More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_1895 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_1895  diguanylate cyclase  100 
 
 
515 aa  1058    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.175233  normal  0.282875 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5335  diguanylate cyclase  70.42 
 
 
489 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6017  diguanylate cyclase  65.57 
 
 
487 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.817208  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1857  diguanylate cyclase  60 
 
 
490 aa  588  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1745  diguanylate cyclase  59.2 
 
 
495 aa  585  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0113833  normal  0.32782 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4938  diguanylate cyclase  59.08 
 
 
492 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0911189  normal  0.262265 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2462  PAS:GGDEF  57.91 
 
 
489 aa  577  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0867  diguanylate cyclase  58.59 
 
 
492 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4679  diguanylate cyclase  55.69 
 
 
490 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.882516  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3602  diguanylate cyclase  55.69 
 
 
490 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.926489  normal  0.921669 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3313  diguanylate cyclase  52.41 
 
 
481 aa  526  1e-148  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.64418  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3660  hypothetical protein  51.05 
 
 
491 aa  495  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.165778 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_2995  diguanylate cyclase  51.39 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.894435  normal  0.267254 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3344  PAS sensor diguanylate cyclase  51.39 
 
 
490 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1631  diguanylate cyclase  36.31 
 
 
509 aa  262  8.999999999999999e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646113  normal  0.429495 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0493  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.34 
 
 
431 aa  148  3e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000431095 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0689  putative PAS/PAC sensor protein  27.79 
 
 
836 aa  146  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000235898 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0476  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  47.34 
 
 
431 aa  144  3e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1656  sensory box/response regulator  44.58 
 
 
420 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1146  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.23 
 
 
909 aa  134  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3459  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.94 
 
 
503 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2187  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  32.01 
 
 
593 aa  133  7.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.1316 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1917  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  40.7 
 
 
419 aa  133  9e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0589316 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0417  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.2 
 
 
853 aa  130  6e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2332  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  35.34 
 
 
960 aa  129  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0823  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  40.57 
 
 
755 aa  128  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1892  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  41.61 
 
 
771 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4005  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.73 
 
 
438 aa  126  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000169909  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2483  putative PAS/PAC sensor protein  39.41 
 
 
619 aa  125  3e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0783  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.91 
 
 
483 aa  123  7e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00290712 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0538  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.33 
 
 
860 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.883741  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0771  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  42.33 
 
 
880 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4265  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  29.77 
 
 
539 aa  122  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3210  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.76 
 
 
425 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.141244  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0429  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.84 
 
 
431 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.320682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0210  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  39.76 
 
 
465 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.74546  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2203  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.56 
 
 
434 aa  118  3e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2051  diguanylate cyclase  37.5 
 
 
307 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2110  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  34.91 
 
 
814 aa  117  3.9999999999999997e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.406671  normal  0.904687 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1552  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.76 
 
 
971 aa  114  4.0000000000000004e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0011  putative PAS/PAC sensor protein  36.84 
 
 
526 aa  114  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.140902  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0138  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.64 
 
 
1338 aa  114  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2408  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  38.18 
 
 
623 aa  113  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.92 
 
 
302 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3953  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.87 
 
 
474 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000778513 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0327  diguanylate cyclase  39.16 
 
 
295 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3629  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.25 
 
 
850 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.739626 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1469  HD-GYP domain-containing protein  33.51 
 
 
803 aa  110  6e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2443  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 
912 aa  110  7.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1593  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  37.99 
 
 
706 aa  110  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1899  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.8 
 
 
616 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.764058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3356  GGDEF domain/HAMP domain-containing protein  38.71 
 
 
533 aa  108  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.204674  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2307  mase1 domain family  32.68 
 
 
998 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1211  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  40.78 
 
 
587 aa  108  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0242812 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0383  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  26.09 
 
 
746 aa  108  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1840  metal dependent phosphohydrolase  31.75 
 
 
540 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5615  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.8 
 
 
1059 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.635734  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0966  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  34.86 
 
 
1059 aa  107  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.216873 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2358  mase1 domain family  32.2 
 
 
998 aa  107  6e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.922212 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1231  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  32.24 
 
 
613 aa  107  6e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2251  PAS domain protein  32.2 
 
 
998 aa  107  7e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0780  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.65 
 
 
520 aa  107  7e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0195559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.01 
 
 
1965 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2450  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  26.11 
 
 
617 aa  105  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2351  mase1 domain family protein  31.71 
 
 
998 aa  105  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.659224  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3822  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  35.67 
 
 
786 aa  104  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3125  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.36 
 
 
823 aa  105  3e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.655002 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2636  diguanylate cyclase  35.8 
 
 
220 aa  105  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128146  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  35.39 
 
 
578 aa  104  4e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5944  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.74 
 
 
745 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.120992 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2161  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  36.78 
 
 
818 aa  103  5e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.376785  normal  0.0371729 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3263  GGDEF domain-containing protein  37.36 
 
 
823 aa  103  6e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.505272  normal  0.0188665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1923  diguanylate cyclase  39.39 
 
 
356 aa  103  6e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0213654 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01973  predicted diguanylate cyclase, GGDEF domain signalling protein  33.33 
 
 
1105 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01962  hypothetical protein  33.33 
 
 
1105 aa  103  7e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2360  putative sensor protein  33.33 
 
 
1105 aa  103  7e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5652  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.68 
 
 
1061 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0071  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.89 
 
 
697 aa  103  8e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1590  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  33.33 
 
 
1105 aa  103  9e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.131154  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1574  putative sensor protein  33.33 
 
 
1105 aa  103  9e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115387  normal  0.924629 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0993  putative sensor protein  33.33 
 
 
1105 aa  103  9e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.7374 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6173  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.03 
 
 
837 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1323  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  30.61 
 
 
441 aa  103  1e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1197  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.25 
 
 
457 aa  102  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1165  putative sensor protein  33.33 
 
 
1105 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.807956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1475  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  33.13 
 
 
471 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05794  hypothetical protein  27.3 
 
 
652 aa  102  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3854  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  31.49 
 
 
516 aa  101  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.353141  normal  0.927825 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2269  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  31.84 
 
 
659 aa  101  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2067  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.42 
 
 
317 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2681  putative sensor protein  29.89 
 
 
1117 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.968854 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3890  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.86 
 
 
824 aa  101  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2041  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.42 
 
 
317 aa  101  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0859  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  37.8 
 
 
809 aa  100  5e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2442  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  37.77 
 
 
348 aa  100  5e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2883  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  28.06 
 
 
849 aa  100  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.483333  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0442  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC and GAF sensor(s)  37.38 
 
 
1785 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1770  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  32.18 
 
 
769 aa  100  6e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0395066  normal  0.809527 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0581  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  27.2 
 
 
659 aa  100  8e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0169  diguanylate cyclase and metal dependent phosphohydrolase  37.06 
 
 
681 aa  100  9e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>