30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1071 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  331  3e-90  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  40.13 
 
 		 626 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  39.22 
 
 		 445 aa  120  5e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  34.18 
 
 		 558 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  36.52 
 
 		 715 aa  102  3e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  32.62 
 
 		 432 aa  97.4  7e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  31.94 
 
 		 535 aa  96.3  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 449 aa  92.4  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  40.74 
 
 		 707 aa  92.8  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  35.29 
 
 		 477 aa  88.2  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  30.61 
 
 		 925 aa  85.1  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 		 559 aa  85.5  3e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  32.38 
 
 		 439 aa  80.9  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  33.33 
 
 		 821 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  37.04 
 
 		 490 aa  73.9  0.0000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  26.21 
 
 		 589 aa  72  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1528  hypothetical protein  32.14 
 
 		 200 aa  63.9  0.0000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000210266  normal  0.0656807 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  28.93 
 
 		 690 aa  62.4  0.000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  28.87 
 
 		 588 aa  63.2  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  27.72 
 
 		 423 aa  60.8  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  28.26 
 
 		 468 aa  61.2  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  27.2 
 
 		 969 aa  59.3  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  34.21 
 
 		 479 aa  57.8  0.00000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  30.48 
 
 		 593 aa  56.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  32.5 
 
 		 605 aa  55.1  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  29.35 
 
 		 883 aa  53.1  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.4 
 
 		 524 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1398  putative PAS/PAC sensor protein  26.67 
 
 		 451 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  21.9 
 
 		 596 aa  46.2  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2035  putative PAS/PAC sensor protein  23.33 
 
 		 468 aa  40.4  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>