46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2035 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2035  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 		 468 aa  961    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  36.24 
 
 		 524 aa  86.7  7e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2462  PAS:GGDEF  22.08 
 
 		 489 aa  67  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  21.97 
 
 		 1267 aa  66.6  0.0000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4938  diguanylate cyclase  26.98 
 
 		 492 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.262265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0253  putative PAS/PAC sensor protein  29.41 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1745  diguanylate cyclase  25.4 
 
 		 495 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0113833  normal  0.32782 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  24.38 
 
 		 715 aa  60.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0867  diguanylate cyclase  24.85 
 
 		 492 aa  60.1  0.00000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  22.62 
 
 		 445 aa  58.9  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1965 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3313  diguanylate cyclase  23.75 
 
 		 481 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64418  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  25.88 
 
 		 883 aa  58.2  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2471  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  23.08 
 
 		 1677 aa  58.2  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.785659  normal  0.992917 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1895  diguanylate cyclase  19.07 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175233  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1857  diguanylate cyclase  19.64 
 
 		 490 aa  57  0.0000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5335  diguanylate cyclase  24.14 
 
 		 489 aa  56.6  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  22.84 
 
 		 535 aa  55.5  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  23.75 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3602  diguanylate cyclase  23.03 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.921669 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4679  diguanylate cyclase  23.03 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.882516  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6017  diguanylate cyclase  23.81 
 
 		 487 aa  54.7  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3344  PAS sensor diguanylate cyclase  23 
 
 		 490 aa  53.5  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  24.68 
 
 		 490 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3660  hypothetical protein  22.04 
 
 		 491 aa  53.1  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.165778 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1244  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.74 
 
 		 813 aa  52  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2995  diguanylate cyclase  22.5 
 
 		 490 aa  52  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2903  putative PAS/PAC sensor protein  23.03 
 
 		 400 aa  52  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.097748  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.91 
 
 		 559 aa  51.2  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  25.45 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1417  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.96 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0587691  normal  0.569805 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5571  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.33 
 
 		 540 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.982003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  21.6 
 
 		 589 aa  47.8  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1631  diguanylate cyclase  22.64 
 
 		 509 aa  47.4  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646113  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1792  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.32 
 
 		 984 aa  47.4  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  36.36 
 
 		 477 aa  47  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  19.1 
 
 		 666 aa  47  0.0008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  20.71 
 
 		 626 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.23 
 
 		 1758 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.669381 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  22.78 
 
 		 955 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  24.85 
 
 		 821 aa  45.1  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1415  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 2072 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384608  normal  0.53452 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  20 
 
 		 769 aa  44.7  0.004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0849788  normal  0.753623 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  22.29 
 
 		 707 aa  43.9  0.006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1663  sensor for ctr capsule biosynthesis, histidine kinase acting on RcsB  28.14 
 
 		 1093 aa  43.5  0.008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.749752  normal  0.503363 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4635  histidine kinase  46.81 
 
 		 440 aa  43.5  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.94647  normal  0.951565 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>