More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2510 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  100 
 
 
157 aa  317  6e-86  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  57.81 
 
 
130 aa  141  3e-33  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  57.48 
 
 
257 aa  138  3e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  56.56 
 
 
143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  48.41 
 
 
377 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  53.28 
 
 
135 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  53.72 
 
 
131 aa  124  6e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.68 
 
 
636 aa  118  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.67 
 
 
386 aa  118  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.67 
 
 
591 aa  114  3.9999999999999997e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.39 
 
 
376 aa  113  7.999999999999999e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.97 
 
 
426 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  45.65 
 
 
352 aa  113  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  41.48 
 
 
429 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  44.03 
 
 
316 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  45.24 
 
 
340 aa  111  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  44.78 
 
 
343 aa  111  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  42.11 
 
 
352 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  41.67 
 
 
429 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  46.77 
 
 
380 aa  107  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.34 
 
 
355 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.78 
 
 
472 aa  108  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  42.36 
 
 
603 aa  107  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  40.29 
 
 
450 aa  106  1e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  43.9 
 
 
461 aa  105  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  47.66 
 
 
373 aa  106  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  39.69 
 
 
337 aa  104  4e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.47 
 
 
359 aa  104  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
450 aa  104  6e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  42.22 
 
 
238 aa  103  6e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  45.26 
 
 
499 aa  103  6e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  44.72 
 
 
455 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.86 
 
 
498 aa  103  8e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.6 
 
 
953 aa  103  8e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  43.44 
 
 
404 aa  101  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  43.9 
 
 
455 aa  100  8e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.65 
 
 
245 aa  98.6  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.89 
 
 
384 aa  98.2  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  38.28 
 
 
474 aa  97.8  5e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.08 
 
 
571 aa  96.7  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  42.11 
 
 
311 aa  95.9  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  43.33 
 
 
667 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  41.67 
 
 
182 aa  95.1  3e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  45 
 
 
701 aa  94.7  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  43.59 
 
 
701 aa  94.7  4e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  42.06 
 
 
255 aa  94  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
261 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  44.09 
 
 
126 aa  93.2  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.98 
 
 
704 aa  92.4  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  44.83 
 
 
134 aa  91.7  3e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  43.9 
 
 
481 aa  90.5  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  41.73 
 
 
469 aa  90.5  8e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  33.86 
 
 
258 aa  90.5  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  43.97 
 
 
263 aa  89.7  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.65 
 
 
197 aa  90.1  1e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.1 
 
 
817 aa  89  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.62 
 
 
229 aa  89  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3925  two-component response regulator  37.72 
 
 
264 aa  89  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.88 
 
 
457 aa  88.6  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  37.3 
 
 
336 aa  88.6  3e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 
210 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 
210 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 
210 aa  88.6  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.2 
 
 
432 aa  87.8  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  43.1 
 
 
657 aa  87.4  7e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.68 
 
 
194 aa  87.4  8e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  39.34 
 
 
197 aa  87  9e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2186  two-component response regulator  39.32 
 
 
264 aa  87  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  40 
 
 
127 aa  87  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
989 aa  86.7  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  34.23 
 
 
240 aa  87  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 
414 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.51 
 
 
195 aa  86.3  2e-16  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.89 
 
 
989 aa  86.3  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
213 aa  85.5  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  35.38 
 
 
458 aa  85.9  2e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  34.48 
 
 
408 aa  84.7  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  42.86 
 
 
134 aa  85.1  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  39.67 
 
 
205 aa  84.7  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.94 
 
 
521 aa  84.7  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.17 
 
 
199 aa  84.3  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.29 
 
 
200 aa  84  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.32 
 
 
461 aa  84  8e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.98 
 
 
200 aa  83.6  9e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  40.5 
 
 
635 aa  83.6  9e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.34 
 
 
196 aa  83.6  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  41.38 
 
 
153 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.69 
 
 
194 aa  83.2  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  32.31 
 
 
561 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.59 
 
 
201 aa  83.2  0.000000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  42.61 
 
 
122 aa  83.6  0.000000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.34 
 
 
196 aa  82.8  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  42.74 
 
 
265 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  33.87 
 
 
248 aa  82.4  0.000000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2703  two-component response regulator  37.21 
 
 
269 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.33 
 
 
201 aa  82.8  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2347  two-component response regulator  38.89 
 
 
264 aa  82.4  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.17 
 
 
229 aa  82.8  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  38.33 
 
 
204 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  37.8 
 
 
273 aa  82  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>