More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1528 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  100 
 
 
450 aa  905    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  57.84 
 
 
450 aa  521  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  50.39 
 
 
257 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  52.46 
 
 
131 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  51.54 
 
 
316 aa  135  1.9999999999999998e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  44.12 
 
 
429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.04 
 
 
498 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.37 
 
 
499 aa  130  4.0000000000000003e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.09 
 
 
591 aa  126  7e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  46.92 
 
 
135 aa  125  1e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.62 
 
 
376 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.12 
 
 
636 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  46.34 
 
 
130 aa  124  3e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  49.18 
 
 
343 aa  123  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.28 
 
 
817 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  42.28 
 
 
667 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  49.59 
 
 
373 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.48 
 
 
386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.72 
 
 
384 aa  121  1.9999999999999998e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  47.46 
 
 
143 aa  121  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.19 
 
 
377 aa  121  3e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  45.39 
 
 
255 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  40.54 
 
 
238 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
953 aa  119  7.999999999999999e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  39.76 
 
 
461 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  41.04 
 
 
701 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  46.03 
 
 
380 aa  119  9.999999999999999e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.54 
 
 
472 aa  118  1.9999999999999998e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.9 
 
 
359 aa  118  1.9999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  46.03 
 
 
355 aa  118  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.26 
 
 
426 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  45.11 
 
 
603 aa  117  6e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.06 
 
 
455 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.06 
 
 
989 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  50 
 
 
263 aa  115  2.0000000000000002e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  40.94 
 
 
182 aa  114  3e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.53 
 
 
571 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  40.15 
 
 
701 aa  114  5e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.27 
 
 
455 aa  113  6e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.81 
 
 
989 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  45.08 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  42.28 
 
 
429 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  43.75 
 
 
245 aa  111  3e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.36 
 
 
191 aa  111  3e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  44.54 
 
 
404 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  40.3 
 
 
336 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  38.21 
 
 
337 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.97 
 
 
194 aa  108  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  43.44 
 
 
352 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  38.19 
 
 
352 aa  108  2e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  42.64 
 
 
521 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  38.58 
 
 
474 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  42.37 
 
 
258 aa  108  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.46 
 
 
197 aa  107  3e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.97 
 
 
194 aa  107  3e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  40.29 
 
 
157 aa  106  7e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  46.88 
 
 
311 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  45.22 
 
 
126 aa  105  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  40.8 
 
 
261 aa  105  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  39.23 
 
 
469 aa  104  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.07 
 
 
200 aa  102  9e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
122 aa  101  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  42.61 
 
 
122 aa  102  2e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.54 
 
 
205 aa  101  3e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.01 
 
 
704 aa  100  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.62 
 
 
195 aa  100  5e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.22 
 
 
196 aa  100  8e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.92 
 
 
196 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.53 
 
 
194 aa  98.6  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2032  response regulator receiver protein  40.68 
 
 
387 aa  99  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0686114 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  37.1 
 
 
458 aa  97.8  3e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  38.76 
 
 
265 aa  95.1  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  41.53 
 
 
204 aa  95.1  2e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  37.96 
 
 
273 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.5 
 
 
200 aa  94.7  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1609  response regulator receiver protein  44.74 
 
 
463 aa  94  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.672475  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.83 
 
 
229 aa  93.6  6e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.67 
 
 
194 aa  93.2  9e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01100  sensory box/GGDEF family protein  41.13 
 
 
798 aa  93.2  9e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.14 
 
 
199 aa  93.2  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.53 
 
 
194 aa  92.8  1e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2294  response regulator receiver  36.92 
 
 
134 aa  92.8  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.371138  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
210 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
210 aa  92.4  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.4 
 
 
213 aa  93.2  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  42.74 
 
 
127 aa  92.4  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.4 
 
 
561 aa  91.7  2e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.17 
 
 
220 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.4 
 
 
212 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
210 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  40 
 
 
207 aa  91.7  3e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  34.04 
 
 
256 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  40.68 
 
 
206 aa  91.7  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  37.58 
 
 
206 aa  90.5  6e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.83 
 
 
229 aa  90.5  6e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.29 
 
 
199 aa  90.1  7e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.83 
 
 
229 aa  90.1  7e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  38.98 
 
 
197 aa  90.1  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  38.98 
 
 
153 aa  89.7  8e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.68 
 
 
206 aa  90.1  8e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>