More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_2272 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
925 aa  1908    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  25.06 
 
 
821 aa  163  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  29.32 
 
 
477 aa  160  1e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  25.68 
 
 
969 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  25.33 
 
 
558 aa  156  2e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  31.65 
 
 
1019 aa  155  4e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  30.13 
 
 
439 aa  155  4e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 
432 aa  154  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1944  signal-transducing histidine kinase  27.71 
 
 
1248 aa  151  6e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.318144  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  30.05 
 
 
449 aa  140  7.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0404  hypothetical protein  36.36 
 
 
1182 aa  135  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.465468  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.39 
 
 
844 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.82 
 
 
1032 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.15 
 
 
1080 aa  128  4.0000000000000003e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  29.62 
 
 
554 aa  127  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1335  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 
1113 aa  126  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.76 
 
 
1301 aa  124  6e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 
535 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  27.7 
 
 
445 aa  123  1.9999999999999998e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1918  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.35 
 
 
935 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 
1611 aa  121  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1349  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.97 
 
 
1578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  24.71 
 
 
588 aa  119  3e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  21.64 
 
 
707 aa  117  8.999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  26.03 
 
 
715 aa  115  3e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.69 
 
 
1325 aa  115  5e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.120961 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1818  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.78 
 
 
976 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 
1329 aa  110  1e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.17 
 
 
925 aa  110  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0047  signal transduction histidine kinase  31.34 
 
 
980 aa  108  3e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0545  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 
896 aa  108  3e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.91043  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.21 
 
 
1363 aa  106  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.83 
 
 
769 aa  106  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  29.96 
 
 
490 aa  104  6e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.69 
 
 
933 aa  104  7e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.493639  hitchhiker  0.0000319453 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  25.06 
 
 
468 aa  103  1e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26.22 
 
 
1094 aa  100  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  21.93 
 
 
883 aa  100  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
1055 aa  98.6  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  20.83 
 
 
1741 aa  98.2  7e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  23.62 
 
 
1253 aa  97.1  1e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3529  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.6 
 
 
1088 aa  97.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3150  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.74 
 
 
1309 aa  96.7  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  26.6 
 
 
909 aa  96.7  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0782  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
729 aa  96.3  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15545  normal  0.515162 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.38 
 
 
559 aa  95.1  5e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1016  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  23.1 
 
 
1258 aa  94  1e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  28.77 
 
 
690 aa  94  1e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  22.78 
 
 
589 aa  92.8  2e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11543  sensory transduction histidine kinase  21.55 
 
 
952 aa  92  5e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.166055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.69 
 
 
1069 aa  91.7  6e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1351  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
859 aa  90.9  9e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000388966 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.53 
 
 
1548 aa  90.5  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4133  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.94 
 
 
1629 aa  90.9  1e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2865  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.52 
 
 
853 aa  90.1  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4337  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.1 
 
 
1629 aa  90.1  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.571014  normal  0.322198 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0053  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.83 
 
 
968 aa  89.7  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_887  sensor histidine kinase/response regulator  23.16 
 
 
1258 aa  90.1  2e-16  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  27.03 
 
 
626 aa  89.7  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0903  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.06 
 
 
1262 aa  89  4e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  27.62 
 
 
855 aa  88.6  5e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4301  signal transduction histidine kinase  23.79 
 
 
2693 aa  88.2  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0119  PAS sensor protein  23.93 
 
 
1561 aa  88.2  6e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.82 
 
 
1111 aa  88.2  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.37 
 
 
805 aa  88.2  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.59 
 
 
830 aa  88.2  7e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.97 
 
 
1079 aa  88.2  7e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.74 
 
 
882 aa  87.4  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
1029 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.135444  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.07 
 
 
856 aa  87  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.08 
 
 
1267 aa  86.7  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0770  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.29 
 
 
911 aa  86.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.989546 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3572  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
1341 aa  85.9  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1070  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.18 
 
 
1426 aa  85.9  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.632131  normal  0.158919 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4205  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.94 
 
 
1625 aa  85.5  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  30.61 
 
 
160 aa  85.1  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 
1439 aa  85.1  0.000000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  19.22 
 
 
1061 aa  84.3  0.00000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  22.12 
 
 
1390 aa  84  0.00000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.49 
 
 
1138 aa  84.3  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1100  PAS  28.57 
 
 
576 aa  83.2  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897667  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2361  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.54 
 
 
1560 aa  83.6  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  22.56 
 
 
524 aa  83.6  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  21.54 
 
 
1379 aa  83.2  0.00000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2327  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25.97 
 
 
1158 aa  82.8  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.76 
 
 
1176 aa  82.4  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.92 
 
 
737 aa  81.6  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1666  sensory transduction histidine kinase  22.9 
 
 
945 aa  81.6  0.00000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.515191  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.54 
 
 
929 aa  81.6  0.00000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2680  sensory transduction histidine kinase  30.17 
 
 
886 aa  81.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284871  normal  0.0837353 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6212  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
999 aa  81.3  0.00000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 
883 aa  80.9  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2169  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 
1148 aa  79.7  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0672  sensory box protein  23.55 
 
 
1276 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.321974  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  23.32 
 
 
1589 aa  80.5  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2951  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.28 
 
 
1118 aa  80.5  0.0000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.38957  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1093  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.06 
 
 
1721 aa  79.7  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.29 
 
 
1369 aa  80.1  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0760  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.91 
 
 
1404 aa  80.1  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.231921  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1320  HD-GYP domain-containing protein  25.99 
 
 
471 aa  79.7  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>