More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0144 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0144  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
433 aa  872    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3275  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.19 
 
 
1094 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.393091 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  27.46 
 
 
771 aa  126  7e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2683  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.13 
 
 
505 aa  124  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0082  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.23 
 
 
946 aa  120  7e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0675  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.97 
 
 
925 aa  117  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1762  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.35 
 
 
830 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 
769 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1352  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.41 
 
 
732 aa  110  4.0000000000000004e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161755  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  22.74 
 
 
1589 aa  109  8.000000000000001e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.74 
 
 
1139 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299101 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.57 
 
 
1147 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3264  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.11 
 
 
1134 aa  103  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5968  putative PAS/PAC sensor protein  34.38 
 
 
622 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.155545 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2841  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.01 
 
 
714 aa  100  6e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0729826  normal  0.310526 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0117  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF and PAS/PAC sensor  31.16 
 
 
2361 aa  97.8  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
764 aa  97.1  6e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2804  putative PAS/PAC sensor protein  30.46 
 
 
711 aa  96.3  9e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0770283 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2505  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.63 
 
 
595 aa  95.9  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0288015  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2419  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
595 aa  95.1  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.131968  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2380  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
595 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.343005  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2659  hypothetical protein  27.56 
 
 
595 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.306767  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2653  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
595 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000377576 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2636  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
499 aa  94.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4938  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.72 
 
 
1027 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.393519 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2662  hypothetical protein  27.56 
 
 
595 aa  94  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.17167  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2456  sensor histidine kinase  27.56 
 
 
509 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.237642  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2634  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.11 
 
 
768 aa  94.4  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2805  putative PAS/PAC sensor protein  29.8 
 
 
658 aa  93.2  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.126133 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2665  sensor histidine kinase  27.17 
 
 
590 aa  93.2  8e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00650271 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2703  hypothetical protein  27.17 
 
 
595 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.894836  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0053  two component sensor histidine kinase  40.74 
 
 
867 aa  92.8  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.47 
 
 
1363 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  25.39 
 
 
653 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  31.01 
 
 
509 aa  91.3  3e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  23.17 
 
 
655 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0245  signal transduction protein containing a membrane domain an EAL and a GGDEF domain  30.65 
 
 
1076 aa  90.5  6e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.49 
 
 
886 aa  90.1  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4119  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.96 
 
 
1331 aa  89.7  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0517  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.57 
 
 
1072 aa  89.7  9e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.251594  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1087  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
1121 aa  89.4  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.740067  hitchhiker  0.00000751372 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1354  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 
1276 aa  88.6  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.530457  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2783  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25.71 
 
 
1101 aa  87.8  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0386  sensory box protein  24.34 
 
 
1247 aa  87  5e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.298787  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0096  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.48 
 
 
407 aa  87  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.758352  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0420  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  23.97 
 
 
1247 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.285216  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  24.16 
 
 
783 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0417  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.34 
 
 
1247 aa  87  6e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1158  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.45 
 
 
1047 aa  86.7  7e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.122124  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  26.25 
 
 
1390 aa  86.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0717  hypothetical protein  21.45 
 
 
1245 aa  85.9  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
969 aa  86.3  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  27.31 
 
 
653 aa  85.5  0.000000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3613  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 
1808 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.643019 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4816  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  23.97 
 
 
1247 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.201907  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
932 aa  84.7  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.4 
 
 
837 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1880  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 
612 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.139426  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01755  putative two-component member protein  35.48 
 
 
1111 aa  84  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3634  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.64 
 
 
944 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103342  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 
886 aa  82  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2656  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.57 
 
 
759 aa  82  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25.34 
 
 
1078 aa  81.6  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4352  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.52 
 
 
1166 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3452  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 
221 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.413638  normal  0.532331 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2477  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.38 
 
 
1439 aa  82  0.00000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.131363  normal  0.44536 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  24.16 
 
 
1442 aa  82  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_6017  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.23 
 
 
1044 aa  81.3  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1516 aa  81.6  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0118  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.56 
 
 
1927 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.125924 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.54 
 
 
1071 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4028  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.07 
 
 
846 aa  80.5  0.00000000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118602  normal  0.0390699 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1082  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.69 
 
 
1068 aa  80.5  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.31862 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3110  putative integral membrane sensor protein  31.5 
 
 
1141 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0940316 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  23.5 
 
 
728 aa  80.1  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  21.97 
 
 
1763 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3272  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.23 
 
 
962 aa  79.7  0.00000000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1380 aa  79.7  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1892  putative PAS/PAC sensor protein  25.86 
 
 
632 aa  79.7  0.00000000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.487702  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3542  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  35.59 
 
 
464 aa  79.3  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.743078  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.49 
 
 
1768 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4414  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.97 
 
 
1166 aa  79.7  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.107711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1640  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 
873 aa  79  0.0000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.11 
 
 
474 aa  79.3  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.07 
 
 
631 aa  79.3  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1552  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  21.75 
 
 
947 aa  78.6  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1464  sigma-54 dependent trancsriptional regulator  25.62 
 
 
1139 aa  79  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0046229 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.59 
 
 
1138 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3250  sensory transduction histidine kinase  24.08 
 
 
1019 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.145129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.71 
 
 
1432 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2789  sensory box histidine kinase  22.3 
 
 
770 aa  77  0.0000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3722  ATP-binding region, ATPase-like protein  28.65 
 
 
1120 aa  77  0.0000000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0370  putative PAS/PAC sensor protein  35.93 
 
 
509 aa  77  0.0000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2640  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 
955 aa  77  0.0000000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5112  multi-sensor signal transduction histidine kinase  23.21 
 
 
1252 aa  76.6  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.758591 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.78 
 
 
1369 aa  76.6  0.0000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1795  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.5 
 
 
1330 aa  76.6  0.0000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.173382  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3856  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  31.48 
 
 
419 aa  76.3  0.0000000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.538878  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  21.75 
 
 
1005 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2578  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  21.96 
 
 
527 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.376758  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>