More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0220 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 432 aa  886    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  38.29 
 
 		 439 aa  286  5e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  37.77 
 
 		 449 aa  245  9.999999999999999e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  43.13 
 
 		 477 aa  242  7.999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  35.04 
 
 		 558 aa  219  7e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  33.78 
 
 		 445 aa  191  2e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  34.28 
 
 		 535 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  43.11 
 
 		 821 aa  164  4.0000000000000004e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  29.79 
 
 		 707 aa  155  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  31.11 
 
 		 715 aa  154  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  31.27 
 
 		 925 aa  154  4e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  34.68 
 
 		 490 aa  135  9.999999999999999e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  37.7 
 
 		 626 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.61 
 
 		 559 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 		 588 aa  124  4e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  32.48 
 
 		 589 aa  110  4.0000000000000004e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  25.25 
 
 		 883 aa  106  8e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  23.94 
 
 		 423 aa  105  2e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  28.69 
 
 		 468 aa  99.8  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  32.62 
 
 		 160 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 690 aa  94.7  3e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  25.93 
 
 		 605 aa  94.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.77 
 
 		 1245 aa  92  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  24.05 
 
 		 969 aa  90.9  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.99 
 
 		 1177 aa  85.9  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  36 
 
 		 783 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2672  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 		 619 aa  83.6  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  29.26 
 
 		 596 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  24.8 
 
 		 479 aa  83.2  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1846  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.95 
 
 		 737 aa  82.8  0.00000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  23.23 
 
 		 1439 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 		 578 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  25.32 
 
 		 888 aa  79.7  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.9 
 
 		 916 aa  78.6  0.0000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  25.27 
 
 		 603 aa  79  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  24.23 
 
 		 451 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  23.17 
 
 		 524 aa  77.4  0.0000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1493  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.37 
 
 		 761 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 683 aa  77  0.0000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.33 
 
 		 929 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00773709  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.87 
 
 		 843 aa  75.1  0.000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.52 
 
 		 1138 aa  74.7  0.000000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  27.35 
 
 		 593 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1507  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.84 
 
 		 926 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.67 
 
 		 1134 aa  73.9  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.91 
 
 		 1338 aa  73.6  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2361  two component sensor histidine kinase  27.63 
 
 		 827 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 		 1191 aa  72.8  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.16 
 
 		 830 aa  72.8  0.00000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1120  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.26 
 
 		 805 aa  72  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.37757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 3706 aa  70.9  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5176  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  25.52 
 
 		 1404 aa  70.5  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.190634 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1796  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.92 
 
 		 871 aa  70.1  0.00000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000183002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.14 
 
 		 962 aa  69.7  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1101 aa  69.3  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  33.56 
 
 		 1079 aa  69.3  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  23.57 
 
 		 909 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1158  putative PAS/PAC sensor protein  27.8 
 
 		 753 aa  68.2  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.32 
 
 		 856 aa  68.2  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0801  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.69 
 
 		 953 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.220837  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2417  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  26.39 
 
 		 1535 aa  68.2  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.117494  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  29.6 
 
 		 420 aa  67.4  0.0000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3923  sensory box protein  33.33 
 
 		 297 aa  67.4  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03075  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with ArcA  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0497  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0537  sensory box/GGDEF family protein  28.8 
 
 		 682 aa  67  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03026  hypothetical protein  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 1032 aa  67  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3506  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.648174  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4533  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0490  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.512879 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3698  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3403  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  35.19 
 
 		 778 aa  67  0.0000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  31.67 
 
 		 424 aa  66.6  0.0000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3631  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.48 
 
 		 779 aa  66.6  0.0000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.330412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  27.31 
 
 		 1019 aa  65.9  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.02 
 
 		 1820 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.76 
 
 		 891 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.49 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.710267  hitchhiker  0.00000913845 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0232  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 		 1116 aa  65.9  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6593  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 		 906 aa  65.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.34 
 
 		 1419 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  27.03 
 
 		 1442 aa  65.5  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2379  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 1509 aa  65.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 		 1390 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3363  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 		 515 aa  64.7  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3645  aerobic respiration control sensor protein ArcB  34.86 
 
 		 777 aa  64.7  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0208563  normal  0.35837 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004463  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.2 
 
 		 784 aa  64.3  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.135915  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0551  PAS  31.72 
 
 		 1026 aa  64.3  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.425664 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1752  cAMP phosphodiesterase  23.94 
 
 		 807 aa  64.3  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.22 
 
 		 603 aa  64.3  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.651305 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00931  aerobic respiration control sensor protein ArcB  31.93 
 
 		 786 aa  64.3  0.000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 815 aa  64.3  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  25 
 
 		 799 aa  63.9  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0139008  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3549  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.29 
 
 		 982 aa  64.3  0.000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.288363 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.83 
 
 		 1081 aa  63.9  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3655  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 858 aa  63.9  0.000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 		 983 aa  63.9  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 1111 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>