More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_3575 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  100 
 
 
229 aa  447  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  94.36 
 
 
213 aa  363  1e-99  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  88.94 
 
 
210 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  88.94 
 
 
210 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  88.94 
 
 
210 aa  363  2e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  89.64 
 
 
205 aa  339  2.9999999999999998e-92  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  70.59 
 
 
206 aa  300  1e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  69.8 
 
 
204 aa  288  6e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  73.26 
 
 
200 aa  281  7.000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  71.81 
 
 
207 aa  277  9e-74  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  71.66 
 
 
194 aa  275  4e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  69.15 
 
 
212 aa  271  4.0000000000000004e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  70 
 
 
199 aa  271  7e-72  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.95 
 
 
199 aa  269  2.9999999999999997e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  68.53 
 
 
199 aa  268  7e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.67 
 
 
205 aa  266  2e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  69.9 
 
 
206 aa  265  2.9999999999999995e-70  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  69.59 
 
 
206 aa  265  5e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  67.72 
 
 
197 aa  264  1e-69  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  68.11 
 
 
214 aa  255  3e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.82 
 
 
200 aa  255  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.54 
 
 
229 aa  254  7e-67  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  64.85 
 
 
210 aa  254  9e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  61.31 
 
 
220 aa  252  4.0000000000000004e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  62.94 
 
 
207 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.98 
 
 
227 aa  249  3e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.98 
 
 
220 aa  248  5e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.44 
 
 
229 aa  248  6e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  62.57 
 
 
201 aa  248  7e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  62.57 
 
 
201 aa  247  9e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  62.9 
 
 
226 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  71.98 
 
 
207 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.56 
 
 
247 aa  241  6e-63  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  58.64 
 
 
215 aa  233  2.0000000000000002e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  61.17 
 
 
198 aa  231  6e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.49 
 
 
197 aa  218  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.72 
 
 
194 aa  208  6e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 
191 aa  207  9e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.85 
 
 
195 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.17 
 
 
194 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  53.51 
 
 
189 aa  201  9e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  46.64 
 
 
261 aa  196  3e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  47.52 
 
 
249 aa  187  1e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48 
 
 
203 aa  181  7e-45  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  46.99 
 
 
191 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.36 
 
 
196 aa  170  2e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.64 
 
 
202 aa  167  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.28 
 
 
194 aa  167  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.09 
 
 
194 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.26 
 
 
196 aa  165  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.25 
 
 
221 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  45.36 
 
 
188 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  45.41 
 
 
187 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.88 
 
 
194 aa  154  9e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.27 
 
 
198 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  37.91 
 
 
191 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.13 
 
 
192 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.44 
 
 
218 aa  152  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.44 
 
 
205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.68 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.46 
 
 
242 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.92 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.11 
 
 
208 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.84 
 
 
195 aa  142  6e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 
243 aa  142  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.65 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.56 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.78 
 
 
198 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  41.48 
 
 
159 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.56 
 
 
191 aa  112  5e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.8 
 
 
191 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.15 
 
 
190 aa  108  7.000000000000001e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  36.26 
 
 
191 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  32.43 
 
 
194 aa  102  5e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  35.12 
 
 
191 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
355 aa  100  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  27.6 
 
 
195 aa  98.6  7e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  40.91 
 
 
316 aa  98.2  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  35.4 
 
 
667 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  39.37 
 
 
701 aa  97.1  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  36.02 
 
 
636 aa  96.7  3e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  40.68 
 
 
352 aa  95.5  5e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  36.77 
 
 
380 aa  95.9  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  45.28 
 
 
122 aa  95.5  6e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
120 aa  95.1  7e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.6 
 
 
207 aa  94.7  9e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  42.37 
 
 
123 aa  94.7  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  39.83 
 
 
450 aa  93.6  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  32.04 
 
 
195 aa  94  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
122 aa  94  2e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
257 aa  94  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  42.98 
 
 
119 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  40 
 
 
377 aa  92.8  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.94 
 
 
196 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2821  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.72 
 
 
224 aa  92.4  5e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.41961  normal  0.477248 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.66 
 
 
426 aa  92.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  40.87 
 
 
120 aa  92  6e-18  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1048  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.65 
 
 
191 aa  92  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192908  normal  0.77765 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  47.62 
 
 
122 aa  92.4  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  41.74 
 
 
119 aa  91.7  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>