29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1528 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1528  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000210266  normal  0.0656807 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2466  putative PAS/PAC sensor protein  29.35 
 
 		 558 aa  84  0.000000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0201  iron dependent repressor  31.95 
 
 		 715 aa  75.5  0.0000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.132112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0333  putative PAS/PAC sensor protein  30.06 
 
 		 477 aa  74.3  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.522963  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0984  putative PAS/PAC sensor protein  28 
 
 		 445 aa  70.1  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0111157  normal  0.198492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1057  putative PAS/PAC sensor protein  38.53 
 
 		 449 aa  70.5  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0334247  normal  0.158346 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1776  signal transduction histidine kinase  28.22 
 
 		 535 aa  68.2  0.00000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0782  putative PAS/PAC sensor protein  32.16 
 
 		 468 aa  68.2  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.102287  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1101  putative PAS/PAC sensor protein  27.33 
 
 		 690 aa  65.5  0.0000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.770779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2875  putative PAS/PAC sensor protein  27.75 
 
 		 707 aa  64.7  0.0000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1250  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.01 
 
 		 559 aa  63.9  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1071  hypothetical protein  32.14 
 
 		 160 aa  63.9  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0728316  normal  0.146966 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0220  putative PAS/PAC sensor protein  29.81 
 
 		 432 aa  63.9  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2475  putative PAS/PAC sensor protein  33.94 
 
 		 626 aa  63.5  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.732483  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1706  putative PAS/PAC sensor protein  28.66 
 
 		 605 aa  62  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2430  putative PAS/PAC sensor protein  30.16 
 
 		 821 aa  60.5  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0770  putative PAS/PAC sensor protein  26.99 
 
 		 439 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0798004  normal  0.2382 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0011  putative PAS/PAC sensor protein  27.13 
 
 		 969 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.161167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2741  putative PAS/PAC sensor protein  25.42 
 
 		 490 aa  55.5  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1722  putative PAS/PAC sensor protein  27.61 
 
 		 479 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2997  putative PAS/PAC sensor protein  29.91 
 
 		 423 aa  52.8  0.000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2016  putative PAS/PAC sensor protein  30.43 
 
 		 589 aa  52  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.115165 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2750  putative PAS/PAC sensor protein  35 
 
 		 883 aa  48.5  0.00006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2764  putative PAS/PAC sensor protein  30.56 
 
 		 593 aa  47.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.359165  normal  0.516163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1421  putative PAS/PAC sensor protein  31.88 
 
 		 588 aa  46.6  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0454368  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2272  putative PAS/PAC sensor protein  26.97 
 
 		 925 aa  44.7  0.0008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0456  helix-turn-helix, type 11 domain-containing protein  32.08 
 
 		 125 aa  44.3  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2038  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  26.92 
 
 		 524 aa  42.4  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.032498  normal  0.0495143 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1412  putative PAS/PAC sensor protein  27.1 
 
 		 596 aa  41.6  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.144483  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>