More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2686 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
337 aa  689    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  39.08 
 
 
340 aa  226  5.0000000000000005e-58  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.55 
 
 
336 aa  169  8e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  44 
 
 
429 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  39.58 
 
 
257 aa  145  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  34.2 
 
 
603 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.2 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  45.57 
 
 
455 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 
472 aa  139  6e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  35.93 
 
 
352 aa  138  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  51.94 
 
 
636 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  38.57 
 
 
238 aa  136  4e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  48.48 
 
 
461 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.11 
 
 
561 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.55 
 
 
953 aa  135  9.999999999999999e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  32 
 
 
429 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  50.79 
 
 
355 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  52.5 
 
 
135 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  46.09 
 
 
130 aa  130  4.0000000000000003e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.27 
 
 
591 aa  129  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  50.83 
 
 
343 aa  129  8.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.25 
 
 
701 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.06 
 
 
571 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  49.19 
 
 
131 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  32.22 
 
 
404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.81 
 
 
377 aa  126  4.0000000000000003e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  41.72 
 
 
474 aa  126  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.82 
 
 
989 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  38.31 
 
 
701 aa  125  7e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  49.21 
 
 
352 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.22 
 
 
989 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  50.42 
 
 
143 aa  123  5e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.26 
 
 
373 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
380 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  35.09 
 
 
704 aa  120  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.33 
 
 
499 aa  118  9.999999999999999e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  39.88 
 
 
255 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  46.34 
 
 
426 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.48 
 
 
498 aa  117  3e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  38.79 
 
 
458 aa  117  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40.44 
 
 
359 aa  116  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  41.46 
 
 
469 aa  116  6e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.85 
 
 
384 aa  115  7.999999999999999e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  40.16 
 
 
450 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.94 
 
 
386 aa  112  9e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.72 
 
 
376 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  40.5 
 
 
249 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  36.47 
 
 
273 aa  110  3e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  36.26 
 
 
316 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.52 
 
 
817 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  45.76 
 
 
182 aa  109  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  38.21 
 
 
450 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  46.22 
 
 
667 aa  108  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
521 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  40.8 
 
 
245 aa  104  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  39.69 
 
 
157 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  33.86 
 
 
263 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  29.08 
 
 
798 aa  102  8e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  38.4 
 
 
258 aa  102  9e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  37.12 
 
 
261 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  34.59 
 
 
311 aa  99.8  6e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3669  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.21 
 
 
432 aa  97.1  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  37.3 
 
 
134 aa  95.9  8e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.62 
 
 
194 aa  95.9  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1200  response regulator receiver domain-containing protein  32.32 
 
 
248 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0783054  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  31.11 
 
 
906 aa  94.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0270  putative PAS/PAC sensor protein  27.43 
 
 
630 aa  93.2  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.525809  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  36.65 
 
 
265 aa  92.8  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.99 
 
 
221 aa  92.8  8e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  40.98 
 
 
240 aa  92  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  39.13 
 
 
122 aa  92.4  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2691  putative PAS/PAC sensor protein  25.74 
 
 
385 aa  92  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.10412 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  37.59 
 
 
635 aa  92  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1440  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 
477 aa  91.3  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  32.08 
 
 
888 aa  89.7  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.32 
 
 
196 aa  89.7  7e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1147  putative PAS/PAC sensor protein  40.87 
 
 
340 aa  89.7  7e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.50156  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.5 
 
 
196 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  35.29 
 
 
471 aa  89  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
127 aa  89  1e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  36.29 
 
 
126 aa  88.2  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  37.29 
 
 
134 aa  88.2  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2085  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 
457 aa  87  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1958  putative PAS/PAC sensor protein  38.1 
 
 
598 aa  86.7  5e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293409  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  34.01 
 
 
657 aa  86.3  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2092  putative PAS/PAC sensor protein  30.53 
 
 
628 aa  86.3  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.180005  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1374  putative PAS/PAC sensor protein  35.66 
 
 
408 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0268  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  35 
 
 
651 aa  85.1  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2336  response regulator receiver protein  35.11 
 
 
355 aa  85.9  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.404573  normal  0.642469 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  37.5 
 
 
461 aa  85.5  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0115  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  28.86 
 
 
481 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.7 
 
 
199 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  36.97 
 
 
122 aa  84  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1107  putative PAS/PAC sensor protein  42.42 
 
 
449 aa  84  0.000000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.316445  normal  0.383649 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0006  putative PAS/PAC sensor protein  30.28 
 
 
412 aa  83.6  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.533638  normal 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4195  response regulator receiver protein  38.46 
 
 
154 aa  82.4  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81513  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0440  putative PAS/PAC sensor protein  41.24 
 
 
686 aa  82.4  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.07 
 
 
199 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5458  putative two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.34 
 
 
582 aa  81.3  0.00000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.336827 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4853  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.85 
 
 
457 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.231814  hitchhiker  0.00735887 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>