More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_0770 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
439 aa  903    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  38.29 
 
 
432 aa  286  5e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  36.81 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  33.72 
 
 
449 aa  209  6e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  30.27 
 
 
558 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 
925 aa  155  1e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  38.06 
 
 
445 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  30.18 
 
 
535 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 
821 aa  123  5e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  28.64 
 
 
707 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  27.25 
 
 
715 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.87 
 
 
559 aa  114  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  35.67 
 
 
626 aa  111  3e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  30 
 
 
490 aa  110  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  26.16 
 
 
588 aa  109  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  28.1 
 
 
605 aa  99  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  32.2 
 
 
589 aa  93.6  7e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  27.4 
 
 
468 aa  88.6  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  28.11 
 
 
423 aa  84.3  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  23.36 
 
 
479 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  32.38 
 
 
160 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  30.99 
 
 
969 aa  79  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.47 
 
 
906 aa  78.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.08 
 
 
1369 aa  75.9  0.000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  21.76 
 
 
883 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
578 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  23.62 
 
 
690 aa  71.2  0.00000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  21.88 
 
 
952 aa  69.7  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.07 
 
 
916 aa  68.9  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2771  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1557 aa  67  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.43 
 
 
1363 aa  66.6  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.31 
 
 
1101 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1938  PAS/PAC domain-containing protein  22.94 
 
 
632 aa  64.3  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  23.58 
 
 
888 aa  63.9  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.21 
 
 
737 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  24.26 
 
 
951 aa  63.5  0.000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.47 
 
 
1309 aa  62.4  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.79 
 
 
1177 aa  62.8  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  25.89 
 
 
1113 aa  62.4  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2215  putative PAS/PAC sensor protein  24.66 
 
 
637 aa  61.6  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.245996 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3993  adenylate/guanylate cyclase  28.48 
 
 
1209 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.787867  normal  0.246996 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0700  sensory box/response regulator  27.23 
 
 
637 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.2 
 
 
929 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.02 
 
 
1399 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1048  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.61 
 
 
931 aa  60.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.339388  normal  0.130033 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3265  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.9 
 
 
1106 aa  60.5  0.00000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.79 
 
 
1428 aa  60.1  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  21.05 
 
 
451 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1208  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.72 
 
 
619 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0242207  normal  0.0474084 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  23.83 
 
 
593 aa  58.5  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1918  Signal transduction histidine kinase-like protein  23.48 
 
 
878 aa  58.9  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1579  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.65 
 
 
1093 aa  58.2  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.260436  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3272  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.67 
 
 
1011 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3856  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  25 
 
 
1216 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  25.49 
 
 
596 aa  57.8  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.76 
 
 
873 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2590  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.78 
 
 
1959 aa  57.8  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0694001 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 
1059 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1353  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.7 
 
 
1078 aa  57  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0331  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.11 
 
 
608 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.53 
 
 
904 aa  56.6  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.76 
 
 
1148 aa  56.6  0.0000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1411  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.61 
 
 
673 aa  56.6  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352206  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2406  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.47 
 
 
1301 aa  56.6  0.0000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0219  sensory box protein  26.01 
 
 
703 aa  56.2  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1134 aa  56.2  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.71 
 
 
856 aa  55.8  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3789  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.56 
 
 
828 aa  56.2  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.725659  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2003  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.19 
 
 
653 aa  56.2  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.977312  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.49 
 
 
1559 aa  55.8  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0210  sensory box protein  26.01 
 
 
703 aa  55.1  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1949  sensory box protein  24.61 
 
 
654 aa  55.1  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3878  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.72 
 
 
673 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1528  hypothetical protein  26.99 
 
 
200 aa  55.8  0.000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000210266  normal  0.0656807 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  25.09 
 
 
1714 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0402  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
789 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.774871 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  28.3 
 
 
524 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.73 
 
 
999 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  23.92 
 
 
1404 aa  54.7  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
1301 aa  54.7  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60870  motility regulator  26.33 
 
 
1415 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.739569  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0472  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.14 
 
 
850 aa  54.3  0.000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.361948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0540  putative PAS/PAC sensor protein  23.98 
 
 
573 aa  54.3  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  25.12 
 
 
1741 aa  54.3  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 
1358 aa  53.9  0.000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.06 
 
 
1042 aa  53.9  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  23.35 
 
 
2361 aa  53.5  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.07 
 
 
1338 aa  53.9  0.000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4029  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and Chase sensor(s)  25.13 
 
 
1228 aa  53.5  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1083  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.97 
 
 
986 aa  53.5  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0721424  decreased coverage  0.00000190438 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
767 aa  53.5  0.000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3610  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.7 
 
 
583 aa  53.5  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.04 
 
 
1178 aa  53.5  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.17 
 
 
830 aa  53.5  0.000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1887  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.5 
 
 
1092 aa  53.5  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4425  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.97 
 
 
1143 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.88 
 
 
590 aa  53.1  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.128603 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4489  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.97 
 
 
1143 aa  53.5  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.12 
 
 
1075 aa  53.1  0.000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 
1359 aa  53.5  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>