More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1497 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
380 aa  780    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  34.97 
 
 
603 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0895  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  38.1 
 
 
701 aa  156  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1311  putative PAS/PAC sensor protein  38.15 
 
 
340 aa  156  7e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.187179 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1242  multi-sensor signal transduction histidine kinase  44.26 
 
 
472 aa  154  2.9999999999999998e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.41521  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  53.33 
 
 
316 aa  147  3e-34  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3008  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.86 
 
 
953 aa  145  1e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  37.66 
 
 
461 aa  144  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2117  putative PAS/PAC sensor protein  35.77 
 
 
257 aa  144  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1360  putative PAS/PAC sensor protein  38.42 
 
 
429 aa  139  6e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00110028  hitchhiker  0.000665614 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0428  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.66 
 
 
455 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1358  putative PAS/PAC sensor protein  43.29 
 
 
404 aa  137  3.0000000000000003e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.873442  normal  0.0258422 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  50.78 
 
 
130 aa  136  6.0000000000000005e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  51.2 
 
 
359 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0439  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  39.11 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.444664 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1730  multi-sensor signal transduction histidine kinase  51.52 
 
 
591 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.319599  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  52.76 
 
 
377 aa  133  5e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0434  putative PAS/PAC sensor protein  28.75 
 
 
458 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2645  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
336 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1460  putative PAS/PAC sensor protein  36.76 
 
 
474 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.81808 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0985  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.51 
 
 
704 aa  127  3e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000494124  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2337  signal transduction histidine kinase  41.44 
 
 
352 aa  126  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0883  response regulator receiver  38.92 
 
 
273 aa  126  5e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1725  multi-sensor signal transduction histidine kinase  42.14 
 
 
499 aa  126  5e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.87 
 
 
426 aa  125  9e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0841  response regulator receiver  50.81 
 
 
135 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  42.75 
 
 
636 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  43.71 
 
 
355 aa  125  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4529  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.92 
 
 
989 aa  123  6e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2709  two component signal transduction response regulator  32.49 
 
 
429 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3510  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.67 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.269968 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3003  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
498 aa  121  1.9999999999999998e-26  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2686  putative PAS/PAC sensor protein  30.58 
 
 
337 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.209027 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3511  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.16 
 
 
384 aa  120  3e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.253652 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1557  response regulator receiver  47.33 
 
 
131 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000412225  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1912  response regulator receiver protein  43.21 
 
 
263 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.181503  normal  0.732361 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2407  response regulator receiver protein  43.75 
 
 
182 aa  120  6e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  45.6 
 
 
450 aa  119  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  46.03 
 
 
450 aa  119  9e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3448  putative transcriptional regulator  48.33 
 
 
143 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.132297  normal  0.0606491 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1114  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 
373 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3002  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
469 aa  116  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.345319  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3896  two component transcriptional regulator, LytTR family  41.18 
 
 
245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.356034 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0048  putative PAS/PAC sensor protein  36.67 
 
 
255 aa  114  3e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1235  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.66 
 
 
989 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.172784  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1007  putative GAF sensor protein  45.89 
 
 
311 aa  111  2.0000000000000002e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.164021  normal  0.860345 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1631  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.59 
 
 
561 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.608678  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1773  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  41.22 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1807  putative PAS/PAC sensor protein  32.96 
 
 
258 aa  110  5e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.254511 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0455  response regulator receiver domain-containing protein  41.35 
 
 
238 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.21261 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.17 
 
 
194 aa  108  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2510  transcriptional regulator  46.77 
 
 
157 aa  107  2e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000843612  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2639  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.87 
 
 
817 aa  107  3e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  44.44 
 
 
667 aa  107  3e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4564  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  45.24 
 
 
376 aa  107  4e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.531352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  44.63 
 
 
352 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.38 
 
 
571 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0118  putative PAS/PAC sensor protein  38.36 
 
 
265 aa  105  1e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08681  transcriptional regulator  42.15 
 
 
240 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.803849  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.12 
 
 
194 aa  104  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  38.12 
 
 
194 aa  103  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.82 
 
 
701 aa  103  5e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.711392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2212  response regulator receiver protein  43.48 
 
 
122 aa  103  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.092497  normal  0.290386 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2576  response regulator receiver domain-containing protein  45.22 
 
 
122 aa  102  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.82 
 
 
197 aa  101  2e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.1 
 
 
199 aa  102  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0573  response regulator receiver protein  37.04 
 
 
261 aa  102  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.332219 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4302  signal transduction histidine kinase  44.83 
 
 
343 aa  101  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.219335  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0616  two component transcriptional regulator  38.4 
 
 
249 aa  100  6e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.61 
 
 
194 aa  99.8  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4365  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  40.16 
 
 
471 aa  99.8  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.231326 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3671  Sigma 54 interacting domain protein  37.93 
 
 
657 aa  99.4  9e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  42.15 
 
 
197 aa  98.6  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.1 
 
 
210 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.1 
 
 
210 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.1 
 
 
210 aa  99  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.03 
 
 
214 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  42.15 
 
 
199 aa  98.2  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.93 
 
 
201 aa  98.2  2e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.67 
 
 
206 aa  97.4  3e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.38 
 
 
201 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40 
 
 
191 aa  97.4  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1517  response regulator receiver protein  43.1 
 
 
127 aa  97.1  4e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.394491  normal  0.160821 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  42.24 
 
 
205 aa  97.1  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0900  response regulator receiver protein  40.83 
 
 
126 aa  97.1  5e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000110071 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  38.17 
 
 
229 aa  97.1  5e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.38 
 
 
199 aa  96.7  7e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.24 
 
 
200 aa  96.3  8e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  42.24 
 
 
207 aa  95.9  9e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  37.88 
 
 
198 aa  95.9  9e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  37.25 
 
 
204 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.02 
 
 
200 aa  95.5  1e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.77 
 
 
229 aa  95.5  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  42.4 
 
 
206 aa  95.5  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3427  two component transcriptional regulator, LytTR family  39.67 
 
 
256 aa  95.1  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239231  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1348  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  39.1 
 
 
461 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4165  hypothetical protein  42.37 
 
 
153 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.38 
 
 
213 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0834  response regulator receiver  39.2 
 
 
134 aa  94  4e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000017528  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  36.96 
 
 
210 aa  93.2  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>