More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1398 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 451 aa  925    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  57.37 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  56.75 
 
 		 593 aa  378  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  54.43 
 
 		 596 aa  364  2e-99  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  28.18 
 
 		 589 aa  103  5e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2350  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.97 
 
 		 1053 aa  103  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0867  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.69 
 
 		 905 aa  100  7e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.768776  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0005  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.86 
 
 		 1399 aa  94  5e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.7049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  23.2 
 
 		 558 aa  93.2  8e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.14 
 
 		 535 aa  92.8  1e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  22.4 
 
 		 883 aa  92.8  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  26.92 
 
 		 445 aa  88.6  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  27.88 
 
 		 490 aa  87  6e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  23.86 
 
 		 715 aa  85.9  0.000000000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1419 aa  85.1  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  23.45 
 
 		 821 aa  81.6  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.33 
 
 		 1643 aa  82.4  0.00000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1405  putative transcriptional regulator  56.45 
 
 		 146 aa  81.3  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3243  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.11 
 
 		 784 aa  78.2  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  24.23 
 
 		 432 aa  77.8  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  20.1 
 
 		 925 aa  77  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1410  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  27.11 
 
 		 1120 aa  75.1  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.132886  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1348  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 		 888 aa  75.1  0.000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  29.88 
 
 		 626 aa  74.3  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  23.81 
 
 		 423 aa  73.2  0.000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3403  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.88 
 
 		 957 aa  72.4  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2554  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.73 
 
 		 844 aa  70.5  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  30.19 
 
 		 1061 aa  68.9  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.09 
 
 		 1253 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.841858  normal  0.0475592 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2541  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.48 
 
 		 874 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  24.84 
 
 		 707 aa  68.9  0.0000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  25.47 
 
 		 1062 aa  67.8  0.0000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1405  sensor histidine kinase/response regulator  21.94 
 
 		 1379 aa  66.2  0.000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0185  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.88 
 
 		 691 aa  64.7  0.000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.483444  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0459  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.21 
 
 		 1301 aa  64.3  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.012558 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3038  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.2 
 
 		 769 aa  64.3  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0841  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.68 
 
 		 744 aa  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1481  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.55 
 
 		 1425 aa  63.9  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.56 
 
 		 883 aa  63.5  0.000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1349  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.11 
 
 		 1111 aa  63.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.444762  normal  0.501062 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  27.15 
 
 		 479 aa  63.5  0.000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1736  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.68 
 
 		 738 aa  63.2  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.42 
 
 		 1648 aa  62.8  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1943  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 596 aa  62.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.94 
 
 		 1005 aa  62.8  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.53 
 
 		 1363 aa  62  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.81 
 
 		 962 aa  62  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.5 
 
 		 1134 aa  60.8  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  22.03 
 
 		 449 aa  61.2  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  25.2 
 
 		 588 aa  61.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  22.07 
 
 		 969 aa  60.1  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3219  putative PAS/PAC sensor protein  26.74 
 
 		 793 aa  59.7  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0004  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.03 
 
 		 1039 aa  59.3  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.763661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  21.53 
 
 		 477 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.52 
 
 		 951 aa  59.3  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.275424  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0884  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.01 
 
 		 807 aa  59.3  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00331872  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  21.05 
 
 		 439 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.15 
 
 		 1055 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0052  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.7 
 
 		 1080 aa  58.2  0.0000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.07 
 
 		 1071 aa  58.2  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2569  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0776  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.55 
 
 		 1559 aa  58.2  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2461  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 575 aa  57.8  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.23 
 
 		 891 aa  57.8  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00177504  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1788  putative PAS/PAC sensor protein  29.11 
 
 		 998 aa  57.8  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  28.08 
 
 		 512 aa  57  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 		 1390 aa  57  0.0000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3022  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.24 
 
 		 1101 aa  57  0.0000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1539  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.58 
 
 		 1273 aa  56.6  0.0000009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.07 
 
 		 1338 aa  56.2  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 		 1676 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3096  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.34 
 
 		 659 aa  56.2  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0309  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  21.75 
 
 		 827 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0510078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4331  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  23.76 
 
 		 921 aa  55.8  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.153837  normal  0.0586924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3231  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.29 
 
 		 914 aa  55.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.47 
 
 		 1071 aa  55.1  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1981  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.32 
 
 		 651 aa  55.1  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1739  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.46 
 
 		 841 aa  55.1  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.165697  normal  0.509542 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2014  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  22.9 
 
 		 904 aa  54.7  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 1516 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3966  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.57 
 
 		 817 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 		 743 aa  53.9  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1136  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.03 
 
 		 608 aa  53.5  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1648  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.87 
 
 		 1176 aa  53.5  0.000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.883005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2417  adenylate/guanylate cyclase  37.33 
 
 		 1207 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.239282 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4101  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.56 
 
 		 786 aa  53.5  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  25.96 
 
 		 433 aa  53.5  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  22.84 
 
 		 653 aa  53.5  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0154  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 		 845 aa  53.5  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0810  multi-PAS sensor  29.68 
 
 		 1116 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.915221  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1033  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.29 
 
 		 1040 aa  53.5  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2266  putative PAS/PAC sensor protein  23.82 
 
 		 906 aa  52.8  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.5 
 
 		 676 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2025  two component sensor histidine kinase  28.11 
 
 		 613 aa  53.1  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3137  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.31 
 
 		 855 aa  52.8  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.045119  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1931  transcriptional regulator  25.47 
 
 		 935 aa  52.8  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1138  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.96 
 
 		 983 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3523  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  24.48 
 
 		 1079 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  25.57 
 
 		 690 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26 
 
 		 1079 aa  52  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>