More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5687 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  73.96 
 
 
214 aa  281  4.0000000000000003e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  71.51 
 
 
199 aa  274  9e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  71.98 
 
 
207 aa  271  7e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.33 
 
 
199 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  70.88 
 
 
212 aa  268  5.9999999999999995e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.01 
 
 
229 aa  266  1e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  68.28 
 
 
197 aa  265  2.9999999999999995e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  70.59 
 
 
204 aa  265  5e-70  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  66.84 
 
 
199 aa  263  1e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.43 
 
 
201 aa  261  4e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  67.19 
 
 
205 aa  260  8e-69  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.89 
 
 
201 aa  260  8.999999999999999e-69  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.46 
 
 
220 aa  259  2e-68  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.36 
 
 
210 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.36 
 
 
210 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.85 
 
 
210 aa  258  4e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  65.64 
 
 
206 aa  256  2e-67  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  68.82 
 
 
213 aa  255  3e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  67.03 
 
 
227 aa  256  3e-67  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  67.93 
 
 
206 aa  255  4e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  65.17 
 
 
229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.85 
 
 
220 aa  250  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  60.5 
 
 
215 aa  249  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  63.87 
 
 
207 aa  249  3e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  64.17 
 
 
247 aa  249  3e-65  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.24 
 
 
229 aa  247  1e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  63.59 
 
 
226 aa  246  2e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  63.45 
 
 
200 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.49 
 
 
200 aa  246  3e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  66.49 
 
 
205 aa  243  9.999999999999999e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  62.83 
 
 
194 aa  243  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  71.2 
 
 
207 aa  242  3e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  60.87 
 
 
206 aa  234  5.0000000000000005e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  64.48 
 
 
198 aa  234  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  59.34 
 
 
189 aa  217  1e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.68 
 
 
191 aa  212  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.59 
 
 
197 aa  212  2.9999999999999995e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.85 
 
 
194 aa  207  8e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.85 
 
 
194 aa  203  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.43 
 
 
195 aa  197  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  44.39 
 
 
249 aa  178  5.999999999999999e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  44.04 
 
 
261 aa  176  2e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  49.24 
 
 
203 aa  173  9.999999999999999e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  43.72 
 
 
191 aa  158  5e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.16 
 
 
194 aa  158  5e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.62 
 
 
221 aa  157  1e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.67 
 
 
196 aa  155  4e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.05 
 
 
196 aa  155  5.0000000000000005e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  37.63 
 
 
191 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  39.68 
 
 
192 aa  152  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.53 
 
 
202 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.98 
 
 
188 aa  151  8e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.51 
 
 
242 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.53 
 
 
194 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.31 
 
 
194 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  42.47 
 
 
220 aa  149  3e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  39.34 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.53 
 
 
194 aa  146  3e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.7 
 
 
205 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.55 
 
 
198 aa  144  9e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  37.31 
 
 
198 aa  141  7e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.22 
 
 
218 aa  138  4.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  41.4 
 
 
243 aa  137  1e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 
208 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.36 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.46 
 
 
192 aa  133  1.9999999999999998e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  45.6 
 
 
159 aa  118  7e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.84 
 
 
191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  34.41 
 
 
191 aa  114  6.9999999999999995e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.71 
 
 
198 aa  114  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.32 
 
 
190 aa  111  8.000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  34.41 
 
 
191 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  33.72 
 
 
191 aa  105  6e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.69 
 
 
195 aa  99.4  3e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  37.19 
 
 
122 aa  98.6  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  40.15 
 
 
636 aa  98.2  8e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  40.83 
 
 
352 aa  98.2  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.7 
 
 
207 aa  97.4  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  33.15 
 
 
196 aa  97.8  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.15 
 
 
195 aa  96.3  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
122 aa  94.4  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
122 aa  93.6  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  36.96 
 
 
380 aa  93.2  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  29.95 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  36.67 
 
 
122 aa  93.2  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  35.21 
 
 
461 aa  91.7  7e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  41.38 
 
 
120 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  38.6 
 
 
119 aa  90.5  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0715  response regulator receiver protein  34.71 
 
 
121 aa  90.1  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  36.75 
 
 
120 aa  90.1  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  38.02 
 
 
667 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0569  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.88 
 
 
194 aa  90.5  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000937079  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5673  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.29 
 
 
191 aa  90.5  2e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.598594 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  30.27 
 
 
194 aa  89.7  3e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1890  response regulator receiver and ANTAR domain protein  33.68 
 
 
197 aa  89.4  4e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0366782  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4139  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.26 
 
 
196 aa  89.4  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.214536 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5794  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.26 
 
 
198 aa  89  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3940  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.1 
 
 
198 aa  88.6  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.590133  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4510  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.26 
 
 
219 aa  88.6  6e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.000166869  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>