115 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_4665 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_4664  putative sensor with HAMP domain protein  79.66 
 
 		 491 aa  779    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0372339  normal  0.32325 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4665  putative sensor with HAMP domain protein  100 
 
 		 482 aa  992    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.182989  normal  0.631474 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0661  adenylate/guanylate cyclase  28.57 
 
 		 1133 aa  178  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0662  adenylate/guanylate cyclase  31.23 
 
 		 1130 aa  168  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2148  Cache sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 		 937 aa  165  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5087  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 		 1058 aa  161  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3412  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 		 1207 aa  161  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3493  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with extracellular sensor  29.67 
 
 		 872 aa  155  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3536  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 		 967 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2570  putative PAS/PAC sensor protein  28.41 
 
 		 967 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  26.13 
 
 		 674 aa  144  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2729  adenylate/guanylate cyclase  27.9 
 
 		 1119 aa  140  4.999999999999999e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0163544 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1287  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.6 
 
 		 935 aa  138  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0339259  normal  0.305866 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0452  HAMP domain-containing protein  26.63 
 
 		 489 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.268671  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2801  protein serine/threonine phosphatase  27.25 
 
 		 705 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.079945 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2807  putative PAS/PAC sensor protein  27.4 
 
 		 730 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.135813 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4137  signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 912 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 		 790 aa  127  6e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0131  Cache domain protein  29.33 
 
 		 354 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  24.32 
 
 		 1078 aa  117  5e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1628  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27 
 
 		 1026 aa  114  4.0000000000000004e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.677715  normal  0.19967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  27.38 
 
 		 913 aa  113  7.000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2671  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 		 608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3445  putative PAS/PAC sensor protein  31.05 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  24.12 
 
 		 945 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4666  putative PAS/PAC sensor protein  23.8 
 
 		 608 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.169254  normal  0.69923 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  23.11 
 
 		 816 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 1051 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1747  putative sensor with HAMP domain  23.44 
 
 		 467 aa  92.4  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4286  putative sensor with HAMP domain protein  35.58 
 
 		 454 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1137  histidine kinase, HAMP region  37.4 
 
 		 458 aa  87.8  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3657  putative sensor with HAMP domain protein  35.71 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1258  sensor protein  38.14 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0619  methyl-accepting chemotaxis protein  25.93 
 
 		 696 aa  71.6  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00139031  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1815  response regulator receiver domain-containing protein  38.26 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.800608  normal  0.49797 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3806  hypothetical protein  41.98 
 
 		 163 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3757  hypothetical protein  41.98 
 
 		 163 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.56 
 
 		 1130 aa  68.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.454643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00583  cyclic diguanylate phosphodiesterase  23.23 
 
 		 848 aa  65.1  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2800  putative sensor with HAMP domain protein  49.21 
 
 		 371 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0999492 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  25.52 
 
 		 701 aa  62.8  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2802  adenylate/guanylate cyclase  23.86 
 
 		 702 aa  61.6  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.523853  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  25.62 
 
 		 701 aa  60.1  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2567  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.47 
 
 		 768 aa  60.1  0.00000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0479714  hitchhiker  0.00000000485501 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0594  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.77 
 
 		 880 aa  60.1  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.333457  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0749  response regulator receiver protein  52.22 
 
 		 406 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.893418  normal  0.0890519 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1046  adenylate/guanylate cyclase  28.45 
 
 		 726 aa  57  0.0000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000197957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1645  multi-sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 906 aa  57  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.884619  normal  0.02986 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001909  GGDEF family protein  21.4 
 
 		 848 aa  57  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2322  GGDEF family protein  26.15 
 
 		 849 aa  56.2  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1799  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  22.9 
 
 		 668 aa  54.7  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.481177  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3824  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  25.93 
 
 		 877 aa  54.3  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.668765  normal  0.248455 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3100  chemotaxis sensory transducer  21.45 
 
 		 652 aa  53.9  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.594551  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  26.64 
 
 		 621 aa  53.5  0.000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0173  methyl-accepting chemotaxis protein  26.39 
 
 		 639 aa  52.4  0.00002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1308  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 894 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.455977  normal  0.863404 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 875 aa  51.6  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0523  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.81 
 
 		 608 aa  52  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00119  methyl-accepting chemotaxis protein  31.65 
 
 		 626 aa  50.8  0.00005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2196  methyl-accepting chemotaxis protein  20.41 
 
 		 604 aa  50.8  0.00005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3030  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.85 
 
 		 832 aa  50.8  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00284544  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0799  methyl-accepting chemotaxis protein  31.96 
 
 		 624 aa  50.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1856  acyl-CoA hydrolase  25.13 
 
 		 654 aa  50.4  0.00007  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0643  stage II sporulation E family protein  21.52 
 
 		 708 aa  50.1  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.948489 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  35.63 
 
 		 633 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2856  protein serine/threonine phosphatase  23.42 
 
 		 705 aa  50.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1383  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.98 
 
 		 636 aa  48.9  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00353653  normal  0.775857 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0536  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  23.42 
 
 		 609 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1814  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  32.08 
 
 		 242 aa  48.1  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.38579  normal  0.245711 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2453  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.08 
 
 		 788 aa  48.5  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.925334  normal  0.122382 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2249  methyl-accepting chemotaxis transducer  26.14 
 
 		 643 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.477129  normal  0.786945 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  21.83 
 
 		 678 aa  47.8  0.0004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4739  methyl-accepting chemotaxis protein  24.1 
 
 		 666 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3234  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.71 
 
 		 678 aa  47  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0897525  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  23.64 
 
 		 629 aa  47  0.0009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3398  adenylate/guanylate cyclase  33.68 
 
 		 662 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.71233  normal  0.441033 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3876  hypothetical protein  23.21 
 
 		 973 aa  46.6  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3489  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 628 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.228387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  26.12 
 
 		 628 aa  46.2  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0988  methyl-accepting chemotaxis protein  23.25 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0178  methyl-accepting chemotaxis protein  24.91 
 
 		 696 aa  45.4  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000210736  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0906  histidine kinase, HAMP region:Cache: chemotaxis sensory transducer  30 
 
 		 626 aa  45.8  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2060  Serine phosphatase RsbU regulator of sigma subunit-like protein  22.8 
 
 		 678 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1527  serine phosphatase  21.69 
 
 		 645 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1901  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 		 962 aa  45.1  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0333053  hitchhiker  0.00824164 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1181  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  36.78 
 
 		 621 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00022904  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3477  putative methyl-accepting chemotaxis protein  30.53 
 
 		 622 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000522984 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0347  methyl-accepting chemotaxis protein DmcA  30.43 
 
 		 729 aa  44.3  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4724  methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 		 666 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2105  putative metal dependent phosphohydrolase  24.82 
 
 		 938 aa  44.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01884  hypothetical protein  31.17 
 
 		 627 aa  44.3  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1273  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  23.5 
 
 		 609 aa  44.7  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.258977  normal  0.0501221 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4882  methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 		 666 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5256  methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 		 666 aa  44.3  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0594583  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  32.58 
 
 		 629 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1933  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.23 
 
 		 741 aa  44.3  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.820438  normal  0.142567 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2543  adenylate/guanylate cyclase  23.55 
 
 		 712 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000118563  normal  0.086844 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4580  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  21.62 
 
 		 648 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0108713 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0088  methyl-accepting chemotaxis protein  24.27 
 
 		 666 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5124  methyl-accepting chemotaxis protein  23.78 
 
 		 669 aa  44.3  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>