More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1421 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
588 aa  1211    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.73 
 
 
559 aa  142  9.999999999999999e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5113  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  28.49 
 
 
1071 aa  141  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00592248 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  25 
 
 
432 aa  137  7.000000000000001e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  23.13 
 
 
558 aa  134  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  26.29 
 
 
445 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.02 
 
 
933 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  25.1 
 
 
925 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4549  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.71 
 
 
1060 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  26.35 
 
 
439 aa  123  8e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2021  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.34 
 
 
1516 aa  123  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  25.58 
 
 
821 aa  121  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.19 
 
 
1977 aa  118  3e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  36.77 
 
 
771 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  39.35 
 
 
3706 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.24 
 
 
1138 aa  110  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  24.6 
 
 
883 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4442  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.56 
 
 
1267 aa  109  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  26.33 
 
 
477 aa  109  2e-22  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2383  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.84 
 
 
1177 aa  107  5e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.467753 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  22.9 
 
 
715 aa  107  7e-22  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  23.49 
 
 
449 aa  106  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  24.53 
 
 
535 aa  104  4e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3579  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.49 
 
 
1432 aa  103  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.133683  normal  0.981214 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  22.9 
 
 
626 aa  100  9e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0272  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1113 aa  99.8  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0257  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1108 aa  100  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000213837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0904  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.77 
 
 
785 aa  97.4  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.66 
 
 
1078 aa  95.1  3e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.98 
 
 
1820 aa  95.1  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0366  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.91 
 
 
1081 aa  94.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0098  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.29 
 
 
1050 aa  93.2  1e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  22.94 
 
 
589 aa  90.9  6e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  21.67 
 
 
897 aa  90.5  7e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.36 
 
 
1428 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.506123  normal  0.532587 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2148  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 
770 aa  89.7  1e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0149  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.41 
 
 
957 aa  89.7  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.324886  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.57 
 
 
1202 aa  89.7  1e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 
866 aa  89  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01984  hypothetical protein  25.09 
 
 
898 aa  88.2  3e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.931378  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.73 
 
 
1002 aa  88.2  4e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.48 
 
 
1207 aa  88.2  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1053  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.6 
 
 
1059 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111783  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3151  putative PAS/PAC sensor protein  26.78 
 
 
1589 aa  87.4  6e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.274524  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
1758 aa  87  9e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4639  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  25.36 
 
 
1453 aa  87  9e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.432269  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  25.85 
 
 
490 aa  86.7  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6160  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  22.67 
 
 
1007 aa  86.3  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2137  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.27 
 
 
1260 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2184  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  25 
 
 
832 aa  85.1  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.425647  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  22.91 
 
 
1785 aa  85.1  0.000000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2979  PAS sensor, serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit  25.32 
 
 
754 aa  85.1  0.000000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1560  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.87 
 
 
1017 aa  84.3  0.000000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3037  hypothetical protein  26.22 
 
 
1289 aa  84.3  0.000000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.203236  normal  0.672387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.27 
 
 
1965 aa  84.3  0.000000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2494  signal transduction histidine kinase-like protein  24.76 
 
 
1317 aa  84  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.206751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2895  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.38 
 
 
705 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25.46 
 
 
1291 aa  84  0.000000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  26.56 
 
 
1714 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2079  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.49 
 
 
1260 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.8885299999999995e-20 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.04 
 
 
893 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4377  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.86 
 
 
636 aa  83.6  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  24.17 
 
 
1390 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.19 
 
 
708 aa  82  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  20.78 
 
 
479 aa  81.3  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  26.32 
 
 
1369 aa  81.3  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1683  sensory box protein  26.84 
 
 
853 aa  80.1  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  22.22 
 
 
1000 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4783  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.71 
 
 
680 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.302794  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3336  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.11 
 
 
1065 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.115718  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.45 
 
 
896 aa  80.1  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0093  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.11 
 
 
856 aa  80.1  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4267  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.21 
 
 
1076 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.715458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1673  sensory box protein  23.59 
 
 
1346 aa  79.3  0.0000000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.338574  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  20.75 
 
 
1391 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0030  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.96 
 
 
833 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1659  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  27.96 
 
 
833 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0467119  normal  0.0611646 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3905  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.24 
 
 
893 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.801054  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1513  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  26 
 
 
1075 aa  79  0.0000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.533351  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  21.93 
 
 
707 aa  78.6  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2351  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.58 
 
 
991 aa  78.6  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.248597  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3792  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.24 
 
 
893 aa  79  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.226695 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1559  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
508 aa  78.2  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0906975 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  29.49 
 
 
1041 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
1016 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0235  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.1 
 
 
941 aa  78.2  0.0000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2740  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.7 
 
 
943 aa  77.8  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  22.88 
 
 
872 aa  77.8  0.0000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3924  sensory box protein  24.83 
 
 
1086 aa  77.4  0.0000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 
1002 aa  77.8  0.0000000000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1668  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.52 
 
 
1051 aa  77.4  0.0000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2943  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.3 
 
 
981 aa  77.8  0.0000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1150  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.42 
 
 
1466 aa  77.4  0.0000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.765492  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0157  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.49 
 
 
1329 aa  77.4  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0802  PAS sensor protein  23.72 
 
 
1065 aa  77  0.0000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0295  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 
655 aa  77  0.0000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0762  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  24.51 
 
 
689 aa  77  0.0000000000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3132  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.31 
 
 
743 aa  76.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.583735  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0851  signal transduction histidine kinase  33.6 
 
 
1124 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.596817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2611  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.18 
 
 
1134 aa  76.6  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.413442  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>