More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2517 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
194 aa  390  1e-108  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.41 
 
 
194 aa  206  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.41 
 
 
194 aa  204  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.41 
 
 
195 aa  204  9e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  49.73 
 
 
191 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.01 
 
 
197 aa  188  4e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  48.65 
 
 
207 aa  172  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.25 
 
 
199 aa  170  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  47.8 
 
 
204 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  46.15 
 
 
206 aa  170  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.7 
 
 
200 aa  169  2e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.49 
 
 
212 aa  168  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.15 
 
 
206 aa  167  6e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  46.74 
 
 
206 aa  167  9e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.28 
 
 
229 aa  167  1e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.15 
 
 
199 aa  166  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.28 
 
 
213 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.28 
 
 
210 aa  166  2e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.51 
 
 
227 aa  164  5.9999999999999996e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  47.8 
 
 
198 aa  164  8e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.07 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.06 
 
 
194 aa  162  2.0000000000000002e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  44.39 
 
 
201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  44.02 
 
 
229 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.05 
 
 
220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.96 
 
 
229 aa  161  4.0000000000000004e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  43.16 
 
 
226 aa  161  5.0000000000000005e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.85 
 
 
201 aa  161  6e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  46.15 
 
 
205 aa  160  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.89 
 
 
247 aa  159  2e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  47.25 
 
 
214 aa  159  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  43.96 
 
 
197 aa  158  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  44.57 
 
 
205 aa  157  6e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  45.05 
 
 
199 aa  157  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.96 
 
 
220 aa  157  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  41.53 
 
 
187 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  45.16 
 
 
207 aa  155  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  43.89 
 
 
215 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.31 
 
 
210 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.9 
 
 
194 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  45.6 
 
 
207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.3 
 
 
202 aa  143  1e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  40.76 
 
 
191 aa  143  2e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  36.9 
 
 
191 aa  142  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  40.66 
 
 
189 aa  141  7e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.71 
 
 
194 aa  141  7e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.57 
 
 
196 aa  139  1.9999999999999998e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.89 
 
 
208 aa  139  3e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.13 
 
 
188 aa  137  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.44 
 
 
242 aa  137  1e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.04 
 
 
196 aa  136  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.29 
 
 
192 aa  135  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.06 
 
 
203 aa  131  5e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.91 
 
 
194 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 
205 aa  128  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 
192 aa  127  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40 
 
 
221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.26 
 
 
220 aa  125  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  33.17 
 
 
261 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  32.67 
 
 
249 aa  124  7e-28  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.96 
 
 
198 aa  123  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.42 
 
 
195 aa  123  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  32.97 
 
 
190 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  33.51 
 
 
191 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.8 
 
 
198 aa  110  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  31.89 
 
 
191 aa  102  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.52 
 
 
191 aa  100  1e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  28.72 
 
 
191 aa  99.8  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.32 
 
 
198 aa  97.1  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  36.3 
 
 
159 aa  97.8  1e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.12 
 
 
195 aa  94.7  7e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.56 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
450 aa  92.8  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  39.23 
 
 
352 aa  92  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 
218 aa  89.4  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.81 
 
 
207 aa  87.8  9e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.79 
 
 
195 aa  87.8  1e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.66 
 
 
218 aa  87.4  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  36.36 
 
 
122 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5304  response regulator receiver protein  44.54 
 
 
220 aa  86.3  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  29.51 
 
 
194 aa  86.7  2e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2830  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.91 
 
 
206 aa  87  2e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2319  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.91 
 
 
206 aa  87  2e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.781459  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1858  response regulator receiver protein  36.44 
 
 
120 aa  86.3  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  38.02 
 
 
450 aa  85.9  4e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.61 
 
 
636 aa  85.9  4e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41490  hypothetical protein  31.32 
 
 
192 aa  85.5  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  39.13 
 
 
215 aa  85.5  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  31.46 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.07 
 
 
196 aa  85.1  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.25 
 
 
218 aa  84.7  7e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.49 
 
 
196 aa  84.7  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1099  two component transcriptional regulator, LuxR family  35.9 
 
 
213 aa  84.3  0.000000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  34.62 
 
 
461 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
123 aa  84.3  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3519  hypothetical protein  30.77 
 
 
192 aa  84  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  40 
 
 
667 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2149  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.04 
 
 
208 aa  84  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>