225769 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.33 
 
 
194 aa  73.2  0.000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  32.19 
 
 
635 aa  73.2  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.82 
 
 
471 aa  71.6  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.13 
 
 
191 aa  71.2  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  34.88 
 
 
414 aa  71.6  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.09 
 
 
457 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1683  response regulator receiver protein  38.4 
 
 
430 aa  70.9  0.00000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000786383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5447  response regulator receiver protein  31.58 
 
 
228 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00883739  normal  0.15212 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0913  response regulator receiver protein  30.33 
 
 
124 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.0000000115879 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.04 
 
 
229 aa  71.2  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  32.8 
 
 
204 aa  71.2  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.43 
 
 
1431 aa  70.1  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  34.71 
 
 
651 aa  70.1  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4328  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.19 
 
 
612 aa  70.1  0.00000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  33.33 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2839  response regulator receiver protein  30.83 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0400316  normal  0.0390199 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>